基因的直系同源、旁系同源或異源同源關(guān)系[1]。祖先物種通過兩次物種分化形成ABC三個(gè)物種;伴隨物種分化而進(jìn)行的兩次基因重復(fù)共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個(gè)基因。顯然,C2與C3互為直系同源;B1與C1互為旁系同源;AB1與其他6個(gè)基因互為異源同源。然而,B1和B2、B2和C1又是什么關(guān)系呢?在這個(gè)問題上曾引起爭議。B1和B2、B2和C1的分離是由于***次基因重復(fù)而產(chǎn)生的,套用定義,可得出B1和B2、B2和C1互為旁系同源。同理,B1和C2/C3、C1和C2/C3也互為旁系同源。類似的,根據(jù)直系同源基因的定義,B2和C2/C3、A1和所有B基因及C基因互為直系同源。高同源區(qū)段是二倍體和多倍體都存在的,由于多倍體來自染色體加倍,高同源區(qū)段在多倍體中更是普遍現(xiàn)象。天津同源區(qū)段SNP分型技術(shù)服務(wù)
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個(gè)相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進(jìn)行對(duì)比,比對(duì)出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒?;谧灾髦R(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù),翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺(tái)的多種檢測技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。上海高同源序列SNP分型怎么解決在進(jìn)行基因組研究中經(jīng)常會(huì)遇到各類高同源區(qū)段,比如人基因組中P450基因家族,HLA基因座位。
片段長度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過PCR擴(kuò)增目的片段DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段,直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位點(diǎn)分布不同,產(chǎn)生不同長度的DNA*段條帶。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào):上海翼和生物
多序列比對(duì)的意義:用于描述一組序列之間的相似性關(guān)系,以便了解一個(gè)基因家族的基本特征,尋找motif,保守區(qū)域等。用于描述一個(gè)同源基因之間的親緣關(guān)系的遠(yuǎn)景,應(yīng)用到分子進(jìn)化分析中。多序列比對(duì)的方法:同源性分析中常常要通過多序列比對(duì)來找出序列之間的相互關(guān)系,和blast的局部匹配搜索不同,多序列比對(duì)大多都是采用全局比對(duì)的算法。這樣對(duì)于采用計(jì)算機(jī)程序的自動(dòng)多序列比對(duì)是一個(gè)非常復(fù)雜且耗時(shí)的過程,特別是序列數(shù)目多,且序列唱的情況下。由于SNP的二態(tài)性,非此即彼,在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析這就利于發(fā)展自動(dòng)化技術(shù)篩選或檢測SNPs.
上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測平臺(tái),分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDR SNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(Ligase Detection Reaction,連接酶檢測反應(yīng))想結(jié)合的檢測技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對(duì)需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?;旌蠘颖竞?,在illumina 等主流測序平臺(tái)上,對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對(duì)幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)??梢愿鶕?jù)以往文獻(xiàn),在所研究疾病的多個(gè)候選基因上面選擇多個(gè)SNP,比如選擇DNA修復(fù)通路中幾個(gè)基因的重要SNP.江蘇高同源分型
翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案,有效解決了高同源區(qū)段SNP/序列分析的難題。天津同源區(qū)段SNP分型技術(shù)服務(wù)
理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性,但實(shí)際上,后兩者非常少見,幾乎可以忽略。因此,通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T,在其互補(bǔ)鏈上則為G A),也可能是顛換(C A,G T,C G,A T)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異,具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3,其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點(diǎn)。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高,可能是因?yàn)镃pG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中,易發(fā)生突變的位點(diǎn),其中大多數(shù)是甲基化的,可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中,任何堿基均有可能發(fā)生變異,因此SNP既有可能在基因序列內(nèi),也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來說,位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP(coding SNP,cSNP)比較少,因?yàn)樵谕怙@子內(nèi),其變異率*及周圍序列的1/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義,因此cSNP的研究更受關(guān)注。天津同源區(qū)段SNP分型技術(shù)服務(wù)
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè),技術(shù)力量雄厚。公司是一家私營有限責(zé)任公司企業(yè),以誠信務(wù)實(shí)的創(chuàng)業(yè)精神、專業(yè)的管理團(tuán)隊(duì)、踏實(shí)的職工隊(duì)伍,努力為廣大用戶提供高品質(zhì)的產(chǎn)品。公司業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù),價(jià)格合理,品質(zhì)有保證,深受廣大客戶的歡迎。翼和生物以創(chuàng)造高品質(zhì)產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。