上海細(xì)胞STR鑒定數(shù)據(jù)庫比對

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-10

STR是以中心序列 (core repeat units) 首尾相連多次重復(fù)形成。每個(gè)STR的中心序列結(jié)構(gòu)相同,長度為2-6bp,但其重復(fù)單位數(shù)目和重復(fù)區(qū)域的長度不同,因此STR在不同種族、不同人群之間的分布具有差異性,構(gòu)成了STR遺傳多態(tài)性。不同個(gè)體之間在一個(gè)同源STR位點(diǎn)的重復(fù)次數(shù)也不同,因而同指紋識別一樣,STR位點(diǎn)分析也可對個(gè)體進(jìn)行身份識別。通過識別個(gè)體基因組在特定位點(diǎn)的特定序列重復(fù),即可創(chuàng)建其基因檔案?;诖?,STR分析法已經(jīng)成為一種重要的鑒定分析方法,應(yīng)用于法醫(yī)學(xué)、親子鑒定及細(xì)胞鑒定等領(lǐng)域。如何根據(jù)細(xì)胞STR鑒定結(jié)果判斷細(xì)胞系是否發(fā)生了交叉污染?上海細(xì)胞STR鑒定數(shù)據(jù)庫比對

上海翼和公司為客戶提供基于qPCR技術(shù)的種系鑒定方案,選擇人、小鼠、大鼠和倉鼠基因組中特異基因片段,設(shè)計(jì)引物和熒光探針,快速鑒定種系來源。該方案靈敏度和特異性高,可以檢測樣本中不同種系來源的細(xì)胞污染,當(dāng)污染細(xì)胞占比> 5% 時(shí),可被穩(wěn)定檢出。在PCR反應(yīng)中,除了正向引物和反向引物外,還引入了第三個(gè)寡核苷酸序列,這是一個(gè)重大的進(jìn)展。這個(gè)額外的序列,就是探針(Probe),它彌補(bǔ)了DNA結(jié)合染料的缺點(diǎn)。探針上有熒光修飾基團(tuán),可產(chǎn)生熒光信號。浙江小鼠STR鑒定翼和的STR圖譜鑒包含細(xì)胞身份驗(yàn)證報(bào)告、STR等位基因表、電泳圖、結(jié)果的解釋與數(shù)據(jù)庫比對結(jié)果。

翼和公司的近交系小鼠檢測方案1.0與2.0版本(1)基于PCR-LDR的近交系小鼠檢測方案1.0版本:該版本基于經(jīng)典的PCR-LDR方案,由東華大學(xué)、中科院實(shí)驗(yàn)動物中心、上海實(shí)驗(yàn)動物研究中心多位專家聯(lián)合開發(fā),并發(fā)表于《中國實(shí)驗(yàn)動物學(xué)報(bào)》。上海翼和進(jìn)行二次開發(fā)后,推出市場,檢測位點(diǎn)48個(gè),分布于所有染色體上,能滿足小鼠遺傳背景基本需求。(2)基于多重PCR與二代測序的近交系小鼠檢測方案2.0版本:2017年,上海翼和公司在多重PCR技術(shù)開發(fā)成熟的基礎(chǔ)上,針對近交系小鼠,設(shè)計(jì)了100多個(gè)位點(diǎn)的二代測序方案,并在Ion Proton與IlluminaX-10上分別對數(shù)百只小鼠成功鑒定。

恭賀上海翼和生物客戶趙永良研究員課題組在Cancer Research雜志(IF=8.5)發(fā)表研究論文。熱烈祝賀上海翼和生物客戶中科院北京基因組研究所趙永良研究員課題組默董亮博士發(fā)表文章“Human helicase RECQL4 drives cisplatin resistance in gastric cancer by activating an AKT-YB1-MDR1 signaling pathway”于Cancer Research雜志,影響因子8.556,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的多株細(xì)胞系提供了細(xì)胞STR鑒定服務(wù)。熱烈祝賀上海翼和生物客戶第三軍醫(yī)大學(xué)新橋醫(yī)院內(nèi)分泌科發(fā)表文章“NRF2 activation by antioxidant antidiabetic agents accelerates tumor metastasis ”于Science Translational Medicine雜志,影響因子16.3,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的細(xì)胞系提供了細(xì)胞STR鑒定服務(wù)。如何提供細(xì)胞系鑒定樣本?

值得注意的是,當(dāng)發(fā)生兩個(gè)或以上細(xì)胞混合的時(shí)候,檢測結(jié)果看起來非常像細(xì)胞系的“遺傳不穩(wěn)定”——當(dāng)一個(gè)細(xì)胞系存在亞群時(shí),尤其是一些*細(xì)胞系,由于遺傳不穩(wěn)定的存在,在一些位點(diǎn)的STR特性會不同。因此經(jīng)驗(yàn)豐富的分子專家是非常重要的,他能夠幫助分析復(fù)雜的電泳圖譜(STR峰圖),從而判斷是否由于發(fā)生細(xì)胞系交叉污染而導(dǎo)致多等位基因情況。上海翼和應(yīng)用生物,作為老牌的遺傳技術(shù)服務(wù)公司,十年以上基因分型經(jīng)驗(yàn),可以幫你解決你的疑惑。如何進(jìn)行細(xì)胞系鑒定?江蘇小鼠鑒定ATCC

《Stem Cell Research》雜志于2019年進(jìn)入上海翼和生物的視野。上海細(xì)胞STR鑒定數(shù)據(jù)庫比對

翼和為您普及小知識點(diǎn):作者分別從國內(nèi)28個(gè)研究機(jī)構(gòu)搜集了278株常見人源腫liu細(xì)胞系,其中國內(nèi)建立的細(xì)胞系71株,國外建立的細(xì)胞系207株。經(jīng)STR鑒定后發(fā)現(xiàn),來自于22個(gè)研究機(jī)構(gòu)的128株細(xì)胞存在交叉污染/錯(cuò)誤鑒定的情況,錯(cuò)誤率高達(dá)46%。其中國內(nèi)建立的細(xì)胞系占52株,這表明了什么,國內(nèi)建立的細(xì)胞系交叉污染/錯(cuò)誤鑒定率竟然高達(dá)73.2%,并且67.3%(35/52)國內(nèi)交叉污染/錯(cuò)誤鑒定的細(xì)胞系結(jié)果被證實(shí)是Hela細(xì)胞或被Hela細(xì)胞部分污染的!上海細(xì)胞STR鑒定數(shù)據(jù)庫比對

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè),技術(shù)力量雄厚。公司是一家私營有限責(zé)任公司企業(yè),以誠信務(wù)實(shí)的創(chuàng)業(yè)精神、專業(yè)的管理團(tuán)隊(duì)、踏實(shí)的職工隊(duì)伍,努力為廣大用戶提供高品質(zhì)的產(chǎn)品。公司業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù),價(jià)格合理,品質(zhì)有保證,深受廣大客戶的歡迎。翼和生物將以真誠的服務(wù)、創(chuàng)新的理念、高品質(zhì)的產(chǎn)品,為彼此贏得全新的未來!