廣州STR鑒定送樣要求

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-14

《Stem Cell Research》是專門刊登干細(xì)胞生物學(xué)與應(yīng)用的雜志,關(guān)注干細(xì)胞多能性機(jī)制與新建立的干細(xì)胞系,當(dāng)前影響因子接近4.0。該雜志有Research paper, Short communications, Reviews, Technical notes與Lab resource等五大板塊,其中Lab resource目前看起來是比較容易被收錄的,主要收錄新建立的多能干細(xì)胞系。《Stem Cell Research》雜志于2019年進(jìn)入上海翼和生物的視野,并剛過半年,連續(xù)有六篇上海翼和公司協(xié)助干細(xì)胞鑒定的論文登上該雜志。細(xì)胞系用錯(cuò)的概率有多大?廣州STR鑒定送樣要求

細(xì)胞系錯(cuò)誤鑒定問題已有50年歷史,基于國際細(xì)胞庫的分析數(shù)據(jù)顯示:1984年細(xì)胞錯(cuò)誤鑒定率為35%,1999年為18%,直到近幾年,應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的細(xì)胞系需要鑒定的問題仍然很少有人關(guān)注。近年來,大量研究表明 STR 基因分型 方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的比較有效和準(zhǔn)確的方法之一,STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強(qiáng)烈推薦。美國的ATCC 細(xì)胞庫、德國的DSMZ細(xì)胞庫以及日本的JCRB細(xì)胞庫等為STR 分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對。鄭州小鼠STR鑒定數(shù)據(jù)庫比對什么是細(xì)胞系STR鑒定?

STR基因位點(diǎn)由長度為3~7個(gè)堿基對的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列普遍存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。

如何知道細(xì)胞系是否發(fā)生交叉污染了?如果存在細(xì)胞系之間發(fā)生交叉污染,而且鑒定用的細(xì)胞可能有兩種以上的細(xì)胞系時(shí),那么在進(jìn)行STR位點(diǎn)檢測的時(shí)候,多個(gè)位點(diǎn)會出現(xiàn)兩個(gè)以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強(qiáng)度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關(guān)系。因此,存在交叉污染的混合細(xì)胞系中,其中一個(gè)位點(diǎn)中某些峰會明顯高于其他的峰,其中大峰是屬于混合細(xì)胞系中那個(gè)主要細(xì)胞系,而小峰則屬于那個(gè)次要細(xì)胞系。STR鑒定目前已被ICLAC、ATCC等機(jī)構(gòu)作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定,越來越多的雜志要求在投稿時(shí)提供細(xì)胞STR分型數(shù)據(jù)。什么時(shí)候需細(xì)胞系鑒定?

什么時(shí)候需細(xì)胞系鑒定?(1)當(dāng)建立或獲得一個(gè)新的細(xì)胞系時(shí)(2)一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開始/結(jié)束時(shí)(3)在細(xì)胞凍存之前,或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng)2~3個(gè)月時(shí)(4)發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費(fèi)前(5)細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時(shí)(6)當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用超過一種細(xì)胞系時(shí),所有細(xì)胞系比較好先鑒定以排除交叉污染的可能。如何提供鑒定樣本?每種細(xì)胞需單獨(dú)收集在1.5ml離心管中,細(xì)胞數(shù)目不少于 106個(gè)。細(xì)胞需要離心沉淀,并且以PBS清洗盡可能去除上清培養(yǎng)基,沉淀沉淀進(jìn)行冰凍保存與寄送。為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定?杭州小鼠鑒定數(shù)據(jù)庫比對

很專業(yè)的細(xì)胞STR鑒定哪里找?廣州STR鑒定送樣要求

翼和為您普及小知識點(diǎn):作者分別從國內(nèi)28個(gè)研究機(jī)構(gòu)搜集了278株常見人源腫liu細(xì)胞系,其中國內(nèi)建立的細(xì)胞系71株,國外建立的細(xì)胞系207株。經(jīng)STR鑒定后發(fā)現(xiàn),來自于22個(gè)研究機(jī)構(gòu)的128株細(xì)胞存在交叉污染/錯(cuò)誤鑒定的情況,錯(cuò)誤率高達(dá)46%。其中國內(nèi)建立的細(xì)胞系占52株,這表明了什么,國內(nèi)建立的細(xì)胞系交叉污染/錯(cuò)誤鑒定率竟然高達(dá)73.2%,并且67.3%(35/52)國內(nèi)交叉污染/錯(cuò)誤鑒定的細(xì)胞系結(jié)果被證實(shí)是Hela細(xì)胞或被Hela細(xì)胞部分污染的!廣州STR鑒定送樣要求

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