上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測反應(yīng))想結(jié)合的檢測技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?;旌蠘颖竞螅趇llumina等主流測序平臺上,對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。在基因組DNA中,任何堿基均有可能發(fā)生變異,因此SNP既有可能在基因序列內(nèi)。蘇州基因SNP分型哪里好
高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡稱HRM)分析是一門新興的技術(shù)。它通過PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測PCR片段的微小序列差異,從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對和基因分型等多個方面。憑借其速度和簡便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實(shí)雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀(jì)六十年代,當(dāng)時是通過紫外吸收來監(jiān)測的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個小時才能完成。后來,LightCycler定量PCR儀的出現(xiàn),讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細(xì)管而縮減至納克級,且熔解速率更快,達(dá)0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時間縮短至幾分鐘。當(dāng)時使用的染料是SYBR?GreenI。蘇州SSRSNP分型公司SNP是多態(tài)性中的一種,只是進(jìn)一步限定了差異只是單堿基。
LDR連接酶檢測法優(yōu)點(diǎn)是適用于任何多態(tài)性位點(diǎn),基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng),分型結(jié)果準(zhǔn)確,可進(jìn)行多重反應(yīng),性價比較高,且實(shí)驗(yàn)靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點(diǎn)檢測而言,LDR法可以實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)的同時檢測,提高檢測通量,因此前期需要一定時間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續(xù)樣本的分型需求,提高實(shí)驗(yàn)通量的同時降低分型單價。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部在上海,2011年無錫成立分公司無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司
5.IlluminaBeadXpress法采用Illumina公司的BeadXpress系統(tǒng)進(jìn)行批量SNP位點(diǎn)檢測,可以同時檢測1-384個SNP位點(diǎn),往往用于基因組芯片結(jié)果確認(rèn),適合高通量檢測。微珠芯片具有高密度、高重復(fù)性、高靈敏度、低上樣量、定制靈活等特點(diǎn),極高的集成密度,從而獲得極高的檢測篩選速度,在高通量篩選時可比較明顯降低成本。時間飛行質(zhì)譜(MALDI-TOF)完成的SNP檢測準(zhǔn)確率可達(dá)99.9%,除了準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大、檢測周期短等優(yōu)勢外,,有吸引力的應(yīng)該還是它的性價比。飛行時間質(zhì)譜平臺(MALDI-TOF)是國際通用的基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)的研究平臺,該方法憑借其科學(xué)性和準(zhǔn)確性已經(jīng)成為該領(lǐng)域的新標(biāo)準(zhǔn)。SNP在人類基因組中普遍存在,平均每500~1000個堿基對中就有1個,估計其總數(shù)可達(dá)300萬個甚至更多。
上機(jī)測序后,每個樣本同一個SNP位置可以讀到數(shù)十或數(shù)百條reads(具體取決于測序通量),并且能夠清晰看到每條序列的具體信息,通過對SNP位點(diǎn)的聚類分析,實(shí)現(xiàn)位點(diǎn)基因型的判斷。大規(guī)模樣本中二等位基因reads比分布結(jié)果,每一個點(diǎn)一個樣本一個SNP位點(diǎn)的聚類結(jié)果,兩端表示純和,中間表示雜合(理想情況,1/0表示純和,0.5表示雜合)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司,上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號:上海翼和生物突變一般不是一個個體全部細(xì)胞的變化。南京SSR基因SNP分型哪里好
DNA分子雜交、引物延伸、等位基因特異的寡核苷酸連接反應(yīng)、側(cè)翼探針切割反應(yīng)以及基于這些方法的變通技術(shù).蘇州基因SNP分型哪里好
以上就是小E對幾種SNP分型技術(shù)的簡單介紹,大家可以看出分型技術(shù)多種多樣,各有各的優(yōu)點(diǎn)和限制。大家需要綜合考慮實(shí)驗(yàn)的各方面情況,如實(shí)驗(yàn)規(guī)模(多少位點(diǎn),多少樣本),實(shí)驗(yàn)周期,實(shí)驗(yàn)預(yù)算等,然后選擇一個適合自己實(shí)驗(yàn)的分型技術(shù)。上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。蘇州基因SNP分型哪里好
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主,是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊(duì)。公司以誠信為本,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù),我們本著對客戶負(fù)責(zé),對員工負(fù)責(zé),更是對公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,爭取做到讓每位客戶滿意。公司憑著雄厚的技術(shù)力量、飽滿的工作態(tài)度、扎實(shí)的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德,樹立了良好的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)形象,贏得了社會各界的信任和認(rèn)可。