TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團(tuán)連接在探針的5’末端,而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應(yīng)體系中加入2種不同熒光標(biāo)記的探針,它們可以分別與2個(gè)等位基因完全配對(duì)。正常情況下,由于探針5’端熒光基團(tuán)和3’端淬滅基團(tuán)緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR有效的進(jìn)行,與模板完全配對(duì)的探針逐步被TaqDNA聚合酶5’——3’外切酶活性切割,致使探針5’端熒光基團(tuán)和3’端淬滅基團(tuán)分離,淬滅效應(yīng)解除,報(bào)告熒光基團(tuán)被,檢測(cè)到熒光信號(hào),相反,如果模板不能完全配對(duì)的探針(另一種等位基因)不能被有效切割,因此檢測(cè)不到熒光信號(hào),從而實(shí)現(xiàn)SNP位點(diǎn)的分型檢測(cè)。組成DNA的堿基雖然有4種,但SNP一般只有兩種堿...
TaqMan熒光探針?lè)▋?yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)單,準(zhǔn)確性高(閉管進(jìn)行,減少污染),判讀也很方便,認(rèn)可度高;適合多樣本,少位點(diǎn)。但是其也有不可忽視的限制性,如探針合成耗時(shí)較長(zhǎng),價(jià)格昂貴,為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量,一般大家會(huì)選擇A公司合成。TaqMan熒光探針?lè)ㄒ话銥橹挥袔讉€(gè)位點(diǎn)時(shí)適用,并且對(duì)樣本的質(zhì)量要求較高,除了樣本無(wú)降解外,要需要濃度盡可能的一致。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司,地址:上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502目前已有多種方法可用于SNP檢測(cè),如根據(jù)DNA列陣的微測(cè)序法、DNA芯片以及TaqMan系統(tǒng)等。杭州STRSNP分型質(zhì)量好相信大家都聽(tīng)過(guò)或已經(jīng)接觸過(guò)一些常用的分型方法,如片段長(zhǎng)度...
SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,主要特點(diǎn)是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大,主要方法是TaqMan探針?lè)āJ紫韧ㄟ^(guò)PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,然后通過(guò)序列特異性引物實(shí)現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時(shí)納秒(10-9s)強(qiáng)激光激發(fā)。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子,由于電場(chǎng)中離子飛行時(shí)間與離子質(zhì)量成反比,通過(guò)檢測(cè)核酸分子在真空管中的飛行時(shí)間而獲得樣品分析物的精確分子量,從而檢測(cè)出SNP位點(diǎn)信息。在經(jīng)濟(jì)作物育種領(lǐng)域,檢測(cè)SNP可實(shí)現(xiàn)對(duì)所需性狀的早期選擇。蘇州SSR基因SNP分型售后服務(wù)周到隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及,相比Sanger測(cè)序,以降低測(cè)序...
目前市場(chǎng)上有多個(gè)廠家提供HRM分析的儀器,包括IdahoTechnology、Corbett(QIAGEN)、Roche等,有些是HRM的儀器,有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國(guó)猶他大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Wittwer實(shí)驗(yàn)室曾評(píng)估了市場(chǎng)上多臺(tái)儀器在基因分型和突變掃描上的性能1。他們發(fā)現(xiàn),對(duì)于大部分儀器的準(zhǔn)確基因分型來(lái)說(shuō),主要限制在于平板上的空間溫度差異(Tm的標(biāo)準(zhǔn)偏差為0.020-0.264°C)。其它差異如數(shù)據(jù)密度、信噪比和熔解速率,也會(huì)影響雜合體的掃描。經(jīng)過(guò)比較發(fā)現(xiàn),空氣加熱型儀器以及樣品溫度單獨(dú)控制的儀器有著更低的Tm標(biāo)準(zhǔn)偏差(0.018-0.065),而加熱塊型儀器則在0...
上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測(cè)平臺(tái),分別為:適合中低通量檢測(cè)的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測(cè)反應(yīng))想結(jié)合的檢測(cè)技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別。高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類(lèi)型的堿基錯(cuò)配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不...
經(jīng)常會(huì)碰到有人詢問(wèn),如何查詢某特定區(qū)段內(nèi)的SNP信息。下面小E就整理了一下如何利用千人基因組計(jì)劃數(shù)據(jù)庫(kù),查詢所有SNP位點(diǎn)的信息。輸入千人基因組網(wǎng)址,打開(kāi)千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)。假設(shè)小明要查詢“chr10:30301729-30348488”這段距離的SNP數(shù)據(jù),在輸入框中輸入染色體區(qū)段位置,點(diǎn)擊“Go”。千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)采用GRCh37版本。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品?,F(xiàn)在國(guó)外的趨勢(shì)更傾向于,對(duì)于某一疾病的重要候選基因.南京微衛(wèi)星SSRSNP分型周期1、SNP數(shù)量多,分布...
TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團(tuán)連接在探針的5’末端,而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應(yīng)體系中加入2種不同熒光標(biāo)記的探針,它們可以分別與2個(gè)等位基因完全配對(duì)。正常情況下,由于探針5’端熒光基團(tuán)和3’端淬滅基團(tuán)緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR有效的進(jìn)行,與模板完全配對(duì)的探針逐步被TaqDNA聚合酶5’——3’外切酶活性切割,致使探針5’端熒光基團(tuán)和3’端淬滅基團(tuán)分離,淬滅效應(yīng)解除,報(bào)告熒光基團(tuán)被,檢測(cè)到熒光信號(hào),相反,如果模板不能完全配對(duì)的探針(另一種等位基因)不能被有效切割,因此檢測(cè)不到熒光信號(hào),從而實(shí)現(xiàn)SNP位點(diǎn)的分型檢測(cè)。高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP...
高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡(jiǎn)稱(chēng)HRM)分析是一門(mén)新興的技術(shù)。它通過(guò)PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測(cè)PCR片段的微小序列差異,從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對(duì)和基因分型等多個(gè)方面。憑借其速度和簡(jiǎn)便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實(shí)雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀(jì)六十年代,當(dāng)時(shí)是通過(guò)紫外吸收來(lái)監(jiān)測(cè)的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個(gè)小時(shí)才能完成。后來(lái),LightCycler定量PCR儀的出現(xiàn),讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細(xì)管而縮減至納克級(jí),且熔解速率更快,達(dá)0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時(shí)間縮短...
SNP全稱(chēng)SingleNucleotidePolymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標(biāo)記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些SNP位點(diǎn)直接影響基因功能,從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP是研究人類(lèi)家族和動(dòng)植物品系遺傳變異的重要依據(jù),因此被比較常見(jiàn)用于群體遺傳學(xué)研究和疾病相關(guān)基因的研究。上海翼和應(yīng)用生物公司開(kāi)展此業(yè)務(wù)有十余年了,技術(shù)水平過(guò)硬和售后服務(wù)周到,得到客戶的一致好評(píng),而且價(jià)格優(yōu)惠。SNP一般來(lái)說(shuō),是全部體細(xì)胞一樣的基因型(除開(kāi)嵌合體)。北京微衛(wèi)星標(biāo)記strSNP分型機(jī)構(gòu)為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點(diǎn),作者選擇了包括Cg_GD1基...
相信大家都聽(tīng)過(guò)或已經(jīng)接觸過(guò)一些常用的分型方法,如片段長(zhǎng)度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法,直接測(cè)序法,Taqman熒光探針?lè)?,LDR連接酶檢測(cè)反應(yīng)法,競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法(KASP),二代測(cè)序法等,小E就針對(duì)以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。SNP在基礎(chǔ)研究領(lǐng)域發(fā)揮著巨大作用。廣東微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型LDR連接酶檢測(cè)法優(yōu)點(diǎn)是適用于任何多態(tài)性位點(diǎn),基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng),分型結(jié)果準(zhǔn)確,可進(jìn)行多重反應(yīng),性價(jià)比較...
《CandidateGenePolymorphismsandtheirAssociationwithGlycogenContentinthePacificOysterCrassostreagigas》本文作者在野生群體中進(jìn)行了候選基因關(guān)聯(lián)分析,選擇90個(gè)候選基因以及295個(gè)SNP位點(diǎn),并且結(jié)合目標(biāo)基因捕獲測(cè)序分型732個(gè)SNP位點(diǎn)。發(fā)現(xiàn)Cg_GD1基因(glycogendebranchingenzyme)中的兩個(gè)SNP位點(diǎn)(Cg_SNP_TY202andCg_SNP_3021)inCg_GD1(glycogendebranchingenzyme)和Cg_GP1基因(glycogenphosph...
從對(duì)生物的遺傳性狀的影響上來(lái)看,cSNP又可分為2種:一種是同義cSNP(synonymouscSNP),即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質(zhì)的氨基酸序列,突變堿基與未突變堿基的含義相同;另一種是非同義cSNP(non-synonymouscSNP),指堿基序列的改變可使以其為藍(lán)本翻譯的蛋白質(zhì)序列發(fā)生改變,從而影響了蛋白質(zhì)的功能。這種改變常是導(dǎo)致生物性狀改變的直接原因。cSNP中約有一半為非同義cSNP。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。也可由堿基的插入或缺失所致...
連接酶檢測(cè)反應(yīng)(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別,高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類(lèi)型的堿基錯(cuò)配,連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法,對(duì)SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有長(zhǎng)度差異的探針,當(dāng)探針末端與模板有一個(gè)堿基不配對(duì),所以連接反應(yīng)不能進(jìn)行,沒(méi)有連接產(chǎn)物;相反,若探針與模板DNA完全互補(bǔ),故進(jìn)行連接反應(yīng),通過(guò)溫控循環(huán),該特異性連接反應(yīng)可反復(fù)進(jìn)行,達(dá)到線性擴(kuò)增的效果。,后通過(guò)熒光掃描片段長(zhǎng)度,實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP位點(diǎn)的檢測(cè)。SNP自身的特性決定了它更適合于對(duì)復(fù)雜性狀與疾病的遺傳解剖以及基于群體的基因識(shí)別等方面的研究...
高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡(jiǎn)稱(chēng)HRM)分析是一門(mén)新興的技術(shù)。它通過(guò)PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測(cè)PCR片段的微小序列差異,從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對(duì)和基因分型等多個(gè)方面。憑借其速度和簡(jiǎn)便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實(shí)雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀(jì)六十年代,當(dāng)時(shí)是通過(guò)紫外吸收來(lái)監(jiān)測(cè)的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個(gè)小時(shí)才能完成。后來(lái),LightCycler定量PCR儀的出現(xiàn),讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細(xì)管而縮減至納克級(jí),且熔解速率更快,達(dá)0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時(shí)間縮短...
單核苷酸多態(tài)性(SNP)主要應(yīng)用比較比較常見(jiàn),主要場(chǎng)景:(1)科研:研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異,如tumour、罕見(jiàn)變異。(2)臨床:用于tumour易感基因檢測(cè)、低頻tumour游離DNA檢測(cè)等。(3)健康:用于tumour風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,家族遺傳咨詢指導(dǎo)、生活方式指導(dǎo)等相關(guān)的大眾消費(fèi)基因檢測(cè)。(4)農(nóng)業(yè):用于品系鑒定、全基因組掃描、優(yōu)勢(shì)性狀篩選等。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。由于SNP的二態(tài)性,非此即彼,在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的...
單核苷酸多態(tài)性(SNP)主要應(yīng)用比較比較常見(jiàn),主要場(chǎng)景:(1)科研:研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異,如tumour、罕見(jiàn)變異。(2)臨床:用于tumour易感基因檢測(cè)、低頻tumour游離DNA檢測(cè)等。(3)健康:用于tumour風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,家族遺傳咨詢指導(dǎo)、生活方式指導(dǎo)等相關(guān)的大眾消費(fèi)基因檢測(cè)。(4)農(nóng)業(yè):用于品系鑒定、全基因組掃描、優(yōu)勢(shì)性狀篩選等。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。由于SNP的二態(tài)性,非此即彼,在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的...
二代測(cè)序法主要通過(guò)PCR的方法,對(duì)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行特異性捕獲。為了提型的通量,目前多采用多重PCR的方法同時(shí)對(duì)多個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行捕獲(可同時(shí)對(duì)1-100位點(diǎn)進(jìn)行分型)。由于二代測(cè)序通量是足夠滿足數(shù)百數(shù)千樣本的同時(shí)測(cè)序,因此需要對(duì)不同的樣本添加的樣本標(biāo)簽(Barcode),從而在后續(xù)數(shù)據(jù)分析過(guò)程中,能夠進(jìn)行樣本拆分。因此在多重PCR完成輪多SNP位點(diǎn)捕獲后,需要進(jìn)行第二輪PCR,在輪PCR產(chǎn)物的基礎(chǔ)上,添加樣本樣本標(biāo)簽及測(cè)序接頭等序列。通過(guò)PCR條件優(yōu)化,目前亦可實(shí)現(xiàn)一次反應(yīng),兩輪PCR接力完成的效果。但是只要這個(gè)突變?nèi)簺](méi)有達(dá)到總?cè)后w的1%,它就只是一個(gè)突變株/系。達(dá)到了1%就是多態(tài)性了。浙江微衛(wèi)星...
隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及,相比Sanger測(cè)序,以降低測(cè)序讀長(zhǎng)的前提,極大增加的測(cè)序通量同時(shí)大幅降低測(cè)序成本。利用二代測(cè)序進(jìn)行SNP分型,不僅測(cè)序讀長(zhǎng)滿足分型需求,可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn),上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測(cè)序法,除了保留測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)外,彌補(bǔ)了其通量不足的限制,二代測(cè)序分型法也正在快速在領(lǐng)域內(nèi)推廣。無(wú)錫分公司(無(wú)錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司)地址:無(wú)錫市濱湖區(qū)梅梁西路138號(hào)七號(hào)樓一樓。微信公眾號(hào):上海翼和生物目前在nature genetics和cell這樣的雜志,也不乏SNP的文章。北京SSR基因SNP分型高通量二代測(cè)序法SNP基因分型——你有我有,你沒(méi)有我也有:上海翼和應(yīng)用生...
SNP位點(diǎn)信息:人類(lèi)基因組需SNP位點(diǎn)的rs號(hào);其它物種如牛、雞、魚(yú)、水稻、玉米等無(wú)rs號(hào)的,需SNP位點(diǎn)上下游各250bp的確切序列、SNP位點(diǎn)突變類(lèi)型、以及位點(diǎn)上下游25bp內(nèi)是否存在其它位點(diǎn)。(二代測(cè)序SNP基因分型)送樣注意事項(xiàng):1.此分型方法適用于15-500個(gè)位點(diǎn),樣本數(shù)目為數(shù)百至數(shù)千的高通量檢測(cè);2.樣本寄送前請(qǐng)與本公司工作人員取得聯(lián)系,確認(rèn)樣本寄送時(shí)間、方式、數(shù)量和收件人信息;3.請(qǐng)?jiān)偃_認(rèn)盛放樣本的容器密封,可使用封口膜,不推薦錫箔紙、保鮮膜等密封方式;這種選擇具有準(zhǔn)確性高的特點(diǎn),能夠有效避免形態(tài)學(xué)和環(huán)境因素的干擾,從而極大的縮短育種進(jìn)程。無(wú)錫基因SNP分型報(bào)告通過(guò)對(duì)病例組和...
片段長(zhǎng)度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過(guò)PCR擴(kuò)增目的片段DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段,直接通過(guò)凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位點(diǎn)分布不同,產(chǎn)生不同長(zhǎng)度的DN*段條帶。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào):上海翼和生物探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。安徽微衛(wèi)星SSRSNP分型哪里好高通量二代測(cè)序...
將待檢測(cè)片段(包含待測(cè)SNP位點(diǎn))進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中,準(zhǔn)確的一種,堪稱(chēng)SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖,純和位點(diǎn)為單峰,而雜合位點(diǎn)則為套峰,因此通過(guò)查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開(kāi)來(lái)。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè),還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點(diǎn)。直接測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)是結(jié)果準(zhǔn)確,能發(fā)現(xiàn)未知位點(diǎn),但是其缺點(diǎn)是通量低,成本高。因此直接測(cè)序法適用于少位點(diǎn),少樣本的分型規(guī)模,當(dāng)然土豪實(shí)驗(yàn)室除外!所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實(shí)驗(yàn)中得到推廣。組成DNA的堿基雖然有4種,但SNP一般只有兩種堿基組成。STRSNP分型準(zhǔn)確度高《CandidateGenePolymor...
隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及,相比Sanger測(cè)序,以降低測(cè)序讀長(zhǎng)的前提,極大增加的測(cè)序通量同時(shí)大幅降低測(cè)序成本。利用二代測(cè)序進(jìn)行SNP分型,不僅測(cè)序讀長(zhǎng)滿足分型需求,可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn),上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測(cè)序法,除了保留測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)外,彌補(bǔ)了其通量不足的限制,二代測(cè)序分型法也正在快速在領(lǐng)域內(nèi)推廣。無(wú)錫分公司(無(wú)錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司)地址:無(wú)錫市濱湖區(qū)梅梁西路138號(hào)七號(hào)樓一樓。微信公眾號(hào):上海翼和生物主要特點(diǎn)是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大,主要方法是TaqMan探針?lè)āU憬⑿l(wèi)星SSRSNP分型質(zhì)量好上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗(yàn)的專(zhuān)業(yè)遺傳學(xué)服務(wù)供應(yīng)商。...
目前市場(chǎng)上有多個(gè)廠家提供HRM分析的儀器,包括IdahoTechnology、Corbett(QIAGEN)、Roche等,有些是HRM的儀器,有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國(guó)猶他大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Wittwer實(shí)驗(yàn)室曾評(píng)估了市場(chǎng)上多臺(tái)儀器在基因分型和突變掃描上的性能1。他們發(fā)現(xiàn),對(duì)于大部分儀器的準(zhǔn)確基因分型來(lái)說(shuō),主要限制在于平板上的空間溫度差異(Tm的標(biāo)準(zhǔn)偏差為0.020-0.264°C)。其它差異如數(shù)據(jù)密度、信噪比和熔解速率,也會(huì)影響雜合體的掃描。經(jīng)過(guò)比較發(fā)現(xiàn),空氣加熱型儀器以及樣品溫度單獨(dú)控制的儀器有著更低的Tm標(biāo)準(zhǔn)偏差(0.018-0.065),而加熱塊型儀器則在0...
上機(jī)測(cè)序后,每個(gè)樣本同一個(gè)SNP位置可以讀到數(shù)十或數(shù)百條reads(具體取決于測(cè)序通量),并且能夠清晰看到每條序列的具體信息,通過(guò)對(duì)SNP位點(diǎn)的聚類(lèi)分析,實(shí)現(xiàn)位點(diǎn)基因型的判斷。大規(guī)模樣本中二等位基因reads比分布結(jié)果,每一個(gè)點(diǎn)一個(gè)樣本一個(gè)SNP位點(diǎn)的聚類(lèi)結(jié)果,兩端表示純和,中間表示雜合(理想情況,1/0表示純和,0.5表示雜合)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司,上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào):上海翼和生物對(duì)于SNP 研究,我個(gè)人的感覺(jué)是:曾經(jīng)非常的“熱”過(guò),而...
相信對(duì)研究遺傳學(xué)及相關(guān)方向的老濕和童鞋來(lái)說(shuō),SNP肯定是,不陌生的名詞,它是人類(lèi)可遺傳的變異中,常見(jiàn)的一種。大量存在的SNP位點(diǎn),使人們有機(jī)會(huì)發(fā)現(xiàn)與各種疾病相關(guān)的基因組突變。小明:濕兄,濕兄!老濕讓我找SNP位點(diǎn),要怎么找呀?濕兄:淡定!說(shuō)清楚問(wèn)題~小明:我的課題不是將目標(biāo)區(qū)段鎖定在10號(hào)染色體的一個(gè)區(qū)段嘛,我需要從里面找出SNP位點(diǎn)來(lái)進(jìn)行大樣本分型,但是這位點(diǎn)怎么選才好呢?濕兄:那你可以先把區(qū)段內(nèi)的SNP位點(diǎn)下載下來(lái)。小E:我知道,我知道!SNP自身的特性決定了它更適合于對(duì)復(fù)雜性狀與疾病的遺傳解剖以及基于群體的基因識(shí)別等方面的研究。蘇州SSRSNP分型準(zhǔn)確度高SNP(單核苷酸多態(tài)性)是,新發(fā)...
片段長(zhǎng)度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過(guò)PCR擴(kuò)增目的片段DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段,直接通過(guò)凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位點(diǎn)分布不同,產(chǎn)生不同長(zhǎng)度的DN*段條帶。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào):上海翼和生物傳統(tǒng)的RFLP只能檢測(cè)到SNP的一部分,測(cè)序技術(shù)既費(fèi)時(shí)費(fèi)力。廣東SNP分型送樣要求理論上講,SNP既可能是二等位多...
SNP位點(diǎn)信息:人類(lèi)基因組需SNP位點(diǎn)的rs號(hào);其它物種如牛、雞、魚(yú)、水稻、玉米等無(wú)rs號(hào)的,需SNP位點(diǎn)上下游各250bp的確切序列、SNP位點(diǎn)突變類(lèi)型、以及位點(diǎn)上下游25bp內(nèi)是否存在其它位點(diǎn)。(二代測(cè)序SNP基因分型)送樣注意事項(xiàng):1.此分型方法適用于15-500個(gè)位點(diǎn),樣本數(shù)目為數(shù)百至數(shù)千的高通量檢測(cè);2.樣本寄送前請(qǐng)與本公司工作人員取得聯(lián)系,確認(rèn)樣本寄送時(shí)間、方式、數(shù)量和收件人信息;3.請(qǐng)?jiān)偃_認(rèn)盛放樣本的容器密封,可使用封口膜,不推薦錫箔紙、保鮮膜等密封方式;SNP自身的特性決定了它更適合于對(duì)復(fù)雜性狀與疾病的遺傳解剖以及基于群體的基因識(shí)別等方面的研究。江蘇微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型準(zhǔn)確度...
高通量二代測(cè)序法SNP基因分型——你有我有,你沒(méi)有我也有:上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司通過(guò)自主研發(fā)的高重PCR技術(shù),擴(kuò)增引物經(jīng)修飾及優(yōu)化,克服了傳統(tǒng)多重PCR擴(kuò)增效率不均一問(wèn)題,95%以上擴(kuò)增子的測(cè)序深度在平均測(cè)序深度的0.2X范圍,保證測(cè)序通量的有效利用?;诔咧豍CR技術(shù)平臺(tái)的高通量二代SNP分型服務(wù),適用于多種遺傳學(xué)研究領(lǐng)域,如疾病與基因的關(guān)聯(lián)分析,臨床分子診斷研究,QTL定位及分子育種等大規(guī)模多位點(diǎn)大樣本的SNP分析。這種選擇具有準(zhǔn)確性高的特點(diǎn),能夠有效避免形態(tài)學(xué)和環(huán)境因素的干擾,從而極大的縮短育種進(jìn)程。無(wú)錫SSRSNP分型外包服務(wù)隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及,相比Sanger測(cè)序,二代測(cè)...
高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡(jiǎn)稱(chēng)HRM)分析是一門(mén)新興的技術(shù)。它通過(guò)PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測(cè)PCR片段的微小序列差異,從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對(duì)和基因分型等多個(gè)方面。憑借其速度和簡(jiǎn)便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實(shí)雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀(jì)六十年代,當(dāng)時(shí)是通過(guò)紫外吸收來(lái)監(jiān)測(cè)的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個(gè)小時(shí)才能完成。后來(lái),LightCycler定量PCR儀的出現(xiàn),讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細(xì)管而縮減至納克級(jí),且熔解速率更快,達(dá)0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時(shí)間縮短...
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗(yàn)的專(zhuān)業(yè)遺傳學(xué)服務(wù)供應(yīng)商。公司的首席科學(xué)家為肖君華教授(東華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)研究所教授;中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)理事;上海市遺傳學(xué)會(huì)常務(wù)理事)。公司擁有兩大專(zhuān)業(yè)平臺(tái):基于一代測(cè)序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺(tái);基于多重PCR捕獲建庫(kù)技術(shù)的二代測(cè)序平臺(tái)。為順應(yīng)市場(chǎng)需求,公司在2019年開(kāi)拓了個(gè)人基因檢測(cè)業(yè)務(wù)。目前已開(kāi)展心血管個(gè)體化用藥相關(guān)基因的檢測(cè),孕婦葉酸及鈣代謝兩項(xiàng)基因檢測(cè)業(yè)務(wù)。兩項(xiàng)基因檢測(cè)均基于翼和一代測(cè)序平臺(tái)的PCR-LDRSNP基因分型方法。DNA芯片技術(shù)是近年來(lái)新開(kāi)發(fā)的一種DNA序列變異檢測(cè)工具。蘇州微衛(wèi)星SSRSNP分型分析二代測(cè)...