相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法，如片段長度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法，直接測序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測反應(yīng)法，競爭性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測序法等，小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領(lǐng)下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（C T，在其互補(bǔ)鏈上則為G A），也可能是顛換（C A，G T，C G，A T）。江蘇STR基因SNP分型技術(shù)服務(wù)
隨著二代測序技術(shù)的普及，相比Sanger測序，二代測序雖然降低了測序讀長，但是極大增加的測序通量同時(shí)大幅降低測序成本。利用二代測序進(jìn)行SNP分型，不僅測序讀長滿足分型需求，并且可以同時(shí)對數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn)，上千樣本進(jìn)行分型。二代測序結(jié)果判斷準(zhǔn)確直觀，相比RFLP，Taqman，LDR等方法都通過間接結(jié)果來進(jìn)行分型結(jié)果的判定，直接測序或二代測序法分型能都直接看到位點(diǎn)具體序列情況，SNP位點(diǎn)判斷更加直觀。上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領(lǐng)下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。安徽基因SNP分型機(jī)構(gòu)一次研究的SNP大概有十幾個(gè)到幾十個(gè)，這是比較早期的做法。
RFLP法的優(yōu)點(diǎn)是分型技術(shù)簡單，結(jié)果判斷容易，不需要昂貴的設(shè)備，成本低，并且實(shí)驗(yàn)人員培訓(xùn)簡單。但是通過SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低，很多SNP位點(diǎn)不能采用這種方法進(jìn)行檢測，而且有的限制性酶價(jià)格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高，容易出現(xiàn)假陽性結(jié)果，且工作量大，耗時(shí)長，通量低。這是早期的一種SNP分型技術(shù)，在通量和效率上難以滿足批量分型需求，因此這種技術(shù)目前只在個(gè)別實(shí)驗(yàn)室中還在使用中。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司
上機(jī)測序后，每個(gè)樣本同一個(gè)SNP位置可以讀到數(shù)十或數(shù)百條reads（具體取決于測序通量），并且能夠清晰看到每條序列的具體信息，通過對SNP位點(diǎn)的聚類分析，實(shí)現(xiàn)位點(diǎn)基因型的判斷。大規(guī)模樣本中二等位基因reads比分布結(jié)果，每一個(gè)點(diǎn)一個(gè)樣本一個(gè)SNP位點(diǎn)的聚類結(jié)果，兩端表示純和，中間表示雜合（理想情況，1/0表示純和，0.5表示雜合）。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司，上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領(lǐng)下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號：上海翼和生物這種選擇具有準(zhǔn)確性高的特點(diǎn)，能夠有效避免形態(tài)學(xué)和環(huán)境因素的干擾，從而極大的縮短育種進(jìn)程。
上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模，提供兩種檢測平臺，分別為：適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù)：PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測反應(yīng))想結(jié)合的檢測技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配，則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行，反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù)，對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?；旌蠘颖竞?，在illumina等主流測序平臺上，對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分不同的樣本，，終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定，相比其他的SNP檢測技術(shù)，基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。江蘇STR基因SNP分型
SNP本身是針對“群體”而言的（within a population）。江蘇STR基因SNP分型技術(shù)服務(wù)
通過風(fēng)險(xiǎn)值估計(jì)、置信區(qū)間和哈溫檢測，作者發(fā)現(xiàn)pre-miR-27a的rs895819位點(diǎn)，AG雜合子或者AA純合子相比GG純合子患MI的風(fēng)險(xiǎn)更低。并且將該位點(diǎn)的AG和AA基因型混合后相對于GG類型，混合后的樣本分組仍然患MI的風(fēng)險(xiǎn)更低。然而在其他4個(gè)前體miRNA的SNP在等位基因和建立的遺傳模型中并沒有發(fā)現(xiàn)與MI的比較明顯關(guān)聯(lián)。上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領(lǐng)下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。江蘇STR基因SNP分型技術(shù)服務(wù)
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司一直專注于第三方檢測服務(wù)；生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)；健康衰老評估；大健康檢測；遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)；生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù)；小鼠遺傳品系鑒定；轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定；細(xì)胞點(diǎn)突變檢測；細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。，是一家醫(yī)藥健康的企業(yè)，擁有自己獨(dú)立的技術(shù)體系。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才，以不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競爭力，加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新，實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司主營業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)，堅(jiān)持“質(zhì)量保證、良好服務(wù)、顧客滿意”的質(zhì)量方針，贏得廣大客戶的支持和信賴。公司深耕細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)，正積蓄著更大的能量，向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。