從對生物的遺傳性狀的影響上來看,cSNP又可分為2種:一種是同義cSNP(synonymouscSNP),即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質(zhì)的氨基酸序列,突變堿基與未突變堿基的含義相同;另一種是非同義cSNP(non-synonymouscS...
SNP全稱SingleNucleotidePolymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些SNP位點直接影響基因功能,從而導致生物性狀改變。SNP是研究人類家族...
上海翼和應用生物技術(shù)有限公司的專家是ATCC細胞認證委員會成員,深得學界信任,2019翼和助力連續(xù)發(fā)表六篇在《Stem Cell Research》雜志上。流程如下:(1)妥善保留干細胞建系供體來源組織或血液;(2)建好的細胞系,連同供體組織,送上海翼和進行S...
專業(yè)的STR數(shù)據(jù)庫,為細胞STR鑒定護航:不同于親子鑒定,其有父/母親樣本的STR數(shù)據(jù)可供對照,而目前所用的細胞系基本已難以找到供體的組織或細胞進行STR比對,因此需要一個包含盡可能多的細胞系的STR數(shù)據(jù)庫(如公安部的指紋庫)來進行檢索/比對。所以,這個庫包含...
小師弟:如何根據(jù)細胞STR鑒定結(jié)果判斷細胞系是否發(fā)生了交叉污染?如果存在細胞系之間發(fā)生交叉污染,而且鑒定用的細胞可能有兩種以上的細胞系時,那么在進行STR位點檢測的時候,多個位點會出現(xiàn)兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有...
如果細胞系沒有在數(shù)據(jù)庫中比對出結(jié)果怎么辦?如果已知數(shù)據(jù)庫中沒有找到你的細胞信息,你可以用自己的細胞遺傳信息建立自己的遺傳特性,以便后期進行自己細胞庫的比對。細胞系交叉污染或錯誤鑒定對研究是否有影響?答案是肯定的。使用錯誤的細胞系或者是被污染的細胞系做研究,只會...
翼和細胞STR鑒定-專業(yè)服務!jin牌品質(zhì)!細胞系STR遺傳質(zhì)量鑒定是上海翼和自2014年起開始推出的專業(yè)服務,翼和是國內(nèi)比較早一批開展細胞系STR遺傳質(zhì)量鑒定服務的公司,迄今為止已有五年的細胞STR鑒定服務經(jīng)驗,十余年的STR分型經(jīng)驗。翼和細胞STR鑒定以專...
《Stem Cell Research》是專門刊登干細胞生物學與應用的雜志,關(guān)注干細胞多能性機制與新建立的干細胞系,當前影響因子接近4.0。該雜志有Research paper, Short communications, Reviews, Technical...
細胞支原體檢測:在細胞研究領(lǐng)域,支原體是臭名昭著的污染源,許多實驗室都深受其害。支原體感ran能在不知不覺中干擾研究結(jié)果,浪費大量的資金投入。上海翼和生物推出細胞支原體檢測服務,特異性擴增高度保守的支原體16S rRNA序列,可以用于檢測非常普遍的支原體種類,...
現(xiàn)如今,大家在購買細胞株的時候,會面臨諸多突出的問題︰①細胞活性不足,收到細胞后存活率不高,導致實驗無法正常進行;②細胞本身的質(zhì)量無法保證,除正規(guī)單位的細胞外,無法確認細胞源本身質(zhì)量;③市場上以次充好、良莠不齊、魚龍混珠的假細胞比比皆是、無法分辨。如果你一不注...
如果細胞系沒有在數(shù)據(jù)庫中比對出結(jié)果怎么辦?如果已知數(shù)據(jù)庫中沒有找到你的細胞信息,你可以用自己的細胞遺傳信息建立自己的遺傳特性,以便后期進行自己細胞庫的比對。細胞系交叉污染或錯誤鑒定對研究是否有影響?答案是肯定的。使用錯誤的細胞系或者是被污染的細胞系做研究,只會...
Hi-SNP 結(jié)合多重 PCR 技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進行多重 PCR 擴增,不同的樣本以不同的 Barcode 引物區(qū)分?;旌蠘颖竞螅?Ion Proton/illumina 主流測序平臺上, 對擴增子進行高通量測序...
上海翼和多倍體擴增子測序SNP分型,結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進行多重PCR擴增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分,對擴增子進行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學方法,區(qū)分不同的樣本。并且將多倍體的不同...
①所謂同源區(qū)段,就是針對一對同源染色體,兩條同源染色體上的相同位置的一個區(qū)段就是同源區(qū)段,對不對?對;②然后同源區(qū)段和等位基因有什么區(qū)別聯(lián)系?同源區(qū)段可以當做同源染色體來理解,那么上面就有等位基因;③是不是如果一個染色體沒有某個同源區(qū)段的話,那就是說他沒有該性...
上海翼和生物根據(jù)具體實驗規(guī)模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務。PCR-LDR SNP分型服務:PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(Ligase Detection Reactio...
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比,比對出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是上海市...
上海翼和生物基于自主知識產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù),結(jié)合特色的生信分析方法,開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴增子測序SNP分型,**提高了SNP分型的準確度。二代測序得到單分子序列信息,通過特色生信分析方法,對混合結(jié)果進行有效拆分,準確地將測序reads比對到亞基...
網(wǎng)絡版本的NCBI在內(nèi)的很多網(wǎng)站都提供了在線的blast服務,是**經(jīng)常用到的blast服務。網(wǎng)絡版本的NCBI優(yōu)點:方便,容易操作,數(shù)據(jù)庫同步更新等優(yōu)點。網(wǎng)絡版本的NCBI缺點:不利于操作大批量的數(shù)據(jù),同時也不能定義搜索的數(shù)據(jù)庫。單機版本的NCBI 通過...
單核苷酸多態(tài)性(SNP)主要應用比較比較常見,主要場景:(1)科研:研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異,如tumour、罕見變異。(2)臨床:用于**易感基因檢測、低頻**游離DNA檢測等。(3)健康:用于**風險評估,家族遺傳咨詢指導、生活方式指導等相關(guān)的大眾消費基...
LDR連接酶檢測法優(yōu)點是適用于任何多態(tài)性位點,基于雜交反應和連接反應,分型結(jié)果準確,可進行多重反應,性價比較高,且實驗靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點檢測而言,LDR法可以實現(xiàn)多位點的同時檢測,提高檢測通量,因此前期需要一定時間構(gòu)建多重分型方案...
RFLP法的優(yōu)點是分型技術(shù)簡單,結(jié)果判斷容易,不需要昂貴的設(shè)備,成本低,并且實驗人員培訓簡單。但是通過SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低,很多SNP位點不能采用這種方法進行檢測,而且有的限制性酶價格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高,容易出現(xiàn)假陽性結(jié)果,且工作...
旁系同源基因(paralogousgene)又譯為“橫向同源基因”、“并系同源基因”或“平行進化同源基因”,是指由于基因復制而產(chǎn)生的同源基因,例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因。基因復制后,進化選擇壓力變小,其中一條基因丟失或發(fā)生沉默,都能促使旁系同源基因分...
TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團連接在探針的5’末端,而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應體系中加入2種不同熒光標記的探針,它們可以分別與2個等位基因完全配對。正常情況下,由于探針5’端熒光基團和3’端淬滅基團緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR有...
序列相似性比較:將待研究序列與DNA或蛋白質(zhì)序列庫進行比較,用于確定該序列的生物屬性,也就是找出與該序列相似的一致序列是什么。完成這一工作只需要使用兩兩序列比較算法。常用的程序包郵BLAST;FASTA等。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學會理事單位,...
旁系同源基因(paralogousgene)又譯為“橫向同源基因”、“并系同源基因”或“平行進化同源基因”,是指由于基因復制而產(chǎn)生的同源基因,例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因?;驈椭坪?,進化選擇壓力變小,其中一條基因丟失或發(fā)生沉默,都能促使旁系同源基因分...
理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個或4個等位多態(tài)性,但實際上,后兩者非常少見,幾乎可以忽略。因此,通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T,在其互補鏈上則為G A),也可能是顛換(C A,G T,C G,A T)。轉(zhuǎn)換的發(fā)...
理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個或4個等位多態(tài)性,但實際上,后兩者非常少見,幾乎可以忽略。通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T,在其互補鏈上則為GA),也可能是顛換(CA,GT,CG,AT)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于...
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比,比對出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是上海市...
上海翼和生物根據(jù)具體實驗規(guī)模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務。PCR-LDR SNP分型服務:PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(Ligase Detection Reactio...
將待檢測片段(包含待測SNP位點)進行PCR擴增并直接進行測序是SNP檢測方法中,準確的一種,堪稱SNP分型的“金標準”。獲得測序峰圖,純和位點為單峰,而雜合位點則為套峰,因此通過查看測序峰圖很容易將基因型區(qū)分開來。直接測序法不僅可用于對已知位點的檢測,還可用...