江蘇STR/SSRSNP分型準(zhǔn)確度高

來源: 發(fā)布時間:2021-12-23

SNP(單核苷酸多態(tài)性)是遺傳學(xué)研究是不可缺少的一部分,上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司作為一家專門從事遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)的公司,SNP基因分型也是日常項目中經(jīng)常碰到的對象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多,各有各的特點和適用性,這讓很多剛開始接觸SNP分型的人們難以選擇,適合自己的分型方法。翼和生物可根據(jù)客戶提供的樣本量,位點數(shù)目等情況,提供不同的方案。SNP分型技術(shù)大盤點,選擇,適合的才是,好的。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。SNP應(yīng)該在群體中占一定的比例,比如至少是1%。江蘇STR/SSRSNP分型準(zhǔn)確度高

相比Taqman熒光探針法,KASP技術(shù)只要合成兩個通用熒光探針,兩個通用淬滅探針,通用熒光探針來代替針對位點的熒光探針,極大節(jié)約成本。同時配套SNPline基因分型儀器平臺,可以進行高通量的SNP分型規(guī)模。該方法利用多重PCR技術(shù),同時捕獲數(shù)十上百個SNP位點,Barcode引物區(qū)分不同樣本,實現(xiàn)一次上機測序,完成多位點,大樣本的高通量分型實驗?zāi)康?。多重PCR特性,也極大降低了對樣本量的需求。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。廣東微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型分析對于國外SNP研究領(lǐng)域,我認(rèn)為現(xiàn)在也進入了理性思考期。

TaqMan熒光探針法優(yōu)點是操作簡單,準(zhǔn)確性高(閉管進行,減少污染),判讀也很方便,認(rèn)可度高;適合多樣本,少位點。但是其也有不可忽視的限制性,如探針合成耗時較長,價格昂貴,為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量,一般大家會選擇A公司合成。TaqMan熒光探針法一般為只有幾個位點時適用,并且對樣本的質(zhì)量要求較高,除了樣本無降解外,要需要濃度盡可能的一致。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司,地址:上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502

隨著二代測序技術(shù)的普及,相比Sanger測序,二代測序雖然降低了測序讀長,但是極大增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進行SNP分型,不僅測序讀長滿足分型需求,并且可以同時對數(shù)十?dāng)?shù)百個位點,上千樣本進行分型。二代測序結(jié)果判斷準(zhǔn)確直觀,相比RFLP,Taqman,LDR等方法都通過間接結(jié)果來進行分型結(jié)果的判定,直接測序或二代測序法分型能都直接看到位點具體序列情況,SNP位點判斷更加直觀。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。SNP已經(jīng)廣泛應(yīng)用于人類致病基因篩選、致病風(fēng)險診斷及預(yù)測、個體化藥物篩選等生物、醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域。

3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是:首先選擇參考樣本制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,然后將待測的混和樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線進行比較,根據(jù)所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性,也有利于對其進行基因分型。對SNP進行基因分型包括三方面的內(nèi)容:(1)鑒別基因型所采用的化學(xué)反應(yīng),常用的技術(shù)手段包括:DNA分子雜交、引物延伸、等位基因特異的寡核苷酸連接反應(yīng)、側(cè)翼探針切割反應(yīng)以及基于這些方法的變通技術(shù);(2)完成這些化學(xué)反應(yīng)所采用的模式,包括液相反應(yīng)、固相支持物上進行的反應(yīng)以及二者皆有的反應(yīng)。(3)化學(xué)反應(yīng)結(jié)束后,需要應(yīng)用生物技術(shù)系統(tǒng)檢測反應(yīng)結(jié)果。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T,在其互補鏈上則為G A),也可能是顛換(C A,G T,C G,A T)。微衛(wèi)星SSRSNP分型準(zhǔn)確度高

理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個或4個等位多態(tài)性。江蘇STR/SSRSNP分型準(zhǔn)確度高

在擁有飽和染料和高分辨率儀器之后,HRM分析就可以開始啦。這個過程其實很簡單,就是對PCR的擴增子進行加熱,溫度從50°C逐漸上升到95°C。在此過程中,擴增子逐漸解鏈,在到達熔解溫度(Tm)時,DNA鏈完全分開。在HRM分析的初期,熒光強度很高,隨著溫度升高,雙鏈DNA逐漸減少,熒光強度也就下降了。HRM儀器通過照相機,記錄下熒光變化的整個過程。通過對數(shù)據(jù)的作圖,就生成了熔解曲線。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。江蘇STR/SSRSNP分型準(zhǔn)確度高

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實現(xiàn)高品質(zhì)管理的追求。翼和生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)В瑸榭蛻籼峁└咂焚|(zhì)的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)。翼和生物繼續(xù)堅定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。翼和生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。