短串聯(lián)重復(fù)(Short tandem repeats, STR),又稱微衛(wèi)星DNA(Microsatellite DNA)或簡(jiǎn)單重復(fù)序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR),是普遍存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列。有絲分裂過(guò)程中DNA鏈之間的錯(cuò)配引起的復(fù)制滑動(dòng)被認(rèn)為是導(dǎo)致STR產(chǎn)生的較為常見原因,并且依據(jù)不同復(fù)制單元大小的不同以及不同物種之間,復(fù)制滑動(dòng)發(fā)生的概率也不相同。STR已被廣泛應(yīng)用于親子鑒定、個(gè)體識(shí)別、司法鑒定、交通事故鑒定、(造血干細(xì)胞)移植醫(yī)治后嵌合情況監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域。中國(guó)科學(xué)院昆明細(xì)胞庫(kù)檢查出錯(cuò)誤鑒定和交叉污染的細(xì)胞結(jié)果。北京細(xì)胞鑒定標(biāo)準(zhǔn)
翼和公司的近交系小鼠檢測(cè)方案1.0與2.0版本(1)基于PCR-LDR的近交系小鼠檢測(cè)方案1.0版本:該版本基于經(jīng)典的PCR-LDR方案,由東華大學(xué)、中科院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心、上海實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心多位專家聯(lián)合開發(fā),并發(fā)表于《中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào)》。上海翼和進(jìn)行二次開發(fā)后,推出市場(chǎng),檢測(cè)位點(diǎn)48個(gè),分布于所有染色體上,能滿足小鼠遺傳背景基本需求。(2)基于多重PCR與二代測(cè)序的近交系小鼠檢測(cè)方案2.0版本:2017年,上海翼和公司在多重PCR技術(shù)開發(fā)成熟的基礎(chǔ)上,針對(duì)近交系小鼠,設(shè)計(jì)了100多個(gè)位點(diǎn)的二代測(cè)序方案,并在Ion Proton與IlluminaX-10上分別對(duì)數(shù)百只小鼠成功鑒定。天津細(xì)胞STR鑒定機(jī)構(gòu)2019翼和公司協(xié)助干細(xì)胞鑒定的六篇《Stem Cell Research》論文。
小師弟:如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系的身份?收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及STR信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。如果細(xì)胞樣本的每個(gè)STR位點(diǎn)和參考細(xì)胞STR位點(diǎn)都能重合匹配,即說(shuō)明該細(xì)胞系正確,反之則說(shuō)明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說(shuō)來(lái),匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確,匹配度<80%則說(shuō)明該細(xì)胞系的來(lái)源需要被懷疑。如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記,則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,從而找到問(wèn)題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購(gòu)買一株新的細(xì)胞系。
值得注意的是,當(dāng)發(fā)生兩個(gè)或以上細(xì)胞混合的時(shí)候,檢測(cè)結(jié)果看起來(lái)非常像細(xì)胞系的“遺傳不穩(wěn)定”——當(dāng)一個(gè)細(xì)胞系存在亞群時(shí),尤其是一些*細(xì)胞系,由于遺傳不穩(wěn)定的存在,在一些位點(diǎn)的STR特性會(huì)不同。因此經(jīng)驗(yàn)豐富的分子專家是非常重要的,他能夠幫助分析復(fù)雜的電泳圖譜(STR峰圖),從而判斷是否由于發(fā)生細(xì)胞系交叉污染而導(dǎo)致多等位基因情況。上海翼和應(yīng)用生物,作為老牌的遺傳技術(shù)服務(wù)公司,十年以上基因分型經(jīng)驗(yàn),可以幫你解決你的疑惑。本文購(gòu)自ATCC等機(jī)構(gòu)的細(xì)胞(如SW480,HCT116, FET細(xì)胞系等),均全部由上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司鑒定。
熱烈祝賀上海翼和生物客戶第三軍醫(yī)大學(xué)新橋醫(yī)院內(nèi)分泌科發(fā)表文章“NRF2 activation by antioxidant antidiabetic agents accelerates tumor metastasis ”于Science Translational Medicine雜志,影響因子16.3,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的細(xì)胞系提供了細(xì)胞STR鑒定服務(wù)。恭賀上海翼和生物客戶趙永良研究員課題組在Cancer Research雜志(IF=8.5)發(fā)表研究論文。熱烈祝賀上海翼和生物客戶中科院北京基因組研究所趙永良研究員課題組默董亮博士發(fā)表文章“Human helicase RECQL4 drives cisplatin resistance in gastric cancer by activating an AKT-YB1-MDR1 signaling pathway”于Cancer Research雜志,影響因子8.556,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的多株細(xì)胞系提供了細(xì)胞STR鑒定服務(wù)。細(xì)胞STR鑒定助力論文發(fā)表Cancer Research。北京鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)
翼和生物細(xì)胞鑒定技術(shù)又助力一篇高的分?jǐn)?shù)論文。北京細(xì)胞鑒定標(biāo)準(zhǔn)
由于SNP數(shù)量龐大,高通量的基因分型能降低成本,故世界有名的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物公司都已使用SNP遺傳標(biāo)記進(jìn)行遺傳檢測(cè)(Petkov et al., 2004; Peers et al., 2007; Sherry et al., 2001)。如Harlan 與Charles River Laboratories公司的小鼠遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)評(píng)估系統(tǒng)分別含有48個(gè)和32個(gè)SNP,而Jackson實(shí)驗(yàn)室則提供2000個(gè)SNP評(píng)估的芯片用于基礎(chǔ)群的檢測(cè),而99%的生產(chǎn)群用29個(gè)SNP來(lái)監(jiān)控??梢?,SNP遺傳標(biāo)記用以監(jiān)測(cè)小鼠遺傳質(zhì)量是國(guó)際通用標(biāo)準(zhǔn)。高通量的 SNP 基因分型 人類基因組中有 30 億個(gè)堿基對(duì),每一對(duì)都可能蘊(yùn)藏著精彩的故事。北京細(xì)胞鑒定標(biāo)準(zhǔn)
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一家第三方檢測(cè)服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評(píng)估;大健康檢測(cè);遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測(cè);細(xì)胞端粒長(zhǎng)度和端粒酶活性檢測(cè)。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠(chéng)實(shí)可信的企業(yè)。公司自創(chuàng)立以來(lái),投身于細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù),是醫(yī)藥健康的主力軍。翼和生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功。翼和生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場(chǎng)需求,提高產(chǎn)品價(jià)值,是我們前行的力量。