當(dāng)你準(zhǔn)備將你的科研成果進(jìn)行發(fā)表時，卻被投稿雜志要求提供細(xì)胞鑒定報告，此時你所使用的細(xì)胞是否存在交叉污染，可能導(dǎo)致你幾個月甚至是幾年的研究成果化為烏有。新買的細(xì)胞或者是已凍存多年未用的細(xì)胞，是否被污染，用它做實驗得到的結(jié)果是真實的嗎，用未經(jīng)細(xì)胞鑒定過的細(xì)胞，花費...

如何知道細(xì)胞系是否發(fā)生交叉污染了？如果存在細(xì)胞系之間發(fā)生交叉污染，而且鑒定用的細(xì)胞可能有兩種以上的細(xì)胞系時，那么在進(jìn)行STR位點檢測的時候，多個位點會出現(xiàn)兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度，理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關(guān)系。因此，存在交叉污染...

4.MassArray法MassARRAY分子量陣列技術(shù)是Sequenom公司推出的世界上靠前的基因分析工具，通過引物延伸或切割反應(yīng)與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術(shù)相結(jié)合，實現(xiàn)基因分型檢測?；贛assARRAY平臺的iPLEXGOLD技術(shù)可以設(shè)計，...

DNA甲基化是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的作用下，使胞嘧啶的5位碳原子發(fā)生甲基化的生物化學(xué)過程。DNA胞嘧啶甲基化是一種穩(wěn)定的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記，在調(diào)控特定基因表達(dá)、轉(zhuǎn)座子沉默、基因印記、X染色體失活以及基因組穩(wěn)定性等多種生物學(xué)過程中發(fā)揮著重要作用。在動物中，DNA甲基...

上海翼和生物通過亞硫酸氫鹽（bisulfite）處理，用多重PCR擴增目的片段，添加barcode和測序通用接頭，在Illumina X10二代測序平臺對PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測序，利用生物信息學(xué)方法，精確定量計算目標(biāo)區(qū)間內(nèi)的甲基化位點的甲基化狀態(tài)，在完成目標(biāo)區(qū)...

真核生物基因表達(dá)受多種機制、多層面的綜合調(diào)控?；虻腄NA序列不發(fā)生改變的情況下，基因的表達(dá)水平與功能發(fā)生改變，并可遺傳現(xiàn)象，稱為表觀遺傳(epigenetic)現(xiàn)象。DNA甲基化是指在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下，DNA的CG二核苷酸中的胞嘧啶被選擇性的添加甲基，形成...

表觀遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對于染色體構(gòu)象、基因表達(dá)調(diào)控機制有著重要影響，而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學(xué)為關(guān)注的內(nèi)容之一。Bisulfite處理能夠?qū)⒒蚪M中未發(fā)生甲基化的C堿基轉(zhuǎn)換成U，進(jìn)行PCR擴增后變成T，與原本具有...

亞硫酸氫鹽測序法用亞硫酸氫鈉對 DNA 進(jìn)行化學(xué)處理會使甲基化特異性序列變異，從而可以通過NGS進(jìn)行定位和量化，主要的DNA甲基化數(shù)據(jù)分析流程：獲得DNA甲基化數(shù)據(jù)之后，首先，需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和質(zhì)量的基本控制，包括原始測序和芯片數(shù)據(jù)的讀取、轉(zhuǎn)換到產(chǎn)生準(zhǔn)確的D...

高分辨率熔解（High-resolutionmelting，簡稱HRM）分析是一門新興的技術(shù)。它通過PCR之后的熔解曲線分析，就能檢測PCR片段的微小序列差異，從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對和基因分型等多個方面。憑借其速度和簡便性，高分辨率熔解這種方法正在迅速普...

相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法，如片段長度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法，直接測序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測反應(yīng)法，競爭性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測序法等，小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個介紹和總結(jié)。上海翼和...

上海翼和生物根據(jù)具體實驗規(guī)模，提供兩種檢測平臺，分別為：適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù)：PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連...

為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點，作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個基因，64個個體（32個高糖原個體和32個低糖原個體）進(jìn)行重測序，，后得到732個高質(zhì)量SNP。其中32個位于Cg_GD2基因，256個位于Cg_GS基因，用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩...

理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個或4個等位多態(tài)性，但實際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T，在其互補鏈上則為GA)，也可能是顛換(CA，GT，CG，AT)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于...

SNP挑選：（1）SNP位于非編碼區(qū)；（2）SNP平均分布在29條常染色體上；（3），小等位基因頻度（MAF）需大于30%，保證位點有足夠多態(tài)性；SNP鑒定方法~翼和Hi-SNP：59個SNP采用上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司的Hi-SNP技術(shù)，由本公司實施多重...

主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進(jìn)行對比，比對出其相似的程度。相似度越高，說明序列的同源性越高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市...

單核苷酸多態(tài)性（SNP)主要應(yīng)用比較比較常見，主要場景：（1）科研：研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異，如tumour、罕見變異。（2）臨床：用于**易感基因檢測、低頻**游離DNA檢測等。（3）健康：用于**風(fēng)險評估，家族遺傳咨詢指導(dǎo)、生活方式指導(dǎo)等相關(guān)的大眾消費基...

異源同源基因（xenologousgene）是由于基因在不同物種間的橫向轉(zhuǎn)移（horizontaltransfer）而產(chǎn)生的。異源同源基因在原核生物中研究比較多。**近研究表明，異源同源基因的原位取代xenolo—gousgenedisplacementins...

異源同源基因（xenologousgene）是由于基因在不同物種間的橫向轉(zhuǎn)移（horizontaltransfer）而產(chǎn)生的。異源同源基因在原核生物中研究比較多。**近研究表明，異源同源基因的原位取代xenolo—gousgenedisplacementins...

片段長度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法——RFLP（RestrictionFragmentLengthPolymorphism）法的基本原理是通過PCR擴增目的片段DNA，擴增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段，直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性...

亞硫酸氫鈉修飾后測序法是一種對DNA進(jìn)行亞硫酸氫鈉處理、聚合酶鏈反應(yīng)擴增與DNA測序相結(jié)合的方法，能夠提供測定區(qū)域的序列信息，準(zhǔn)確定位甲基化胞嘧啶位點；重亞硫酸鹽修飾后，甲基化胞嘧啶保持不變，但非甲基化胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏?，PCR擴增后為胸腺嘧啶，其將甲基化狀態(tài)...

SNP（單核苷酸多態(tài)性）是遺傳學(xué)研究是不可缺少的一部分，上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司作為一家專門從事遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)的公司，SNP基因分型也是日常項目中經(jīng)常碰到的對象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多，各有各的特點和適用性，這讓很多剛開始接觸SNP分型的人們難...

SNP挑選：（1）SNP位于非編碼區(qū)；（2）SNP平均分布在29條常染色體上；（3），小等位基因頻度（MAF）需大于30%，保證位點有足夠多態(tài)性；SNP鑒定方法~翼和Hi-SNP：59個SNP采用上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司的Hi-SNP技術(shù)，由本公司實施多重...

目前市場上有多個廠家提供HRM分析的儀器，包括IdahoTechnology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是HRM的儀器，有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國猶他大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Wittwer實驗室曾評估了市場上多臺儀器...

《CandidateGenePolymorphismsandtheirAssociationwithGlycogenContentinthePacificOysterCrassostreagigas》本文作者在野生群體中進(jìn)行了候選基因關(guān)聯(lián)分析，選擇90個候選基...

表觀遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對于染色體構(gòu)象、基因表達(dá)調(diào)控機制有著重要影響，而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學(xué)為關(guān)注的內(nèi)容之一。Bisulfite處理能夠?qū)⒒蚪M中未發(fā)生甲基化的C堿基轉(zhuǎn)換成U，進(jìn)行PCR擴增后變成T，與原本具有...

DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域研究的重點之一。DNA甲基化是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶（DNA methyltransferase, 縮寫DNMT）的作用下，基因組DNA序列上CpG島的二核苷酸5′端胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)?′甲基胞嘧啶（5′ methylcytosine, 縮...

SNP（單核苷酸多態(tài)性）是遺傳學(xué)研究是不可缺少的一部分，上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司作為一家專門從事遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)的公司，SNP基因分型也是日常項目中經(jīng)常碰到的對象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多，各有各的特點和適用性，這讓很多剛開始接觸SNP分型的人們難...

Hi-Methylseq結(jié)合了亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換、靶向擴增子高通量測序技術(shù)，可實現(xiàn)多區(qū)段、多位點的甲基化精確定量分析，適用于感興趣的目的片段的甲基化研究和在大樣本中進(jìn)一步確認(rèn)全基因組甲基化研究挑選的陽性位點。采用翼和自主知識產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù)，確保目的片段有效...

競爭性等位基因特異性PCR法——KASP（KompetitiveAlleleSpecificPCR），是英國LGC（**化學(xué)家實驗室）公司所開發(fā)的技術(shù)，被比較常見用于少位點，多樣本的SNP分型中，與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的...

Hi-SNP 結(jié)合多重 PCR 技術(shù)和高通量測序技術(shù)，對需要檢測的位點設(shè)計特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重 PCR 擴增，不同的樣本以不同的 Barcode 引物區(qū)分?；旌蠘颖竞?，在 Ion Proton/illumina 主流測序平臺上， 對擴增子進(jìn)行高通量測序...