上海CPG島甲基化重測序準(zhǔn)確度高

來源: 發(fā)布時間:2021-12-01

DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域研究的重點之一。DNA甲基化是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferase, 縮寫DNMT)的作用下,基因組DNA序列上CpG島的二核苷酸5′端胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)?′甲基胞嘧啶(5′ methylcytosine, 縮寫5mC)。這種DNA修飾的方式并未改變基因的序列, 但能改變某些基因的表達(dá),從而影響生物學(xué)功能。DNA 甲基化參與眾多的細(xì)胞生命活動,包括細(xì)胞分化、組織特異性基因表達(dá)、基因組印記、X 染色體失活等。異常的 DNA 甲基化會導(dǎo)致發(fā)育異常、tumour等疾病的發(fā)生。DNA甲基化是在DNA甲基化轉(zhuǎn)移(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5'端的胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)?'甲基胞嘧啶。上海CPG島甲基化重測序準(zhǔn)確度高

WGBS能為基因組DNA甲基化時空特異性修飾的研究提供重要技術(shù)支持,能廣泛應(yīng)用在個體發(fā)育、衰老和疾病等生命過程的機(jī)制研究中,也是各物種甲基化圖譜研究的優(yōu)先方法。常規(guī)全基因組甲基化測序技術(shù)通過T4-DNA連接酶,在超聲波打斷基因組DNA段的兩端連接接頭序列,連接產(chǎn)物通過重亞硫酸鹽處理將未甲基化修飾的胞嘧啶C轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏,進(jìn)而通過接頭序列介導(dǎo)的 PCR 技術(shù)將尿嘧啶U轉(zhuǎn)變?yōu)樾叵汆奏。上海翼和是上海市遺傳學(xué)會理事單位,上海市高新技術(shù)企業(yè),至今已有十六年的歷史。北京甲基化重測序怎么解決DNA甲基化是基因組DNA的一種主要表觀遺傳修飾形式。

亞硫酸氫鹽測序法用亞硫酸氫鈉對 DNA 進(jìn)行化學(xué)處理會使甲基化特異性序列變異,從而可以通過NGS進(jìn)行定位和量化,主要的DNA甲基化數(shù)據(jù)分析流程:獲得DNA甲基化數(shù)據(jù)之后,首先,需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和質(zhì)量的基本控制,包括原始測序和芯片數(shù)據(jù)的讀取、轉(zhuǎn)換到產(chǎn)生準(zhǔn)確的DNA甲基化圖譜;其次,需要對DNA甲基化位點的結(jié)果進(jìn)行可視化,并且利用統(tǒng)計學(xué)方法鑒定樣本特異性差異的DNA甲基化位點;第三,驗證 DNA 甲基化差異位點,并且對其進(jìn)行生物學(xué)解釋。

DNA甲基化作為一種重要的表觀修飾,在調(diào)控基因的時空特異性表達(dá)中扮演著關(guān)鍵的角色,參與了X染色體失活、基因組印記和重復(fù)序列抑制等諸多生命過程。哺乳動物細(xì)胞的DNA甲基化主要發(fā)生在CpG二核苷酸對的C(胞嘧啶)上,并在有絲分裂過程中得以相對穩(wěn)定的維持,這對細(xì)胞保持譜系特性有著重要的意義。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司自主研發(fā)的Hi-MethylSeq技術(shù),可對對大規(guī)模群體的候選基因甲基化水平進(jìn)行檢測。上海翼和生物是上海市遺傳學(xué)會理事單位。機(jī)體細(xì)胞在經(jīng)歷脅迫、創(chuàng)傷等環(huán)境變化后,會產(chǎn)生特定的應(yīng)答,并往往會用DNA甲基化記錄在DNA修飾中。

DNA甲基化是DNA化學(xué)修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn)。DNA甲基化是指在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,DNA的CG兩個核苷酸中的胞嘧啶被選擇性地添加甲基基團(tuán)的化學(xué)修飾現(xiàn)象,極常見的是在胞嘧啶的5號碳位置,在酶和底物的作用下,引入一個甲基基團(tuán),變成了5甲基胞嘧啶(5mC),從而改變了它的活性。DNA甲基化是基因組DNA的一種主要表觀遺傳修飾形式。DNA甲基化修飾對于維持正常細(xì)胞功能、傳遞基因組遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類tumour發(fā)生,起著至關(guān)重要的作用。上海翼和生物通過亞硫酸氫鹽(bisulfite)處理,用PCR擴(kuò)增目的片段,并結(jié)合二代測序平臺(illumina等主流測序平臺)并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序,本方案目標(biāo)區(qū)域甲基化測序服務(wù)Hi-MethylSeq,在完成目標(biāo)區(qū)域檢測的同時大幅降低研究費(fèi)用。DNA甲基化通常抑制基因表達(dá),去甲基化則誘導(dǎo)了基因的重新活化和表達(dá)。上海CPG島甲基化重測序準(zhǔn)確度高

WGBS的流程與全基因組DNA測序主要區(qū)別于DNA文庫的構(gòu)建。上海CPG島甲基化重測序準(zhǔn)確度高

上海翼和生物甲基化測序采用的是重亞硫酸鹽擴(kuò)增子測序法(Bisulfite Amplicon Sequencing, BSAS),重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化是研究DNA甲基化的金標(biāo)方法,該技術(shù)基于非甲基化胞嘧啶(C)向尿嘧啶(U)的化學(xué)轉(zhuǎn)化,即用重亞硫酸鹽處理基因組DNA,非甲基化胞嘧啶被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而甲基化胞嘧啶不發(fā)生這種轉(zhuǎn)化,從而能夠在單核苷酸水平上確定DNA甲基化(圖1)。轉(zhuǎn)化后的序列可以進(jìn)行多種分析,包括重亞硫酸鹽測序、焦磷酸測序、甲基化特異性PCR、高分辨率熔解曲線分析、基于微陣列的方法和下一代測序。上海CPG島甲基化重測序準(zhǔn)確度高

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一家服務(wù)型類企業(yè),積極探索行業(yè)發(fā)展,努力實現(xiàn)產(chǎn)品創(chuàng)新。是一家私營有限責(zé)任公司企業(yè),隨著市場的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,與多家企業(yè)合作研究,在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過不斷改進(jìn),追求新型,在強(qiáng)化內(nèi)部管理,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時,良好的質(zhì)量、合理的價格、完善的服務(wù),在業(yè)界受到寬泛好評。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊,具有細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)等多項業(yè)務(wù)。翼和生物以創(chuàng)造高品質(zhì)產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。