祝賀翼和合作單位山東泰山醫(yī)學院免疫所于EBioMedicine發(fā)表論文★近日,上海翼和應用生物技術有限公司使用自有技術多重PCR與二代測序技術、聯(lián)合東華大學生物所,共同開發(fā)了檢測近交系小鼠遺傳背景的方案,并成功為客戶的SCI論文發(fā)表《EBioMedicine》...
熱烈祝賀上海翼和生物客戶第三軍醫(yī)大學新橋醫(yī)院內(nèi)分泌科發(fā)表文章“NRF2 activation by antioxidant antidiabetic agents accelerates tumor metastasis ”于Science Translati...
翼和采用PCR 檢測法,含有化學修飾熱啟動酶的 2×PCR mix,配以 dUTP 和UDG 酶,可很大程度降低非特異擴增和引物二聚體的形成,有效防止 PCR 產(chǎn)物的交叉污染。對細胞培養(yǎng)樣本內(nèi)支原體16S rRNA 基因高度保守區(qū)域特異性片段進行擴增檢測,與含...
有名的Hela細胞,源自一名美國黑人婦女的子宮頸細胞。這位理應在生物學史上占據(jù)一定地位的女性,名叫Henrietta Lacks,死于子宮頸*。自1951年至今,Hela細胞已被培養(yǎng)了60多年,分裂了近2萬次,仍然無停止跡象,是為不死的傳說,參見一本書《永生的...
當你準備將你的科研成果進行發(fā)表時,卻被投稿雜志要求提供細胞鑒定報告,此時你所使用的細胞是否存在交叉污染,可能導致你幾個月甚至是幾年的研究成果化為烏有。新買的細胞或者是已凍存多年未用的細胞,是否被污染,用它做實驗得到的結果是真實的嗎,用未經(jīng)細胞鑒定過的細胞,花費...
如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細胞系的身份?收到細胞系鑒定結果以及STR信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫進行比對。如果細胞樣本的每個STR位點和參考細胞STR位點都能重合匹配,即說明該細胞系正確,反之則說明你的細胞系可能被錯誤標記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來,匹配度≥8...
什么是細胞系鑒定?所謂細胞系鑒定即通過STR(短串聯(lián)重復)圖譜所建立細胞系的遺傳特征。一株細胞系的遺傳特征確立后,細胞系可以通過定期的檢測,以防止出現(xiàn)細胞系被誤認或交叉污染的情況。為什么要進行細胞系鑒定?由于細胞系發(fā)生交叉污染或身份誤認,將導致實驗數(shù)據(jù)的無效或...
翼和公司的近交系小鼠檢測方案1.0與2.0版本(1)基于PCR-LDR的近交系小鼠檢測方案1.0版本:該版本基于經(jīng)典的PCR-LDR方案,由東華大學、中科院實驗動物中心、上海實驗動物研究中心多位專家聯(lián)合開發(fā),并發(fā)表于《中國實驗動物學報》。上海翼和進行二次開發(fā)后...
通過風險值估計、置信區(qū)間和哈溫檢測,作者發(fā)現(xiàn)pre-miR-27a的rs895819位點,AG雜合子或者AA純合子相比GG純合子患MI的風險更低。并且將該位點的AG和AA基因型混合后相對于GG類型,混合后的樣本分組仍然患MI的風險更低。然而在其他4個前體miR...
小師弟:如何根據(jù)細胞STR鑒定結果判斷細胞系是否發(fā)生了交叉污染?如果存在細胞系之間發(fā)生交叉污染,而且鑒定用的細胞可能有兩種以上的細胞系時,那么在進行STR位點檢測的時候,多個位點會出現(xiàn)兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有...
短串聯(lián)重復序列(short tandem repeat,STR),又稱為微衛(wèi)星標記(microsalite)。它普遍并均勻地存在于真核生物基因組中,一般由一個長2~6bp的中心序列經(jīng)多次串聯(lián)重復排列而成,重復次數(shù)大多在10~60次之間。個體間中心序列的重復次數(shù)...
如何知道細胞系是否發(fā)生交叉污染了?如果存在細胞系之間發(fā)生交叉污染,而且鑒定用的細胞可能有兩種以上的細胞系時,那么在進行STR位點檢測的時候,多個位點會出現(xiàn)兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關系。因此,存在交叉污染...
STR基因位點由長度為3~7個堿基對的短串連重復序列組成,這些重復序列普遍存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標記,被稱為細胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈式反應)來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內(nèi)重復序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細管...
翼和細胞STR鑒定-專業(yè)服務!jin牌品質(zhì)!細胞系STR遺傳質(zhì)量鑒定是上海翼和自2014年起開始推出的專業(yè)服務,翼和是國內(nèi)比較早一批開展細胞系STR遺傳質(zhì)量鑒定服務的公司,迄今為止已有五年的細胞STR鑒定服務經(jīng)驗,十余年的STR分型經(jīng)驗。翼和細胞STR鑒定以專...
翼和采用PCR 檢測法,含有化學修飾熱啟動酶的 2×PCR mix,配以 dUTP 和UDG 酶,可很大程度降低非特異擴增和引物二聚體的形成,有效防止 PCR 產(chǎn)物的交叉污染。對細胞培養(yǎng)樣本內(nèi)支原體16S rRNA 基因高度保守區(qū)域特異性片段進行擴增檢測,與含...
STR基因位點由長度為3~7個堿基對的短串連重復序列組成,這些重復序列普遍存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標記,被稱為細胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈式反應)來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內(nèi)重復序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細管...
3.HRM法高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具,它通過實時監(jiān)測升溫過程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴增產(chǎn)物的結合情況,來判斷是否存在SNP,而且不同SNP位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形,因此HRM分析能夠有效區(qū)分不同SNP位...
RFLP法的優(yōu)點是分型技術簡單,結果判斷容易,不需要昂貴的設備,成本低,并且實驗人員培訓簡單。但是通過SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低,很多SNP位點不能采用這種方法進行檢測,而且有的限制性酶價格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高,容易出現(xiàn)假陽性結果,且工作...
如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細胞系的身份?收到細胞系鑒定結果以及STR信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫進行比對。如果細胞樣本的每個STR位點和參考細胞STR位點都能重合匹配,即說明該細胞系正確,反之則說明你的細胞系可能被錯誤標記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來,匹配度≥8...
值得注意的是,當發(fā)生兩個或以上細胞混合的時候,檢測結果看起來非常像細胞系的“遺傳不穩(wěn)定”——當一個細胞系存在亞群時,尤其是一些*細胞系,由于遺傳不穩(wěn)定的存在,在一些位點的STR特性會不同。因此經(jīng)驗豐富的分子專家是非常重要的,他能夠幫助分析復雜的電泳圖譜(STR...
3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是:首先選擇參考樣本制作標準曲線,然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較,根據(jù)所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性,也...
SNP(單核苷酸多態(tài)性)是遺傳學研究是不可缺少的一部分,上海翼和應用生物技術有限公司作為一家專門從事遺傳學技術服務的公司,SNP基因分型也是日常項目中經(jīng)常碰到的對象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多,各有各的特點和適用性,這讓很多剛開始接觸SNP分型的人們難...
《CandidateGenePolymorphismsandtheirAssociationwithGlycogenContentinthePacificOysterCrassostreagigas》本文作者在野生群體中進行了候選基因關聯(lián)分析,選擇90個候選基...
SNP基因分型技術原理是PCR擴增含有SNP的基因組片段,主要特點是準確性高、靈活性強、通量大,主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴增含有SNP的基因組片段,然后通過序列特異性引物實現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結晶后在真空管中受瞬時納秒(...
在擁有飽和染料和高分辨率儀器之后,HRM分析就可以開始啦。這個過程其實很簡單,就是對PCR的擴增子進行加熱,溫度從50°C逐漸上升到95°C。在此過程中,擴增子逐漸解鏈,在到達熔解溫度(Tm)時,DNA鏈完全分開。在HRM分析的初期,熒光強度很高,隨著溫度升高...
TaqMan熒光探針法優(yōu)點是操作簡單,準確性高(閉管進行,減少污染),判讀也很方便,認可度高;適合多樣本,少位點。但是其也有不可忽視的限制性,如探針合成耗時較長,價格昂貴,為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量,一般大家會選擇A公司合成。TaqMan熒光探針法一般為只有幾個位...
《CandidateGenePolymorphismsandtheirAssociationwithGlycogenContentinthePacificOysterCrassostreagigas》本文作者在野生群體中進行了候選基因關聯(lián)分析,選擇90個候選基...
連接酶檢測反應(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實現(xiàn)對基因多態(tài)性位點的識別,高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,連接反應就不能進行。該方法,對SNP位點同時設計兩條有...
SNP全稱SingleNucleotidePolymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些SNP位點直接影響基因功能,從而導致生物性狀改變。SNP是研究人類家族...
為了獲得更多糖原相關SNP位點,作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個基因,64個個體(32個高糖原個體和32個低糖原個體)進行重測序,,后得到732個高質(zhì)量SNP。其中32個位于Cg_GD2基因,256個位于Cg_GS基因,用于后續(xù)的關聯(lián)分析。結果顯示有兩...