隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及，相比Sanger測(cè)序，以降低測(cè)序讀長(zhǎng)的前提，極大增加的測(cè)序通量同時(shí)大幅降低測(cè)序成本。利用二代測(cè)序進(jìn)行SNP分型，不僅測(cè)序讀長(zhǎng)滿足分型需求，可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn)，上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測(cè)序法，除了保留測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)外，彌補(bǔ)了其...

為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點(diǎn)，作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個(gè)基因，64個(gè)個(gè)體（32個(gè)高糖原個(gè)體和32個(gè)低糖原個(gè)體）進(jìn)行重測(cè)序，，后得到732個(gè)高質(zhì)量SNP。其中32個(gè)位于Cg_GD2基因，256個(gè)位于Cg_GS基因，用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩...

SNP全稱SingleNucleotidePolymorphism，即單核苷酸多態(tài)性，是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異，包括轉(zhuǎn)換，顛換，插入和缺失，形成的遺傳標(biāo)記，其數(shù)量很多，多態(tài)性豐富，有些SNP位點(diǎn)直接影響基因功能，從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP是研究人類家族...

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗(yàn)的專業(yè)遺傳學(xué)服務(wù)供應(yīng)商。公司的首席科學(xué)家為肖君華教授（東華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)研究所教授；中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)理事；上海市遺傳學(xué)會(huì)常務(wù)理事）。公司擁有兩大專業(yè)平臺(tái)：基于一代測(cè)序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺(tái)...

相信對(duì)研究遺傳學(xué)及相關(guān)方向的老濕和童鞋來(lái)說，SNP肯定是，不陌生的名詞，它是人類可遺傳的變異中，常見的一種。大量存在的SNP位點(diǎn)，使人們有機(jī)會(huì)發(fā)現(xiàn)與各種疾病相關(guān)的基因組突變。小明：濕兄，濕兄！老濕讓我找SNP位點(diǎn)，要怎么找呀？濕兄：淡定！說清楚問題~小明：我的...

相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法，如片段長(zhǎng)度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法，直接測(cè)序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測(cè)反應(yīng)法，競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測(cè)序法等，小E就針對(duì)以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和...

片段長(zhǎng)度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法——RFLP（RestrictionFragmentLengthPolymorphism）法的基本原理是通過PCR擴(kuò)增目的片段DNA，擴(kuò)增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段，直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性...

高分辨率熔解（High-resolutionmelting，簡(jiǎn)稱HRM）分析是一門新興的技術(shù)。它通過PCR之后的熔解曲線分析，就能檢測(cè)PCR片段的微小序列差異，從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對(duì)和基因分型等多個(gè)方面。憑借其速度和簡(jiǎn)便性，高分辨率熔解這種方法正在迅速普...

理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性，但實(shí)際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。因此，通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（CT，在其互補(bǔ)鏈上則為GA），也可能是顛換（CA，GT，CG，AT）。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯...

將待檢測(cè)片段（包含待測(cè)SNP位點(diǎn)）進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中，準(zhǔn)確的一種，堪稱SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖，純和位點(diǎn)為單峰，而雜合位點(diǎn)則為套峰，因此通過查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開來(lái)。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè)，還可用...

4.MassArray法MassARRAY分子量陣列技術(shù)是Sequenom公司推出的世界上靠前的基因分析工具，通過引物延伸或切割反應(yīng)與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術(shù)相結(jié)合，實(shí)現(xiàn)基因分型檢測(cè)?；贛assARRAY平臺(tái)的iPLEXGOLD技術(shù)可以設(shè)計(jì)，...

目前市場(chǎng)上有多個(gè)廠家提供HRM分析的儀器，包括IdahoTechnology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是HRM的儀器，有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國(guó)猶他大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Wittwer實(shí)驗(yàn)室曾評(píng)估了市場(chǎng)上多臺(tái)儀器...

相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法，如片段長(zhǎng)度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法，直接測(cè)序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測(cè)反應(yīng)法，競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測(cè)序法等，小E就針對(duì)以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和...

上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模，提供兩種檢測(cè)平臺(tái)，分別為：適合中低通量檢測(cè)的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù)：PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連...

我們利用多重PCR+二代測(cè)序技術(shù)為各專業(yè)用戶提供大規(guī)模的SNP分型，目標(biāo)區(qū)段的重測(cè)序，目標(biāo)區(qū)段甲基化測(cè)序。我們服務(wù)過的高質(zhì)量客戶包括：復(fù)旦大學(xué)金力院士團(tuán)隊(duì)、上海交通大學(xué)賀林院士團(tuán)隊(duì)和中科院韓斌院士團(tuán)隊(duì)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總公司（地址）：上海市松江區(qū)龍...

理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性，但實(shí)際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。因此，通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（CT，在其互補(bǔ)鏈上則為GA），也可能是顛換（CA，GT，CG，AT）。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯...

以上就是小E對(duì)幾種SNP分型技術(shù)的簡(jiǎn)單介紹，大家可以看出分型技術(shù)多種多樣，各有各的優(yōu)點(diǎn)和限制。大家需要綜合考慮實(shí)驗(yàn)的各方面情況，如實(shí)驗(yàn)規(guī)模（多少位點(diǎn)，多少樣本），實(shí)驗(yàn)周期，實(shí)驗(yàn)預(yù)算等，然后選擇一個(gè)適合自己實(shí)驗(yàn)的分型技術(shù)。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，...

TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針，熒光基團(tuán)連接在探針的5’末端，而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應(yīng)體系中加入2種不同熒光標(biāo)記的探針，它們可以分別與2個(gè)等位基因完全配對(duì)。正常情況下，由于探針5’端熒光基團(tuán)和3’端淬滅基團(tuán)緊鄰在一起，熒光被淬滅。隨著PCR有...

高分辨率熔解（High-resolutionmelting，簡(jiǎn)稱HRM）分析是一門新興的技術(shù)。它通過PCR之后的熔解曲線分析，就能檢測(cè)PCR片段的微小序列差異，從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對(duì)和基因分型等多個(gè)方面。憑借其速度和簡(jiǎn)便性，高分辨率熔解這種方法正在迅速普...

DNA甲基化可以抑制基因表達(dá)。其機(jī)制是當(dāng)DNA甲基化出現(xiàn)在啟動(dòng)子區(qū)，其會(huì)強(qiáng)化啟動(dòng)子序列的異染色質(zhì)化（染色體擰巴在一起），而使轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物無(wú)法接近和結(jié)合，從而強(qiáng)化基因的轉(zhuǎn)錄抑制。只有保持開放性常染色質(zhì)狀態(tài)的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，才能保證轉(zhuǎn)錄起始蛋白復(fù)合物可接近并結(jié)合這...

Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后，在IonProton/IonTorrent平臺(tái)上，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方...

WGBS能為基因組DNA甲基化時(shí)空特異性修飾的研究提供重要技術(shù)支持，能廣泛應(yīng)用在個(gè)體發(fā)育、衰老和疾病等生命過程的機(jī)制研究中，也是各物種甲基化圖譜研究的優(yōu)先方法。常規(guī)全基因組甲基化測(cè)序技術(shù)通過T4-DNA連接酶，在超聲波打斷基因組DNA段的兩端連接接頭序列，連接...

相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法，如片段長(zhǎng)度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法，直接測(cè)序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測(cè)反應(yīng)法，競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測(cè)序法等，小E就針對(duì)以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和...

單核苷酸多態(tài)性（singlenucleotidepolymorphism，SNP），主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中，常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在，平均每50...

SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段，主要特點(diǎn)是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大，主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段，然后通過序列特異性引物實(shí)現(xiàn)單堿基延伸，隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時(shí)納秒(...

TaqMan熒光探針法優(yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)單，準(zhǔn)確性高（閉管進(jìn)行，減少污染），判讀也很方便，認(rèn)可度高；適合多樣本，少位點(diǎn)。但是其也有不可忽視的限制性，如探針合成耗時(shí)較長(zhǎng)，價(jià)格昂貴，為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量，一般大家會(huì)選擇A公司合成。TaqMan熒光探針法一般為只有幾個(gè)位...

3、SNP等位基因頻率的容易估計(jì)。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標(biāo)準(zhǔn)曲線，然后將待測(cè)的混和樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比較，根據(jù)所得信號(hào)的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性，也...

SNP（單核苷酸多態(tài)性）是遺傳學(xué)研究是不可缺少的一部分，上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司作為一家專門從事遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)的公司，SNP基因分型也是日常項(xiàng)目中經(jīng)常碰到的對(duì)象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多，各有各的特點(diǎn)和適用性，這讓很多剛開始接觸SNP分型的人們難...

在擁有飽和染料和高分辨率儀器之后，HRM分析就可以開始啦。這個(gè)過程其實(shí)很簡(jiǎn)單，就是對(duì)PCR的擴(kuò)增子進(jìn)行加熱，溫度從50°C逐漸上升到95°C。在此過程中，擴(kuò)增子逐漸解鏈，在到達(dá)熔解溫度（Tm）時(shí)，DNA鏈完全分開。在HRM分析的初期，熒光強(qiáng)度很高，隨著溫度升高...

TaqMan熒光探針法優(yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)單，準(zhǔn)確性高（閉管進(jìn)行，減少污染），判讀也很方便，認(rèn)可度高；適合多樣本，少位點(diǎn)。但是其也有不可忽視的限制性，如探針合成耗時(shí)較長(zhǎng)，價(jià)格昂貴，為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量，一般大家會(huì)選擇A公司合成。TaqMan熒光探針法一般為只有幾個(gè)位...