單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在,平均每...
在一切由細(xì)胞身份開始說起一文中,小E已經(jīng)為大家羅列出目前已經(jīng)確定被Hela細(xì)胞污染的細(xì)胞系名稱。做細(xì)胞實驗的伙伴們可以翻閱一下,以防自己的細(xì)胞也在其中!還不僅只如此,這些常見的細(xì)胞系除了發(fā)現(xiàn)種屬內(nèi)的交叉污染/錯誤鑒定,還有部分細(xì)胞系被發(fā)現(xiàn)連種屬都被錯誤鑒定了!...
有名的Hela細(xì)胞,源自一名美國黑人婦女的子宮頸細(xì)胞。這位理應(yīng)在生物學(xué)史上占據(jù)一定地位的女性,名叫Henrietta Lacks,死于子宮頸*。自1951年至今,Hela細(xì)胞已被培養(yǎng)了60多年,分裂了近2萬次,仍然無停止跡象,是為不死的傳說,參見一本書《永生的...
5.IlluminaBeadXpress法采用Illumina公司的BeadXpress系統(tǒng)進(jìn)行批量SNP位點檢測,可以同時檢測1-384個SNP位點,往往用于基因組芯片結(jié)果確認(rèn),適合高通量檢測。微珠芯片具有高密度、高重復(fù)性、高靈敏度、低上樣量、定制靈活等特點...
SNP挑選:(1)SNP位于非編碼區(qū);(2)SNP平均分布在29條常染色體上;(3),小等位基因頻度(MAF)需大于30%,保證位點有足夠多態(tài)性;SNP鑒定方法~翼和Hi-SNP:59個SNP采用上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司的Hi-SNP技術(shù),由本公司實施多重...
競爭性等位基因特異性PCR法——KASP(KompetitiveAlleleSpecificPCR),是英國LGC(**化學(xué)家實驗室)公司所開發(fā)的技術(shù),被比較常見用于少位點,多樣本的SNP分型中,與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的...
3.HRM法高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具,它通過實時監(jiān)測升溫過程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的結(jié)合情況,來判斷是否存在SNP,而且不同SNP位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形,因此HRM分析能夠有效區(qū)分不同SNP位...
這種熔解分析只能區(qū)分在片段大小和GC含量上差別較比較明顯的DNA序列,比如檢查PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中是否存在引物二聚體及其他非特異性的擴(kuò)增。如果要區(qū)分SNP,分辨率還不夠。為什么呢?這里有必要先介紹一下飽和染料和非飽和染料。SYBRGreenI就屬于非飽和性染料,由...
在表觀遺傳中,DNA甲基化修飾具有非常重要的地位。其中胞嘧啶雜環(huán)5號位的甲基化修飾,又稱作5-甲基胞嘧啶(5mC),是**常見的甲基化修飾方式,也是迄今為止研究**為普遍的DNA甲基化修飾方式。一般認(rèn)為當(dāng)DNA甲基化出現(xiàn)在基因啟動子區(qū),就會抑制基因轉(zhuǎn)錄,從而起...
5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一種常見的DNA修飾類型,能調(diào)節(jié)基因表達(dá)、轉(zhuǎn)座子及染色體的狀態(tài)等。全基因組重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化的WGBS法,能夠?qū)崿F(xiàn)單堿基分辨率的甲基化位點準(zhǔn)確、高效定位。通過***分析不同處理方式下的全基因組甲基化水...
表觀遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對于染色體構(gòu)象、基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制有著重要影響,而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學(xué)為關(guān)注的內(nèi)容之一。Bisulfite處理能夠?qū)⒒蚪M中未發(fā)生甲基化的C堿基轉(zhuǎn)換成U,進(jìn)行PCR擴(kuò)增后變成T,與原本具有...
全基因組甲基化測序結(jié)合了亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化(bisulfiteconversion)方法與新一代高通量測序技術(shù),可在單堿基分辨率水平上高效地檢測全基因組DNA甲基化狀態(tài)。亞硫酸氫鹽處理可以使DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉(zhuǎn)變成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,...
DNA甲基化是一種表觀遺傳修飾,它是由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyl-transferase, DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)作為甲基供體,將胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)?-甲基胞嘧啶(mC)的一種反應(yīng),在真核生物...
相信對研究遺傳學(xué)及相關(guān)方向的老濕和童鞋來說,SNP肯定是,不陌生的名詞,它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。大量存在的SNP位點,使人們有機(jī)會發(fā)現(xiàn)與各種疾病相關(guān)的基因組突變。小明:濕兄,濕兄!老濕讓我找SNP位點,要怎么找呀?濕兄:淡定!說清楚問題~小明:我的...
DNA甲基化是一種表觀遺傳修飾,它是由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyl-transferase, DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)作為甲基供體,將胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)?-甲基胞嘧啶(mC)的一種反應(yīng),在真核生物...
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗的專業(yè)遺傳學(xué)服務(wù)供應(yīng)商。公司的首席科學(xué)家為肖君華教授(東華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)研究所教授;中國遺傳學(xué)會理事;上海市遺傳學(xué)會常務(wù)理事)。公司擁有兩大專業(yè)平臺:基于一代測序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺...
片段長度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過PCR擴(kuò)增目的片段DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段,直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性...
SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,主要特點是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大,主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,然后通過序列特異性引物實現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時納秒(...
SNP(單核苷酸多態(tài)性)是,新發(fā)展起來的第三代分子標(biāo)記技術(shù),具有分布廣,多態(tài)信息量大,易于檢測和統(tǒng)計分析等特點.目前,SNP技術(shù)在水稻,玉米,大豆等作物研究中應(yīng)用較多.本文綜述該技術(shù)在這些作物的遺傳標(biāo)記,分子標(biāo)記輔助選擇,構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜,繪制EST圖譜...
目前翼和業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋靶向捕獲二代測序、細(xì)胞系STR遺傳背景鑒定和SNP基因分型三大板塊。在基因檢測應(yīng)用中,公司采用TaqMan、LDR與等位基因PCR技術(shù),為客戶提供高性價比的服務(wù)。翼和專家團(tuán)隊將繼續(xù)秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,致力于應(yīng)用遺傳學(xué)診斷技術(shù)...
有名的Hela細(xì)胞,源自一名美國黑人婦女的子宮頸細(xì)胞。這位理應(yīng)在生物學(xué)史上占據(jù)一定地位的女性,名叫Henrietta Lacks,死于子宮頸*。自1951年至今,Hela細(xì)胞已被培養(yǎng)了60多年,分裂了近2萬次,仍然無停止跡象,是為不死的傳說,參見一本書《永生的...
熱烈祝賀上海翼和生物客戶第三軍醫(yī)大學(xué)新橋醫(yī)院內(nèi)分泌科發(fā)表文章“NRF2 activation by antioxidant antidiabetic agents accelerates tumor metastasis ”于Science Translati...
現(xiàn)如今,大家在購買細(xì)胞株的時候,會面臨諸多突出的問題︰①細(xì)胞活性不足,收到細(xì)胞后存活率不高,導(dǎo)致實驗無法正常進(jìn)行;②細(xì)胞本身的質(zhì)量無法保證,除正規(guī)單位的細(xì)胞外,無法確認(rèn)細(xì)胞源本身質(zhì)量;③市場上以次充好、良莠不齊、魚龍混珠的假細(xì)胞比比皆是、無法分辨。如果你一不注...
在過去的的幾十年間,在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域,文章一直在發(fā)表,科研成果一直在公布,但是當(dāng)中哺乳動物細(xì)胞被錯誤鑒定,存在交叉污染的情況也同時存在著。2010年有雜志(IJC)統(tǒng)計出一列表,在346篇文章中,有 103篇存在細(xì)胞被Hela細(xì)胞污染的情況。當(dāng)然還有,在200...
本文購自ATCC等機(jī)構(gòu)的細(xì)胞(如SW480,HCT116, FET細(xì)胞系等),均全部由上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司鑒定。其中,HCT116細(xì)胞系,雖源于一個男性個體,但其現(xiàn)存細(xì)胞系在世界上有兩種性別,翼和公司以自己的專業(yè)對其成功的進(jìn)行了鑒定。文章認(rèn)為,盡管AB...
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進(jìn)行對比,比對出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市...
異源同源基因(xenologousgene)是由于基因在不同物種間的橫向轉(zhuǎn)移(horizontaltransfer)而產(chǎn)生的。異源同源基因在原核生物中研究比較多。**近研究表明,異源同源基因的原位取代xenolo—gousgenedisplacementins...
TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團(tuán)連接在探針的5’末端,而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應(yīng)體系中加入2種不同熒光標(biāo)記的探針,它們可以分別與2個等位基因完全配對。正常情況下,由于探針5’端熒光基團(tuán)和3’端淬滅基團(tuán)緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR有...
SNP 全稱 Single Nucleotide Polymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括 轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標(biāo)記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些 SNP 位點直接影響基因功 能,從而導(dǎo)致生物性狀改變。SN...
多倍體是指含有3套或3套以上完整染色體組的生物體。很多重要的農(nóng)作物和動物都是多倍體,例如:小麥、油菜、棉花、花生、***、甘蔗、家蠶、蠑螈、果蠅、蛙等。多倍體物種基因組復(fù)雜,給遺傳學(xué)研究帶來了很大挑戰(zhàn)。在SNP分型、目標(biāo)區(qū)間重測序和分子克隆等過程中,特異性擴(kuò)增...