北京基因SNP分型分析

來源: 發(fā)布時間:2021-10-13

單核苷酸多態(tài)性(SNP)主要應(yīng)用比較比較常見,主要場景:(1)科研:研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異,如tumour、罕見變異。(2)臨床:用于tumour易感基因檢測、低頻tumour游離DNA檢測等。(3)健康:用于tumour風(fēng)險評估,家族遺傳咨詢指導(dǎo)、生活方式指導(dǎo)等相關(guān)的大眾消費基因檢測。(4)農(nóng)業(yè):用于品系鑒定、全基因組掃描、優(yōu)勢性狀篩選等。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和**團(tuán)隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。北京基因SNP分型分析

1.TaqMan探針法針對染色體上的不同SNP位點分別設(shè)計PCR引物和TaqMan探針,進(jìn)行實時熒光PCR擴(kuò)增。探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個報告熒光基團(tuán)和一個淬滅熒光基團(tuán)。當(dāng)溶液中存在PCR產(chǎn)物時,該探針與模板退火,即產(chǎn)生了適合于核酸外切酶活性的底物,從而將探針5’-端連接的熒光分子從探針上切割下來,破壞兩熒光分子間的PRET,發(fā)出熒光。通常用于少量SNP位點分析。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司按公司利用的就是此方案。公司公眾號:上海翼和生物STR基因SNP分型分析如果突變發(fā)生在生殖細(xì)胞,則可以遺傳。

高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡稱HRM)分析是一門新興的技術(shù)。它通過PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測PCR片段的微小序列差異,從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對和基因分型等多個方面。憑借其速度和簡便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀(jì)六十年代,當(dāng)時是通過紫外吸收來監(jiān)測的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個小時才能完成。后來,LightCycler定量PCR儀的出現(xiàn),讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細(xì)管而縮減至納克級,且熔解速率更快,達(dá)0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時間縮短至幾分鐘。當(dāng)時使用的染料是SYBR?GreenI。

單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism,SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在,平均每500~1000個堿基對中就有1個,估計其總數(shù)可達(dá)300萬個甚至更多。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個堿基的變異,這種變異可由單個堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起,也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個堿基的變異,這種變異可由單個堿基的轉(zhuǎn)換或顛換所引起。

隨著遺傳學(xué)越來越貼近老百姓的生活,上海翼和生物作為歷史悠久的遺傳學(xué)服務(wù)供應(yīng)商,有16年高性價比的專業(yè)基因檢測經(jīng)驗,推出了的SNP分型平臺,提供各類基因檢測和科研委托服務(wù),檢測技術(shù)包括①TaqMan熒光探針技術(shù);②自主知識產(chǎn)權(quán)的PCR-LDR技術(shù);③基于超高重PCR捕獲的二代測序SNP分型平臺(Hi-SNP);④基因組目標(biāo)區(qū)段的超高重PCR捕獲建庫測序平臺(Hi-reseq)。上海翼和**團(tuán)隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具。杭州微衛(wèi)星SSRSNP分型質(zhì)量好

探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個報告熒光基團(tuán)和一個淬滅熒光基團(tuán)。北京基因SNP分型分析

從對生物的遺傳性狀的影響上來看,cSNP又可分為2種:一種是同義cSNP(synonymouscSNP),即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質(zhì)的氨基酸序列,突變堿基與未突變堿基的含義相同;另一種是非同義cSNP(non-synonymouscSNP),指堿基序列的改變可使以其為藍(lán)本翻譯的蛋白質(zhì)序列發(fā)生改變,從而影響了蛋白質(zhì)的功能。這種改變常是導(dǎo)致生物性狀改變的直接原因。cSNP中約有一半為非同義cSNP。上海翼和**團(tuán)隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。北京基因SNP分型分析

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