LDR連接酶檢測(cè)法優(yōu)點(diǎn)是適用于任何多態(tài)性位點(diǎn),基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng),分型結(jié)果準(zhǔn)確,可進(jìn)行多重反應(yīng),性?xún)r(jià)比較高,且實(shí)驗(yàn)靈活。但是相比TaqMan和直接測(cè)序法的單一位點(diǎn)檢測(cè)而言,LDR法可以實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)的同時(shí)檢測(cè),提高檢測(cè)通量,因此前期需要一定時(shí)間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續(xù)樣本的分型需求,提高實(shí)驗(yàn)通量的同時(shí)降低分型單價(jià)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部在上海,2011年無(wú)錫成立分公司無(wú)錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司SNP是多態(tài)性中的一種,只是進(jìn)一步限定了差異只是單堿基。河南STR基因SNP分型公司
相信大家都聽(tīng)過(guò)或已經(jīng)接觸過(guò)一些常用的分型方法,如片段長(zhǎng)度多態(tài)性(限制性?xún)?nèi)切酶)法,直接測(cè)序法,Taqman熒光探針?lè)?,LDR連接酶檢測(cè)反應(yīng)法,競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法(KASP),二代測(cè)序法等,小E就針對(duì)以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限上海翼和專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶(hù)提供性?xún)r(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。上海微衛(wèi)星STRSNP分型準(zhǔn)確度高在經(jīng)濟(jì)作物育種領(lǐng)域,檢測(cè)SNP可實(shí)現(xiàn)對(duì)所需性狀的早期選擇。
SNP(單核苷酸多態(tài)性)是,新發(fā)展起來(lái)的第三代分子標(biāo)記技術(shù),具有分布廣,多態(tài)信息量大,易于檢測(cè)和統(tǒng)計(jì)分析等特點(diǎn).目前,SNP技術(shù)在水稻,玉米,大豆等作物研究中應(yīng)用較多.本文綜述該技術(shù)在這些作物的遺傳標(biāo)記,分子標(biāo)記輔助選擇,構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜,繪制EST圖譜等方面的研究進(jìn)展.上海翼和專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶(hù)提供性?xún)r(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。
上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測(cè)平臺(tái),分別為:適合中低通量檢測(cè)的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測(cè)反應(yīng))想結(jié)合的檢測(cè)技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別。高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類(lèi)型的堿基錯(cuò)配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?;旌蠘颖竞?,在illumina等主流測(cè)序平臺(tái)上,對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測(cè)序能一次對(duì)幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,相比其他的SNP檢測(cè)技術(shù),基于高通量測(cè)序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)??梢愿鶕?jù)以往文獻(xiàn),在所研究疾病的多個(gè)候選基因上面選擇多個(gè)SNP,比如選擇DNA修復(fù)通路中幾個(gè)基因的重要SNP.
為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點(diǎn),作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個(gè)基因,64個(gè)個(gè)體(32個(gè)高糖原個(gè)體和32個(gè)低糖原個(gè)體)進(jìn)行重測(cè)序,,后得到732個(gè)高質(zhì)量SNP。其中32個(gè)位于Cg_GD2基因,256個(gè)位于Cg_GS基因,用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩個(gè)SNP與糖原含量有關(guān)。分別是位于Cg_GD1基因第15個(gè)內(nèi)含子的SNP(Cg_SNP_3021(R(A/G))),和位于Cg_GD1基因的SNP(Cg_SNP_3021)。上海翼和專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶(hù)提供性?xún)r(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。STR/SSRSNP分型哪里好
目前已有多種方法可用于SNP檢測(cè),如根據(jù)DNA列陣的微測(cè)序法、DNA芯片以及TaqMan系統(tǒng)等。河南STR基因SNP分型公司
1、SNP數(shù)量多,分布比較常見(jiàn)。據(jù)估計(jì),人類(lèi)基因組中每1000個(gè)核苷酸就有一個(gè)SNP,人類(lèi)30億堿基。。有300萬(wàn)以上的SNPs.SNP遍布于整個(gè)人類(lèi)基因組中,根據(jù)SNP在基因中的位置,可分為基因編碼區(qū)SNPs(Coding-regionSNPs,cSNPs)、基因周邊SNPs(PerigenicSNPs,pSNPs)以及基因間SNPs(IntergenicSNPs,iSNPs)等三類(lèi)。2、SNP適于快速、規(guī)?;Y查。組成DNA的堿基雖然有4種,但SNP一般只有兩種堿基組成,所以它是一種二態(tài)的標(biāo)記,即二等位基因(biallelic)。由于SNP的二態(tài)性,非此即彼,在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析,而不用分析片段的長(zhǎng)度,這就利于發(fā)展自動(dòng)化技術(shù)篩選或檢測(cè)SNPs.河南STR基因SNP分型公司
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司擁有第三方檢測(cè)服務(wù);生物專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù);健康衰老評(píng)估;大健康檢測(cè);遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測(cè);細(xì)胞端粒長(zhǎng)度和端粒酶活性檢測(cè)。等多項(xiàng)業(yè)務(wù),主營(yíng)業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)。公司目前擁有專(zhuān)業(yè)的技術(shù)員工,為員工提供廣闊的發(fā)展平臺(tái)與成長(zhǎng)空間,為客戶(hù)提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù),深受員工與客戶(hù)好評(píng)。公司以誠(chéng)信為本,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù),我們本著對(duì)客戶(hù)負(fù)責(zé),對(duì)員工負(fù)責(zé),更是對(duì)公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,爭(zhēng)取做到讓每位客戶(hù)滿(mǎn)意。一直以來(lái)公司堅(jiān)持以客戶(hù)為中心、細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)市場(chǎng)為導(dǎo)向,重信譽(yù),保質(zhì)量,想客戶(hù)之所想,急用戶(hù)之所急,全力以赴滿(mǎn)足客戶(hù)的一切需要。