廣東微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型

相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法，如片段長度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法，直接測序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測反應(yīng)法，競爭性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測序法等，小E就針對(duì)以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領(lǐng)下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。SNP在基礎(chǔ)研究領(lǐng)域發(fā)揮著巨大作用。廣東微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型

LDR連接酶檢測法優(yōu)點(diǎn)是適用于任何多態(tài)性位點(diǎn)，基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng)，分型結(jié)果準(zhǔn)確，可進(jìn)行多重反應(yīng)，性價(jià)比較高，且實(shí)驗(yàn)靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點(diǎn)檢測而言，LDR法可以實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)的同時(shí)檢測，提高檢測通量，因此前期需要一定時(shí)間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案，連續(xù)樣本的分型需求，提高實(shí)驗(yàn)通量的同時(shí)降低分型單價(jià)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部在上海，2011年無錫成立分公司無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司南京微衛(wèi)星標(biāo)記strSNP分型分析傳統(tǒng)的SNP檢測方法是采用一些已有的成熟技術(shù)，如DNA測序、、等位基因特異的寡聚核苷酸雜交(ASO)等。

單核苷酸多態(tài)性（singlenucleotidepolymorphism，SNP），主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中，常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在，平均每500～1000個(gè)堿基對(duì)中就有1個(gè)，估計(jì)其總數(shù)可達(dá)300萬個(gè)甚至更多。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個(gè)堿基的變異，這種變異可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換（transition）或顛換（transversion）所引起，也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。

上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模，提供兩種檢測平臺(tái)，分別為：適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù)：PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測反應(yīng))想結(jié)合的檢測技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配，則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行，反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù)，對(duì)需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?；旌蠘颖竞?，在illumina等主流測序平臺(tái)上，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分不同的樣本，，終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對(duì)幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定，相比其他的SNP檢測技術(shù)，基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。SNP一般來說，是全部體細(xì)胞一樣的基因型（除開嵌合體）。

RFLP法的優(yōu)點(diǎn)是分型技術(shù)簡單，結(jié)果判斷容易，不需要昂貴的設(shè)備，成本低，并且實(shí)驗(yàn)人員培訓(xùn)簡單。但是通過SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低，很多SNP位點(diǎn)不能采用這種方法進(jìn)行檢測，而且有的限制性酶價(jià)格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高，容易出現(xiàn)假陽性結(jié)果，且工作量大，耗時(shí)長，通量低。這是早期的一種SNP分型技術(shù)，在通量和效率上難以滿足批量分型需求，因此這種技術(shù)目前只在個(gè)別實(shí)驗(yàn)室中還在使用中。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司對(duì)于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應(yīng)體系來獲得。南京微衛(wèi)星標(biāo)記strSNP分型分析

高分辨率熔解曲線分析（HRM）是近幾年興起的SNP研究工具。廣東微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型

《CandidateGenePolymorphismsandtheirAssociationwithGlycogenContentinthePacificOysterCrassostreagigas》本文作者在野生群體中進(jìn)行了候選基因關(guān)聯(lián)分析，選擇90個(gè)候選基因以及295個(gè)SNP位點(diǎn)，并且結(jié)合目標(biāo)基因捕獲測序分型732個(gè)SNP位點(diǎn)。發(fā)現(xiàn)Cg_GD1基因(glycogendebranchingenzyme)中的兩個(gè)SNP位點(diǎn)(Cg_SNP_TY202andCg_SNP_3021)inCg_GD1(glycogendebranchingenzyme)和Cg_GP1基因(glycogenphosphorylase)中的一個(gè)SNP位點(diǎn)(Cg_SNP_4)與糖原含量相關(guān)，基因表達(dá)量分析顯示這兩個(gè)基因在高糖原與低糖原中的表達(dá)量也有比較明顯差異。廣東微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一家第三方檢測服務(wù)；生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)；健康衰老評(píng)估；大健康檢測；遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)；生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù)；小鼠遺傳品系鑒定；轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定；細(xì)胞點(diǎn)突變檢測；細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司，致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠實(shí)可信的企業(yè)。翼和生物作為第三方檢測服務(wù)；生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)；健康衰老評(píng)估；大健康檢測；遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)；生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù)；小鼠遺傳品系鑒定；轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定；細(xì)胞點(diǎn)突變檢測；細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的企業(yè)之一，為客戶提供良好的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)。翼和生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路，既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長，又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域，實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。翼和生物始終關(guān)注自身，在風(fēng)云變化的時(shí)代，對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使翼和生物在行業(yè)的從容而自信。