理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性，但實(shí)際上，后兩者非常少見(jiàn)，幾乎可以忽略。因此，通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（C T，在其互補(bǔ)鏈上則為G A），也可能是顛換（C A，G T，C G，A T）。轉(zhuǎn)換的發(fā)...

SNP全稱Single Nucleotide Polymorphism，即單核苷酸多態(tài)性，是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異，包括轉(zhuǎn)換，顛換，插入和缺失，形成的遺傳標(biāo)記，其數(shù)量很多，多態(tài)性豐富，有些SNP位點(diǎn)直接影響基因功能，從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP是研究人類...

上海翼和多倍體擴(kuò)增子測(cè)序SNP分型，結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分不同的樣本。并且將多倍體的不同...

隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及，相比Sanger測(cè)序，以降低測(cè)序讀長(zhǎng)的前提，**增加的測(cè)序通量同時(shí)大幅降低測(cè)序成本。利用二代測(cè)序進(jìn)行SNP分型，不僅測(cè)序讀長(zhǎng)滿足分型需求，可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn)，上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測(cè)序法，除了保留測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)外，彌補(bǔ)了其...

單核苷酸多態(tài)性（SNP)主要應(yīng)用比較比較常見(jiàn)，主要場(chǎng)景：（1）科研：研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異，如tumour、罕見(jiàn)變異。（2）臨床：用于**易感基因檢測(cè)、低頻**游離DNA檢測(cè)等。（3）健康：用于**風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估，家族遺傳咨詢指導(dǎo)、生活方式指導(dǎo)等相關(guān)的大眾消費(fèi)基...

所謂同源序列，簡(jiǎn)單地說(shuō)，是指從某一共同祖先經(jīng)趨異進(jìn)化而形成的不同序列。必須指出，相似性（similarity)和同源性（homology）是兩個(gè)完全不同的概念。相似性是指序列比對(duì)過(guò)程中用來(lái)描述檢測(cè)序列和目標(biāo)序列之間香通DNA堿基或氨基酸殘基順序所占比例的高低。...

將待檢測(cè)片段（包含待測(cè)SNP位點(diǎn)）進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中，準(zhǔn)確的一種，堪稱SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖，純和位點(diǎn)為單峰，而雜合位點(diǎn)則為套峰，因此通過(guò)查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開(kāi)來(lái)。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè)，還可用...

上海翼和多倍體擴(kuò)增子測(cè)序SNP分型，結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分不同的樣本。并且將多倍體的不同...

為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點(diǎn)，作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個(gè)基因，64個(gè)個(gè)體（32個(gè)高糖原個(gè)體和32個(gè)低糖原個(gè)體）進(jìn)行重測(cè)序，，后得到732個(gè)高質(zhì)量SNP。其中32個(gè)位于Cg_GD2基因，256個(gè)位于Cg_GS基因，用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩...

上海翼和生物基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分析方法，開(kāi)發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴(kuò)增子測(cè)序SNP分型，**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測(cè)序得到單分子序列信息，通過(guò)特色生信分析方法，對(duì)混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測(cè)序reads比對(duì)到亞基...

兩條高度相似的序列可能不存在同源性；同樣的，同源序列的相似性也可能很低。例如兩條同源序列的相似性比對(duì)結(jié)果不明顯，但如果它們?cè)诮Y(jié)構(gòu)上相似性上明顯，或者它們都與第三條序列的相似性明顯，那么它們顯然是同源序列。因此，當(dāng)相似性搜索發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著的匹配時(shí)，我們可以放心...

翼和人源細(xì)胞鑒定，包含哪些結(jié)果?翼和的STR圖譜鑒包含細(xì)胞身份驗(yàn)證報(bào)告、STR等位基因表、電泳圖、結(jié)果的解釋與數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)結(jié)果。就這一服務(wù)本身而言，是非常專業(yè)的。細(xì)胞鑒定哪家強(qiáng)，上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司。本公司極為多可提供20于對(duì)STR引物，對(duì)細(xì)胞進(jìn)行鑒定。...

翼和為您普及小知識(shí)點(diǎn)：作者分別從國(guó)內(nèi)28個(gè)研究機(jī)構(gòu)搜集了278株常見(jiàn)人源**細(xì)胞系，其中國(guó)內(nèi)建立的細(xì)胞系71株，國(guó)外建立的細(xì)胞系207株。經(jīng)STR鑒定后發(fā)現(xiàn)，來(lái)自于22個(gè)研究機(jī)構(gòu)的128株細(xì)胞存在交叉污染／錯(cuò)誤鑒定的情況，錯(cuò)誤率高達(dá)46%。其中國(guó)內(nèi)建立的細(xì)...

細(xì)胞STR鑒定的特點(diǎn)如下：STR 圖譜鑒別通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化的操作，采用自動(dòng)化的DNA分析儀對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行精確的分析，并以簡(jiǎn)單的數(shù)字描述STR序列重復(fù)次數(shù)，不僅增加了結(jié)果的客觀性，而且所需細(xì)胞數(shù)量少(只需1×10^3個(gè)細(xì)胞)，而細(xì)胞鑒定中常規(guī)采用的同工酶法通常需要5...

什么時(shí)候需細(xì)胞系鑒定？（1）當(dāng)建立或獲得一個(gè)新的細(xì)胞系時(shí)（2）一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開(kāi)始/結(jié)束時(shí)（3）在細(xì)胞凍存之前，或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng)2～3個(gè)月時(shí)（4）發(fā)表文章或申請(qǐng)課題經(jīng)費(fèi)前（5）細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時(shí)（6）當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用超過(guò)一種細(xì)胞系時(shí)，所有...

翼和采用PCR 檢測(cè)法，含有化學(xué)修飾熱啟動(dòng)酶的 2×PCR mix，配以 dUTP 和UDG 酶，可很大程度降低非特異擴(kuò)增和引物二聚體的形成，有效防止 PCR 產(chǎn)物的交叉污染。對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)樣本內(nèi)支原體16S rRNA 基因高度保守區(qū)域特異性片段進(jìn)行擴(kuò)增檢測(cè)，與含...

什么是細(xì)胞系鑒定？所謂細(xì)胞系鑒定即通過(guò)STR（短串聯(lián)重復(fù)）圖譜所建立細(xì)胞系的遺傳特征。一株細(xì)胞系的遺傳特征確立后，細(xì)胞系可以通過(guò)定期的檢測(cè)，以防止出現(xiàn)細(xì)胞系被誤認(rèn)或交叉污染的情況。為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定？由于細(xì)胞系發(fā)生交叉污染或身份誤認(rèn)，將導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的無(wú)效或...

祝賀翼和合作單位山東泰山醫(yī)學(xué)院免疫所于EBioMedicine發(fā)表論文★近日，上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司使用自有技術(shù)多重PCR與二代測(cè)序技術(shù)、聯(lián)合東華大學(xué)生物所，共同開(kāi)發(fā)了檢測(cè)近交系小鼠遺傳背景的方案，并成功為客戶的SCI論文發(fā)表《EBioMedicine》...

全球因?yàn)榧?xì)胞系用錯(cuò)浪費(fèi)了多少錢？據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，只就HEp-2與Int-407這兩株細(xì)胞（它們實(shí)際上是Hela），直接浪費(fèi)的投入是7億美金，間接浪費(fèi)了7億美金。因?yàn)橛缅e(cuò)細(xì)胞，產(chǎn)生了多少垃圾文章？據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，只就HEp-2與Int-407這兩株細(xì)胞（它們實(shí)際上是...

Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?；旌蠘颖竞?，在IonProton/IonTorrent平臺(tái)上，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方...

目前市場(chǎng)上有多個(gè)廠家提供HRM分析的儀器，包括IdahoTechnology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是HRM的儀器，有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國(guó)猶他大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Wittwer實(shí)驗(yàn)室曾評(píng)估了市場(chǎng)上多臺(tái)儀器...

2.SNaPshot法該技術(shù)由美國(guó)應(yīng)用生物公司（ABI）開(kāi)發(fā)，是基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的分型技術(shù)，也稱小測(cè)序，主要針對(duì)中等通量的SNP分型項(xiàng)目。在一個(gè)含有測(cè)序酶、四種熒光標(biāo)記ddNTP、緊臨多態(tài)位點(diǎn)5’-端的不同長(zhǎng)度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中，引...

隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及，相比Sanger測(cè)序，二代測(cè)序雖然降低了測(cè)序讀長(zhǎng)，但是極大增加的測(cè)序通量同時(shí)大幅降低測(cè)序成本。利用二代測(cè)序進(jìn)行SNP分型，不僅測(cè)序讀長(zhǎng)滿足分型需求，并且可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn)，上千樣本進(jìn)行分型。二代測(cè)序結(jié)果判斷準(zhǔn)確直觀，相比RFLP，...

單核苷酸多態(tài)性（SNP)主要應(yīng)用比較比較常見(jiàn)，主要場(chǎng)景：（1）科研：研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異，如tumour、罕見(jiàn)變異。（2）臨床：用于tumour易感基因檢測(cè)、低頻tumour游離DNA檢測(cè)等。（3）健康：用于tumour風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估，家族遺傳咨詢指導(dǎo)、生活方...

上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模，提供兩種檢測(cè)平臺(tái)，分別為：適合中低通量檢測(cè)的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù)：PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連...

1.TaqMan探針?lè)ㄡ槍?duì)染色體上的不同SNP位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)PCR引物和TaqMan探針，進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增。探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。當(dāng)溶液中存在PCR產(chǎn)物時(shí)，該探針與模板退火，即產(chǎn)生了適合于核酸外切酶活性的底物，...

SNP挑選：（1）SNP位于非編碼區(qū)；（2）SNP平均分布在29條常染色體上；（3），小等位基因頻度（MAF）需大于30%，保證位點(diǎn)有足夠多態(tài)性；SNP鑒定方法~翼和Hi-SNP：59個(gè)SNP采用上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司的Hi-SNP技術(shù)，由本公司實(shí)施多重...

經(jīng)常會(huì)碰到有人詢問(wèn)，如何查詢某特定區(qū)段內(nèi)的SNP信息。下面小E就整理了一下如何利用千人基因組計(jì)劃數(shù)據(jù)庫(kù)，查詢所有SNP位點(diǎn)的信息。輸入千人基因組網(wǎng)址，打開(kāi)千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)。假設(shè)小明要查詢“chr10:30301729-30348488”這段距離的SNP數(shù)據(jù)，在...

以上就是小E對(duì)幾種SNP分型技術(shù)的簡(jiǎn)單介紹，大家可以看出分型技術(shù)多種多樣，各有各的優(yōu)點(diǎn)和限制。大家需要綜合考慮實(shí)驗(yàn)的各方面情況，如實(shí)驗(yàn)規(guī)模（多少位點(diǎn)，多少樣本），實(shí)驗(yàn)周期，實(shí)驗(yàn)預(yù)算等，然后選擇一個(gè)適合自己實(shí)驗(yàn)的分型技術(shù)。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，...

SNP(單核苷酸多態(tài)性)是，新發(fā)展起來(lái)的第三代分子標(biāo)記技術(shù),具有分布廣,多態(tài)信息量大,易于檢測(cè)和統(tǒng)計(jì)分析等特點(diǎn).目前,SNP技術(shù)在水稻,玉米,大豆等作物研究中應(yīng)用較多.本文綜述該技術(shù)在這些作物的遺傳標(biāo)記,分子標(biāo)記輔助選擇,構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜,繪制EST圖譜...