《Stem Cell Research》是專門刊登干細(xì)胞生物學(xué)與應(yīng)用的雜志,關(guān)注干細(xì)胞多能性機(jī)制與新建立的干細(xì)胞系,當(dāng)前影響因子接近4.0。該雜志有Research paper, Short communications, Reviews, Technical notes與Lab resource等五大板塊,其中Lab resource目前看起來(lái)是比較容易被收錄的,主要收錄新建立的多能干細(xì)胞系。《Stem Cell Research》雜志于2019年進(jìn)入上海翼和生物的視野,并剛過(guò)半年,連續(xù)有六篇上海翼和公司協(xié)助干細(xì)胞鑒定的論文登上該雜志。如何根據(jù)細(xì)胞STR鑒定結(jié)果判斷細(xì)胞系是否發(fā)生了交叉污染?江蘇細(xì)胞鑒定公司
如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系的身份?收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及STR信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。如果細(xì)胞樣本的每個(gè)STR位點(diǎn)和參考細(xì)胞STR位點(diǎn)都能重合匹配,即說(shuō)明該細(xì)胞系正確,反之則說(shuō)明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說(shuō)來(lái),匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確,匹配度<80%則說(shuō)明該細(xì)胞系的來(lái)源需要被懷疑。如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記,則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,從而找到問(wèn)題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購(gòu)買一株新的細(xì)胞系。蘇州細(xì)胞STR鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)翼和生物細(xì)胞鑒定技術(shù)又助力一篇高的分?jǐn)?shù)論文。
為什么要做支原體污染檢測(cè)?在細(xì)胞研究領(lǐng)域,支原體是臭名昭著的污染源,許多實(shí)驗(yàn)室都深受其害。支原體傳染能在不知不覺中干擾研究結(jié)果,浪費(fèi)大量的資金投入。研究表明,95%以上污染細(xì)胞的支原體屬于以下四種類型:口腔支原體(M.orale)、精氨酸支原體(M.arginini)、豬鼻支原體(M.hyorhinis)和萊氏無(wú)膽甾原體(A.laidlawii,此種支原體為牛源性)。這是四種比較常見的污染細(xì)胞的支原體菌群,但實(shí)際中能夠污染細(xì)胞的支原體的種類是很多的。國(guó)外的調(diào)查證明,有二十多種支原體可以污染細(xì)胞,并且有的細(xì)胞可以同時(shí)被兩種以上的支原體污染。
上海翼和公司利用熒光PCR擴(kuò)增小鼠基因組中9個(gè)STR基因位點(diǎn),PCR產(chǎn)物在毛細(xì)管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測(cè)進(jìn)行基因分型。根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)(EXPASY)比對(duì),從而鑒定樣品所屬的小鼠細(xì)胞系。2017年4月,翼和客戶山東泰山醫(yī)學(xué)院免疫所發(fā)表了EBioMedicine上的一篇論文,該文中編輯要求對(duì)突變小鼠的遺傳背景進(jìn)行鑒定,翼和公司應(yīng)用基于多重PCR與二代測(cè)序的近交系小鼠檢測(cè)方案2.0版本方案,成功的對(duì)基因編輯小鼠進(jìn)行了測(cè)試,并對(duì)小鼠遺傳背景進(jìn)行了STR鑒定,雜志編輯成功接受。本文使用的Hela**細(xì)胞,由上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司鑒定。
這是一個(gè)比較悲慘、充滿黑色幽默的故事,其教訓(xùn)也是深刻的。在2001年,科學(xué)家在一篇論文里報(bào)道了一株新建立的大鼠(rat)視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)的細(xì)胞系(留個(gè)印象是大鼠來(lái)源的),命名為RGC-5。在隨后的十幾年時(shí)間里,至少230篇論文的研究與假設(shè)是建立在這株細(xì)胞系上。這株細(xì)胞系有很多好的地方,它是視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)的細(xì)胞系,對(duì)于眼科學(xué)的研究有一株大鼠的永生細(xì)胞很重要。一批有名的科學(xué)家在此基礎(chǔ)上做出很多重大發(fā)現(xiàn),論文發(fā)表在諸如PNAS之類的雜志上,特別是與青光眼有關(guān)的領(lǐng)域(你如果是這個(gè)領(lǐng)域的,要當(dāng)心了)。上海翼和生物是ATCC標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)成員,在國(guó)內(nèi)率先推出了細(xì)胞STRS分析服務(wù)并與多家細(xì)胞中心建立長(zhǎng)期合作關(guān)系。南京細(xì)胞STR鑒定
一株細(xì)胞系的遺傳特征確立后,細(xì)胞系可以通過(guò)定期的檢測(cè),以防止出現(xiàn)細(xì)胞系被誤認(rèn)或交叉污染的情況。江蘇細(xì)胞鑒定公司
如何知道細(xì)胞系是否發(fā)生交叉污染了?如果存在細(xì)胞系之間發(fā)生交叉污染,而且鑒定用的細(xì)胞可能有兩種以上的細(xì)胞系時(shí),那么在進(jìn)行STR位點(diǎn)檢測(cè)的時(shí)候,多個(gè)位點(diǎn)會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號(hào)強(qiáng)度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關(guān)系。因此,存在交叉污染的混合細(xì)胞系中,其中一個(gè)位點(diǎn)中某些峰會(huì)明顯高于其他的峰,其中大峰是屬于混合細(xì)胞系中那個(gè)主要細(xì)胞系,而小峰則屬于那個(gè)次要細(xì)胞系。STR鑒定目前已被ICLAC、ATCC等機(jī)構(gòu)作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定,越來(lái)越多的雜志要求在投稿時(shí)提供細(xì)胞STR分型數(shù)據(jù)。江蘇細(xì)胞鑒定公司
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司坐落在龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502,是一家專業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評(píng)估;大健康檢測(cè);遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測(cè);細(xì)胞端粒長(zhǎng)度和端粒酶活性檢測(cè)。公司。公司目前擁有專業(yè)的技術(shù)員工,為員工提供廣闊的發(fā)展平臺(tái)與成長(zhǎng)空間,為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù),深受員工與客戶好評(píng)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司主營(yíng)業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù),堅(jiān)持“質(zhì)量保證、良好服務(wù)、顧客滿意”的質(zhì)量方針,贏得廣大客戶的支持和信賴。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務(wù),我們相信誠(chéng)實(shí)正直、開拓進(jìn)取地為公司發(fā)展做正確的事情,將為公司和個(gè)人帶來(lái)共同的利益和進(jìn)步。經(jīng)過(guò)幾年的發(fā)展,已成為細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)行業(yè)出名企業(yè)。