這是一個(gè)比較悲慘、充滿黑色幽默的故事,其教訓(xùn)也是深刻的。在2001年,科學(xué)家在一篇論文里報(bào)道了一株新建立的大鼠(rat)視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)的細(xì)胞系(留個(gè)印象是大鼠來源的),命名為RGC-5。在隨后的十幾年時(shí)間里,至少230篇論文的研究與假設(shè)是建立在這株細(xì)胞系上。這株細(xì)胞系有很多好的地方,它是視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)的細(xì)胞系,對于眼科學(xué)的研究有一株大鼠的永生細(xì)胞很重要。一批有名的科學(xué)家在此基礎(chǔ)上做出很多重大發(fā)現(xiàn),論文發(fā)表在諸如PNAS之類的雜志上,特別是與青光眼有關(guān)的領(lǐng)域(你如果是這個(gè)領(lǐng)域的,要當(dāng)心了)。翼和生物人源細(xì)胞鑒定包含哪些結(jié)果?小鼠鑒定ATCC
專業(yè)的STR數(shù)據(jù)庫,為細(xì)胞STR鑒定護(hù)航:不同于親子鑒定,其有父/母親樣本的STR數(shù)據(jù)可供對照,而目前所用的細(xì)胞系基本已難以找到供體的組織或細(xì)胞進(jìn)行STR比對,因此需要一個(gè)包含盡可能多的細(xì)胞系的STR數(shù)據(jù)庫(如公安部的指紋庫)來進(jìn)行檢索/比對。所以,這個(gè)庫包含的細(xì)胞系越完全,其可用性就越大。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒。北京細(xì)胞鑒定報(bào)告細(xì)胞系STR遺傳質(zhì)量鑒定是上海翼和自2014年起開始推出的專業(yè)服務(wù)。
小師弟:如何根據(jù)細(xì)胞STR鑒定結(jié)果判斷細(xì)胞系是否發(fā)生了交叉污染?如果存在細(xì)胞系之間發(fā)生交叉污染,而且鑒定用的細(xì)胞可能有兩種以上的細(xì)胞系時(shí),那么在進(jìn)行STR位點(diǎn)檢測的時(shí)候,多個(gè)位點(diǎn)會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強(qiáng)度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關(guān)系。因此,存在交叉污染的混合細(xì)胞系中,其中一個(gè)位點(diǎn)中某些峰會(huì)明顯高于其他的峰,其中大峰是屬于混合細(xì)胞系中那個(gè)主要細(xì)胞系,而小峰則屬于那個(gè)次要細(xì)胞系。
短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR),又稱為微衛(wèi)星標(biāo)記(microsalite)。它普遍并均勻地存在于真核生物基因組中,一般由一個(gè)長2~6bp的中心序列經(jīng)多次串聯(lián)重復(fù)排列而成,重復(fù)次數(shù)大多在10~60次之間。個(gè)體間中心序列的重復(fù)次數(shù)呈高度變異性,構(gòu)成了STR的遺傳多態(tài)性。由于其序列簡短,通過PCR很容易從基因組DNA中特異性地?cái)U(kuò)增出來,極大簡化了微衛(wèi)星多態(tài)性分析的操作。研究者只需在目標(biāo)基因座設(shè)計(jì)一對或多對引物,通過PCR反應(yīng)從模板DNA中將該基因擴(kuò)增出來,然后使用測序儀進(jìn)行電泳分離分析即可。它具有分布普遍,易于檢測,信息量大,有高度多態(tài)性并遵循孟德爾共顯性遺傳等優(yōu)點(diǎn),被認(rèn)為是繼限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)之后的第二代遺傳標(biāo)記,已普遍應(yīng)用于遺傳圖譜繪制、基因定位、法醫(yī)鑒定、遺傳病診斷等諸多領(lǐng)域。并剛過半年,連續(xù)有六篇翼和公司協(xié)助干細(xì)胞鑒定的論文登上《Stem Cell Research》雜志。
如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系的身份?收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及STR信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。如果細(xì)胞樣本的每個(gè)STR位點(diǎn)和參考細(xì)胞STR位點(diǎn)都能重合匹配,即說明該細(xì)胞系正確,反之則說明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來,匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確,匹配度<80%則說明該細(xì)胞系的來源需要被懷疑。如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記,則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,從而找到問題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購買一株新的細(xì)胞系。公司深知Hela細(xì)胞極易污染別的細(xì)胞,這些經(jīng)驗(yàn)被應(yīng)用于身份驗(yàn)證中。北京小鼠細(xì)胞STR鑒定機(jī)構(gòu)
上海翼和應(yīng)用生物,作為老牌的細(xì)胞STR鑒定服務(wù)公司,十年以上基因分型經(jīng)驗(yàn),可以幫你解決你的疑惑。小鼠鑒定ATCC
STR基因位點(diǎn)由長度為3~7個(gè)堿基對的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列普遍存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。小鼠鑒定ATCC
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502,是一家第三方檢測服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測;細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司。翼和生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提供高品質(zhì)的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)。翼和生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。翼和生物創(chuàng)始人陳燁,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。