上海微衛(wèi)星標記strSNP分型分析

來源: 發(fā)布時間:2021-11-09

上海翼和應用生物技術有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗的專業(yè)遺傳學服務供應商。公司的首席科學家為肖君華教授(東華大學生物科學與技術研究所教授;中國遺傳學會理事;上海市遺傳學會常務理事)。公司擁有兩大專業(yè)平臺:基于一代測序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺;基于多重PCR捕獲建庫技術的二代測序平臺。為順應市場需求,公司在2019年開拓了個人基因檢測業(yè)務。目前已開展心血管個體化用藥相關基因的檢測,孕婦葉酸及鈣代謝兩項基因檢測業(yè)務。兩項基因檢測均基于翼和一代測序平臺的PCR-LDRSNP基因分型方法。單核苷酸多態(tài)性(SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)。上海微衛(wèi)星標記strSNP分型分析

目前市場上有多個廠家提供HRM分析的儀器,包括IdahoTechnology、Corbett(QIAGEN)、Roche等,有些是HRM的儀器,有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國猶他大學醫(yī)學院的Wittwer實驗室曾評估了市場上多臺儀器在基因分型和突變掃描上的性能1。他們發(fā)現(xiàn),對于大部分儀器的準確基因分型來說,主要限制在于平板上的空間溫度差異(Tm的標準偏差為0.020-0.264°C)。其它差異如數(shù)據(jù)密度、信噪比和熔解速率,也會影響雜合體的掃描。經(jīng)過比較發(fā)現(xiàn),空氣加熱型儀器以及樣品溫度單獨控制的儀器有著更低的Tm標準偏差(0.018-0.065),而加熱塊型儀器則在0.092-0.274。上海微衛(wèi)星標記strSNP分型分析做為一種新的遺傳標記,SNP對于疾病的預測、診斷能夠提供更加可靠的科學依據(jù),因此對其研究具有重要意義。

LDR連接酶檢測法優(yōu)點是適用于任何多態(tài)性位點,基于雜交反應和連接反應,分型結(jié)果準確,可進行多重反應,性價比較高,且實驗靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點檢測而言,LDR法可以實現(xiàn)多位點的同時檢測,提高檢測通量,因此前期需要一定時間構建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續(xù)樣本的分型需求,提高實驗通量的同時降低分型單價。上海翼和應用生物技術有限公司總部在上海,2011年無錫成立分公司無錫翼和應用生物技術有限公司

經(jīng)常會碰到有人詢問,如何查詢某特定區(qū)段內(nèi)的SNP信息。下面小E就整理了一下如何利用千人基因組計劃數(shù)據(jù)庫,查詢所有SNP位點的信息。輸入千人基因組網(wǎng)址,打開千人基因組數(shù)據(jù)庫。假設小明要查詢“chr10:30301729-30348488”這段距離的SNP數(shù)據(jù),在輸入框中輸入染色體區(qū)段位置,點擊“Go”。千人基因組數(shù)據(jù)庫采用GRCh37版本。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術服務和產(chǎn)品。但是只要這個突變?nèi)簺]有達到總?cè)后w的1%,它就只是一個突變株/系。達到了1%就是多態(tài)性了。

SNP(單核苷酸多態(tài)性)是,新發(fā)展起來的第三代分子標記技術,具有分布廣,多態(tài)信息量大,易于檢測和統(tǒng)計分析等特點.目前,SNP技術在水稻,玉米,大豆等作物研究中應用較多.本文綜述該技術在這些作物的遺傳標記,分子標記輔助選擇,構建高密度遺傳連鎖圖譜,繪制EST圖譜等方面的研究進展.上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術服務和產(chǎn)品。理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個或4個等位多態(tài)性。上海微衛(wèi)星標記strSNP分型分析

這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T,在其互補鏈上則為G A),也可能是顛換(C A,G T,C G,A T)。上海微衛(wèi)星標記strSNP分型分析

在擁有飽和染料和高分辨率儀器之后,HRM分析就可以開始啦。這個過程其實很簡單,就是對PCR的擴增子進行加熱,溫度從50°C逐漸上升到95°C。在此過程中,擴增子逐漸解鏈,在到達熔解溫度(Tm)時,DNA鏈完全分開。在HRM分析的初期,熒光強度很高,隨著溫度升高,雙鏈DNA逐漸減少,熒光強度也就下降了。HRM儀器通過照相機,記錄下熒光變化的整個過程。通過對數(shù)據(jù)的作圖,就生成了熔解曲線。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術服務和產(chǎn)品。上海微衛(wèi)星標記strSNP分型分析

上海翼和應用生物技術有限公司總部位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502,是一家第三方檢測服務;生物專業(yè)領域內(nèi)的技術開發(fā)、技術咨詢、技術服務;健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學技術服務;生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術技術服務;小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細胞點突變檢測;細胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司。翼和生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供細胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術服務。翼和生物始終以本分踏實的精神和必勝的信念,影響并帶動團隊取得成功。翼和生物始終關注自身,在風云變化的時代,對自身的建設毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使翼和生物在行業(yè)的從容而自信。