無錫SSR基因SNP分型技術(shù)服務

來源: 發(fā)布時間:2021-11-03

這種熔解分析只能區(qū)分在片段大小和GC含量上差別較比較明顯的DNA序列,比如檢查PCR擴增產(chǎn)物中是否存在引物二聚體及其他非特異性的擴增。如果要區(qū)分SNP,分辨率還不夠。為什么呢?這里有必要先介紹一下飽和染料和非飽和染料。SYBRGreenI就屬于非飽和性染料,由于它對PCR的抑制作用,在實驗中的使用濃度很低,遠未將DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)中的小溝飽和。這樣,DNA雙鏈高溫變性時,單鏈部分的熒光染料分子發(fā)生重排,熒光染料分子重新結(jié)合到雙鏈DNA的空置位點,造成熒光信號沒有變化,因此出現(xiàn)假陰性,特異性下降。對于候選SNP的遴選,有很多種考慮,總的趨勢和出發(fā)點是能夠涵蓋的SNP越多越好。無錫SSR基因SNP分型技術(shù)服務

片段長度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過PCR擴增目的片段DNA,擴增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段,直接通過凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位點分布不同,產(chǎn)生不同長度的DN*段條帶。上海翼和**團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。微信公眾號:上海翼和生物江蘇SSRSNP分型準確度高DNA分子雜交、引物延伸、等位基因特異的寡核苷酸連接反應、側(cè)翼探針切割反應以及基于這些方法的變通技術(shù).

LDR連接酶檢測法優(yōu)點是適用于任何多態(tài)性位點,基于雜交反應和連接反應,分型結(jié)果準確,可進行多重反應,性價比較高,且實驗靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點檢測而言,LDR法可以實現(xiàn)多位點的同時檢測,提高檢測通量,因此前期需要一定時間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續(xù)樣本的分型需求,提高實驗通量的同時降低分型單價。上海翼和應用生物技術(shù)有限公司總部在上海,2011年無錫成立分公司無錫翼和應用生物技術(shù)有限公司

4.MassArray法MassARRAY分子量陣列技術(shù)是Sequenom公司推出的世界上靠前的基因分析工具,通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術(shù)相結(jié)合,實現(xiàn)基因分型檢測?;贛assARRAY平臺的iPLEXGOLD技術(shù)可以設(shè)計,高達40重的PCR反應和基因型檢測,實驗設(shè)計靈活,分型結(jié)果準確性高。根據(jù)應用需要,對數(shù)十到數(shù)百個SNP位點進行數(shù)百至數(shù)千份樣本檢測時,MassARRAY具有,佳的性價比,特別適合于對全基因組研究發(fā)現(xiàn)的結(jié)果進行驗證,或者是有限數(shù)量的研究位點已經(jīng)確定的情況。通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。

為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點,作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個基因,64個個體(32個高糖原個體和32個低糖原個體)進行重測序,,后得到732個高質(zhì)量SNP。其中32個位于Cg_GD2基因,256個位于Cg_GS基因,用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩個SNP與糖原含量有關(guān)。分別是位于Cg_GD1基因第15個內(nèi)含子的SNP(Cg_SNP_3021(R(A/G))),和位于Cg_GD1基因的SNP(Cg_SNP_3021)。上海翼和**團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。傳統(tǒng)的RFLP只能檢測到SNP的一部分,測序技術(shù)既費時費力。河南微衛(wèi)星標記SNP分型哪里好

單核苷酸多態(tài)性(SNP)是指相同或不同物種的個體DNA序列同一位置上存在單核苷酸差異的現(xiàn)象。無錫SSR基因SNP分型技術(shù)服務

以上就是小E對幾種SNP分型技術(shù)的簡單介紹,大家可以看出分型技術(shù)多種多樣,各有各的優(yōu)點和限制。大家需要綜合考慮實驗的各方面情況,如實驗規(guī)模(多少位點,多少樣本),實驗周期,實驗預算等,然后選擇一個適合自己實驗的分型技術(shù)。上海翼和**團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。上海翼和**團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。無錫SSR基因SNP分型技術(shù)服務

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