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上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測(cè)平臺(tái),分別為:適合中低通量檢測(cè)的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDR SNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(Ligase Detection Reaction,連接酶檢測(cè)反應(yīng))想結(jié)合的檢測(cè)技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別。高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類(lèi)型的堿基錯(cuò)配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?;旌蠘颖竞?,在illumina 等主流測(cè)序平臺(tái)上,對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測(cè)序能一次對(duì)幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,相比其他的SNP檢測(cè)技術(shù),基于高通量測(cè)序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。二代測(cè)序SNP分型,針對(duì)同源片段數(shù)量比較少的區(qū)段,PCR擴(kuò)增后建庫(kù)時(shí),隨機(jī)抽樣抽到目的片段的概率比較高。上海高同源分型送樣要求
上機(jī)測(cè)序后,每個(gè)樣本同一個(gè)SNP位置可以讀到數(shù)十或數(shù)百條reads(具體取決于測(cè)序通量),并且能夠清晰看到每條序列的具體信息,通過(guò)對(duì)SNP位點(diǎn)的聚類(lèi)分析,實(shí)現(xiàn)位點(diǎn)基因型的判斷。大規(guī)模樣本中二等位基因reads比分布結(jié)果,每一個(gè)點(diǎn)**一個(gè)樣本一個(gè)SNP位點(diǎn)的聚類(lèi)結(jié)果,兩端表示純和,中間表示雜合(理想情況,1/0表示純和,0.5表示雜合)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào):上海翼和生物山東分型公司在植物基因組研究中,大量的多倍體植物基因組中同樣存在大量的高同源序列。
SNP挑選:(1)SNP位于非編碼區(qū);(2)SNP平均分布在29條常染色體上;(3),小等位基因頻度(MAF)需大于30%,保證位點(diǎn)有足夠多態(tài)性;SNP鑒定方法~翼和Hi-SNP:59個(gè)SNP采用上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司的Hi-SNP技術(shù),由本公司實(shí)施多重PCR建庫(kù)與illumina X-10測(cè)序。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類(lèi)分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。
RFLP法的優(yōu)點(diǎn)是分型技術(shù)簡(jiǎn)單,結(jié)果判斷容易,不需要昂貴的設(shè)備,成本低,并且實(shí)驗(yàn)人員培訓(xùn)簡(jiǎn)單。但是通過(guò)SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低,很多SNP位點(diǎn)不能采用這種方法進(jìn)行檢測(cè),而且有的限制性酶價(jià)格昂貴并且不容易買(mǎi)到。通常酶切的條件較高,容易出現(xiàn)假陽(yáng)性結(jié)果,且工作量大,耗時(shí)長(zhǎng),通量低。這是早期的一種SNP分型技術(shù),在通量和效率上難以滿足批量分型需求,因此這種技術(shù)目前只在個(gè)別實(shí)驗(yàn)室中還在使用中。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個(gè)堿基的變異,這種變異可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換或顛換所引起。
隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及,相比Sanger測(cè)序,二代測(cè)序雖然降低了測(cè)序讀長(zhǎng),但是**增加的測(cè)序通量同時(shí)大幅降低測(cè)序成本。利用二代測(cè)序進(jìn)行SNP分型,不僅測(cè)序讀長(zhǎng)滿足分型需求,并且可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn),上千樣本進(jìn)行分型。二代測(cè)序結(jié)果判斷準(zhǔn)確直觀,相比RFLP,Taqman,LDR等方法都通過(guò)間接結(jié)果來(lái)進(jìn)行分型結(jié)果的判定,直接測(cè)序或二代測(cè)序法分型能都直接看到位點(diǎn)具體序列情況,SNP位點(diǎn)判斷更加直觀。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年歷史。傳統(tǒng)的SNP檢測(cè)方法是采用一些已有的成熟技術(shù),如DNA測(cè)序、等位基因特異的寡聚核苷酸雜交(ASO)等。北京同源序列SNP分型技術(shù)服務(wù)
普通的二代測(cè)序SNP分型,利用生信分析手段剔除HSVs、PSVs,難度比較高。上海高同源分型送樣要求
兩條高度相似的序列可能不存在同源性;同樣的,同源序列的相似性也可能很低。例如兩條同源序列的相似性比對(duì)結(jié)果不明顯,但如果它們?cè)诮Y(jié)構(gòu)上相似性上明顯,或者它們都與第三條序列的相似性明顯,那么它們顯然是同源序列。因此,當(dāng)相似性搜索發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著的匹配時(shí),我們可以放心地推斷出這兩個(gè)序列是同源的。但是,如果在數(shù)據(jù)庫(kù)中找不到翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測(cè)序和二代高通量測(cè)序平臺(tái)的多種檢測(cè)技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測(cè)和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。統(tǒng)計(jì)上顯著的匹配項(xiàng),則不能確定沒(méi)有同源物。上海高同源分型送樣要求
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司主營(yíng)品牌有Biowing,發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,該公司服務(wù)型的公司。公司是一家私營(yíng)有限責(zé)任公司企業(yè),以誠(chéng)信務(wù)實(shí)的創(chuàng)業(yè)精神、專業(yè)的管理團(tuán)隊(duì)、踏實(shí)的職工隊(duì)伍,努力為廣大用戶提供高品質(zhì)的產(chǎn)品。公司業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù),價(jià)格合理,品質(zhì)有保證,深受廣大客戶的歡迎。翼和生物順應(yīng)時(shí)代發(fā)展和市場(chǎng)需求,通過(guò)高端技術(shù),力圖保證高規(guī)格高質(zhì)量的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)。