在一切由細(xì)胞身份開始說起一文中，小E已經(jīng)為大家羅列出目前已經(jīng)確定被Hela細(xì)胞污染的細(xì)胞系名稱。做細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的伙伴們可以翻閱一下，以防自己的細(xì)胞也在其中！還不僅只如此，這些常見的細(xì)胞系除了發(fā)現(xiàn)種屬內(nèi)的交叉污染／錯(cuò)誤鑒定，還有部分細(xì)胞系被發(fā)現(xiàn)連種屬都被錯(cuò)誤鑒定了！...

全球因?yàn)榧?xì)胞系用錯(cuò)浪費(fèi)了多少錢？據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，只就HEp-2與Int-407這兩株細(xì)胞（它們實(shí)際上是Hela），直接浪費(fèi)的投入是7億美金，間接浪費(fèi)了7億美金。因?yàn)橛缅e(cuò)細(xì)胞，產(chǎn)生了多少垃圾文章？據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，只就HEp-2與Int-407這兩株細(xì)胞（它們實(shí)際上是...

什么時(shí)候需細(xì)胞系鑒定？（1）當(dāng)建立或獲得一個(gè)新的細(xì)胞系時(shí)（2）一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開始/結(jié)束時(shí)（3）在細(xì)胞凍存之前，或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng)2～3個(gè)月時(shí)（4）發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費(fèi)前（5）細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時(shí)（6）當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用超過一種細(xì)胞系時(shí)，所有...

STR是以中心序列 (core repeat units) 首尾相連多次重復(fù)形成。每個(gè)STR的中心序列結(jié)構(gòu)相同，長度為2-6bp，但其重復(fù)單位數(shù)目和重復(fù)區(qū)域的長度不同，因此STR在不同種族、不同人群之間的分布具有差異性，構(gòu)成了STR遺傳多態(tài)性。不同個(gè)體之間在一...

專業(yè)的STR數(shù)據(jù)庫，為細(xì)胞STR鑒定護(hù)航：不同于親子鑒定，其有父/母親樣本的STR數(shù)據(jù)可供對照，而目前所用的細(xì)胞系基本已難以找到供體的組織或細(xì)胞進(jìn)行STR比對，因此需要一個(gè)包含盡可能多的細(xì)胞系的STR數(shù)據(jù)庫（如公安部的指紋庫）來進(jìn)行檢索/比對。所以，這個(gè)庫包含...

為什么要做支原體污染檢測？在細(xì)胞研究領(lǐng)域，支原體是臭名昭著的污染源，許多實(shí)驗(yàn)室都深受其害。支原體傳染能在不知不覺中干擾研究結(jié)果，浪費(fèi)大量的資金投入。研究表明，95%以上污染細(xì)胞的支原體屬于以下四種類型：口腔支原體（M.orale）、精氨酸支原體（M.argin...

短串聯(lián)重復(fù)(Short tandem repeats, STR)，又稱微衛(wèi)星DNA(Microsatellite DNA)或簡單重復(fù)序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR)，是普遍存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列。...

上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模，提供兩種檢測平臺(tái)，分別為：適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDR SNP分型服務(wù)：PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(Ligase Detection Reactio...

多序列比對的意義：用于描述一組序列之間的相似性關(guān)系，以便了解一個(gè)基因家族的基本特征，尋找motif，保守區(qū)域等。用于描述一個(gè)同源基因之間的親緣關(guān)系的遠(yuǎn)景，應(yīng)用到分子進(jìn)化分析中。多序列比對的方法：同源性分析中常常要通過多序列比對來找出序列之間的相互關(guān)系，和bla...

兩條高度相似的序列可能不存在同源性；同樣的，同源序列的相似性也可能很低。例如兩條同源序列的相似性比對結(jié)果不明顯，但如果它們在結(jié)構(gòu)上相似性上明顯，或者它們都與第三條序列的相似性明顯，那么它們顯然是同源序列。因此，當(dāng)相似性搜索發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著的匹配時(shí)，我們可以放心...

SNP全稱Single Nucleotide Polymorphism，即單核苷酸多態(tài)性，是指在基因組DNA序列中由于單個(gè)核苷酸（A，T，C和G）的突變引起的多態(tài)性。一個(gè)SNP表示基因組某個(gè)位點(diǎn)有一個(gè)核苷酸的變化，源于單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換，顛換，插入和缺失。上海翼和...

隨著二代測序技術(shù)的普及，相比Sanger測序，以降低測序讀長的前提，**增加的測序通量同時(shí)大幅降低測序成本。利用二代測序進(jìn)行SNP分型，不僅測序讀長滿足分型需求，可以同時(shí)對數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn)，上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測序法，除了保留測序法的優(yōu)點(diǎn)外，彌補(bǔ)了其...

上海翼和生物基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分析方法，開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴(kuò)增子測序SNP分型，**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測序reads比對到亞基...

異源同源基因（xenologousgene）是由于基因在不同物種間的橫向轉(zhuǎn)移（horizontaltransfer）而產(chǎn)生的。異源同源基因在原核生物中研究比較多。**近研究表明，異源同源基因的原位取代xenolo—gousgenedisplacementins...

連接酶檢測反應(yīng)(LigaseDetectionReaction，LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別，高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配，連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法，對SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有...

上海翼和生物基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分析方法，開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴(kuò)增子測序SNP分型，**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測序reads比對到亞基...

SNP全稱Single Nucleotide Polymorphism，即單核苷酸多態(tài)性，是指在基因組DNA序列中由于單個(gè)核苷酸（A，T，C和G）的突變引起的多態(tài)性。一個(gè)SNP表示基因組某個(gè)位點(diǎn)有一個(gè)核苷酸的變化，源于單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換，顛換，插入和缺失。上海翼和...

基因的直系同源、旁系同源或異源同源關(guān)系[1]。祖先物種通過兩次物種分化形成ABC三個(gè)物種；伴隨物種分化而進(jìn)行的兩次基因重復(fù)共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個(gè)基因。顯然，C2與C3互為直系同源；B1與C1互為旁系同源；AB1與其他6個(gè)基因互為異源同源...

兩條高度相似的序列可能不存在同源性；同樣的，同源序列的相似性也可能很低。例如兩條同源序列的相似性比對結(jié)果不明顯，但如果它們在結(jié)構(gòu)上相似性上明顯，或者它們都與第三條序列的相似性明顯，那么它們顯然是同源序列。因此，當(dāng)相似性搜索發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著的匹配時(shí)，我們可以放心...

多倍體是指含有3套或3套以上完整染色體組的生物體。很多重要的農(nóng)作物和動(dòng)物都是多倍體，例如：小麥、油菜、棉花、花生、***、甘蔗、家蠶、蠑螈、果蠅、蛙等。多倍體物種基因組復(fù)雜，給遺傳學(xué)研究帶來了很大挑戰(zhàn)。在SNP分型、目標(biāo)區(qū)間重測序和分子克隆等過程中，特異性擴(kuò)增...

單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中，常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在，平均每...

基因的直系同源、旁系同源或異源同源關(guān)系[1]。祖先物種通過兩次物種分化形成ABC三個(gè)物種；伴隨物種分化而進(jìn)行的兩次基因重復(fù)共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個(gè)基因。顯然，C2與C3互為直系同源；B1與C1互為旁系同源；AB1與其他6個(gè)基因互為異源同源...

連接酶檢測反應(yīng)(LigaseDetectionReaction，LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別，高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配，連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法，對SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有...

目前市場上有多個(gè)廠家提供HRM分析的儀器，包括Idaho Technology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是**HRM的儀器，有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國猶他大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Wittwer實(shí)驗(yàn)室曾評估了市場上多...

多倍體物種SNP分型的常用技術(shù)包括Sanger測序、SNP芯片、KASP等3種，這3種技術(shù)依賴于特異性的擴(kuò)增或特異性的雜交，而多倍體物種亞基因組間高度同源，使得特異性擴(kuò)增/雜交的難度**增加，這3種常用技術(shù)在無法保證特異性的前提下，得到的是混合結(jié)果，且無法對混...

SNP全稱Single Nucleotide Polymorphism，即單核苷酸多態(tài)性，是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異，包括轉(zhuǎn)換，顛換，插入和缺失，形成的遺傳標(biāo)記，其數(shù)量很多，多態(tài)性豐富，有些SNP位點(diǎn)直接影響基因功能，從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP是研究人類...

多倍體是指含有3套或3套以上完整染色體組的生物體。很多重要的農(nóng)作物和動(dòng)物都是多倍體，例如：小麥、油菜、棉花、花生、***、甘蔗、家蠶、蠑螈、果蠅、蛙等。多倍體物種基因組復(fù)雜，給遺傳學(xué)研究帶來了很大挑戰(zhàn)。在SNP分型、目標(biāo)區(qū)間重測序和分子克隆等過程中，特異性擴(kuò)增...

基因的直系同源、旁系同源或異源同源關(guān)系[1]。祖先物種通過兩次物種分化形成ABC三個(gè)物種；伴隨物種分化而進(jìn)行的兩次基因重復(fù)共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個(gè)基因。顯然，C2與C3互為直系同源；B1與C1互為旁系同源；AB1與其他6個(gè)基因互為異源同源...

①所謂同源區(qū)段,就是針對一對同源染色體,兩條同源染色體上的相同位置的一個(gè)區(qū)段就是同源區(qū)段,對不對?對；②然后同源區(qū)段和等位基因有什么區(qū)別聯(lián)系?同源區(qū)段可以當(dāng)做同源染色體來理解,那么上面就有等位基因；③是不是如果一個(gè)染色體沒有某個(gè)同源區(qū)段的話,那就是說他沒有該性...

SNP指的是DNA序列上發(fā)生的單個(gè)核苷酸堿基之間的變異。SNP根據(jù)所處核酸位置不同，其預(yù)測的生物學(xué)功能不同，可以分為有***生物學(xué)意義和無***生物學(xué)意義的SNP。有生物學(xué)意義的SNP往往影響蛋白結(jié)構(gòu)，表達(dá)，剪切等。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)...