10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域,每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)(barcodedspots),每個(gè)點(diǎn)的直徑為55μm,點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100μm,并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列。組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA,遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列,然后進(jìn)行文庫構(gòu)建并進(jìn)行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個(gè)位置,從而實(shí)現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化。全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺(tái)。廈門scRNA空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)
空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細(xì)胞測序的結(jié)果不同,這里存在一個(gè)概念叫做NumberofSpotsundertissue,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn)。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá)。那么這個(gè)時(shí)候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達(dá),即無有效Spot位點(diǎn)。同樣的,另一個(gè)就是組織切片的大小,也就是說組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。成都烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還可以實(shí)現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時(shí)序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。空間轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。
相比于常規(guī)的測序手段,空間轉(zhuǎn)錄組測序有幾個(gè)明顯的優(yōu)勢:1.將轉(zhuǎn)錄組信息與空間信息對應(yīng),體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質(zhì)性:每個(gè)區(qū)域獨(dú)特的條形碼使測序結(jié)果與空間位置形成一一對應(yīng)關(guān)系。雖然暫時(shí)還無法精細(xì)到單細(xì)胞層面,但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉(zhuǎn)錄組差異。2.不影響對全組織進(jìn)行分析:芯片上捕獲的全轉(zhuǎn)錄組在同一個(gè)反應(yīng)中完成測序,能有效降低多次重復(fù)實(shí)驗(yàn)中的誤差。測序結(jié)果如果不按照條形碼歸類,則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉(zhuǎn)錄組情況,無需再做單獨(dú)檢測。3.為進(jìn)一步的研究提供指導(dǎo)意見:常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組測序,對后續(xù)實(shí)驗(yàn)的指導(dǎo)仍然停留在全組織層面。而空間轉(zhuǎn)錄組測序則可以標(biāo)識出更有價(jià)值的研究區(qū)域,引導(dǎo)研究者將組織進(jìn)一步細(xì)分??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,為從多維度揭示疾病進(jìn)展提供了強(qiáng)有力的工具。蘇州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司
烈冰開展了空間轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。廈門scRNA空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)
中國銷售產(chǎn)業(yè)憑借獨(dú)特資源和市場優(yōu)勢,一舉成為資本角逐的重點(diǎn)領(lǐng)域之一。從世界范圍來看,美、歐、日等發(fā)達(dá)地區(qū)的銷售產(chǎn)業(yè)發(fā)展歷史悠久,無論是銷售產(chǎn)品制造業(yè)還是銷售服務(wù)業(yè),都處于全球優(yōu)先地位。國外的谷歌、蘋果等公司,國內(nèi)的阿里巴巴、騰訊、萬科、保利、平安人壽、萬達(dá)等企業(yè)都根據(jù)自身優(yōu)勢扎根大健康領(lǐng)域。拋開服務(wù)型的公共服務(wù)屬性,在市場環(huán)境中,企業(yè)競爭的秘訣是要?jiǎng)?chuàng)造稀缺,結(jié)合消費(fèi)者高、中、低不同等級的需求,并成為難以替代的產(chǎn)品。服務(wù)型項(xiàng)目新市場加入通常耗資巨大,單一的資本進(jìn)入往往會(huì)形成極大的資本壓力,因此一些重大的服務(wù)型項(xiàng)目往往都會(huì)通過數(shù)家有實(shí)力的資本進(jìn)行組合資本。醫(yī)藥健康上下游未整體規(guī)劃,醫(yī)用物流公司十分分散,許多下游需求店鋪及用戶因物流體系不完善而放棄該種醫(yī)藥的引入和使用。由于醫(yī)用藥保存條件要求十分高,存儲(chǔ)倉庫與冷藏運(yùn)輸車等的建設(shè)與運(yùn)行成本便居高不下,使得醫(yī)藥冷鏈物流從建設(shè)到運(yùn)營中的成本都遠(yuǎn)超于傳統(tǒng)物流成本。廈門scRNA空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠實(shí)可信的企業(yè)。烈冰生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長共贏。