m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq,miCLIP）構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜，分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布，Peak關(guān)聯(lián)基因的特征，聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制，作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1，通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié)，作者研...

3）基因/蛋白質(zhì)表達(dá)定性或定量檢測在進(jìn)行分子檢測的過程中，保持核酸和蛋白質(zhì)的完整性至關(guān)重要，因此在取樣過程中，應(yīng)盡量避免核酸及蛋白質(zhì)的降解。如不注意采樣過程，將會導(dǎo)致樣本中的核酸及蛋白質(zhì)的無差別降解，嚴(yán)重影響后續(xù)分子檢測結(jié)果。在條件允許的情況下，樣本在離體后應(yīng)立刻裝入凍存管內(nèi)，并立即放入液氮中進(jìn)行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中，可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進(jìn)行RNA酶的。針對蛋白質(zhì)提取樣本的保存，我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進(jìn)行短期處理。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印跡（Westernblotting，WB），這兩種實驗手段...

用伊紅乙醇液對比染色1~3min。（4）將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色，然后放入無水乙醇中3~5min，吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀察在鏡下可見卵巢呈扁橢圓形，表面為單層扁平上皮細(xì)胞或單層立方上皮，卵巢實質(zhì)分為皮質(zhì)和髓質(zhì)?？梢娚掀?，原始卵泡和生長卵泡。卵巢組織中各發(fā)育階段卵泡及卵巢基質(zhì)的形態(tài)結(jié)構(gòu)清晰可見,細(xì)胞核呈藍(lán)紫色,細(xì)胞質(zhì)及間質(zhì)成分呈淺紅色,卵泡中卵母細(xì)胞、卵泡細(xì)胞、透明帶均清晰可見。注意事項1.取材注意事項（1）取材動作要迅速，不宜作太久的拖延以免組織細(xì)胞的成分、結(jié)構(gòu)等發(fā)生變化。（2）切片材料應(yīng)根據(jù)需要觀察的部位進(jìn)行選擇，盡可能不要損傷所需要的部分。（3）切...

小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴，引起輕微的血管擴(kuò)張；用無菌手術(shù)刀、刀片或鋒利的剪刀，快速截斷小鼠尾尖1-2毫米。如果需要多次，之后每次需截除2-3毫米；從尾部像尾尖方向按摩，增加血流；用采集血液；結(jié)束后，按壓傷口或使用止血劑來止血；每次量大約可達(dá)。小鼠眼球取血單手保定好小鼠；必要時剪掉小鼠胡須，防止污染血液；輕壓取血側(cè)眼部皮膚，使眼球充血突出；用彎頭鑷夾取眼球并快速在摘取；同時用左手中指輕按小鼠心臟部位，以加快心臟泵血速度；當(dāng)血液流盡時，用脫臼法處死小鼠；大鼠眼眶取血先將小鼠進(jìn)行麻醉，大鼠翻正反射消失時不在繼續(xù)麻醉；抗凝處理過的玻璃毛細(xì)采樣管，掰成2-3厘米長度；右手食指和拇指輕按眼眶兩側(cè)皮膚，使眼球...

膿毒癥動物模型必須具備以下基本要素：有膿毒癥典型的高排低阻血流動力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài)；伴發(fā)多個功能障礙；有較高的自然死亡率，根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸，要求動物模型的自然死亡率達(dá)到50%～70%；膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過度造成的自身損傷，不是細(xì)菌和內(nèi)對機(jī)體的直接損傷，故出現(xiàn)功能障礙及動物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時間間距。一般在制模后6～12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實驗動物的選擇在制作動物模型時多選用雄性小鼠，因為雌性小鼠較雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克，且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大，而雄性小鼠在膿毒癥時更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型？盲腸結(jié)扎穿孔模型...

外泌體的功能外泌體可能作為細(xì)胞之間物質(zhì)和信號通訊的途徑，不同的細(xì)胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實現(xiàn)細(xì)胞間通訊，這些外泌體被受體細(xì)胞吸收，通過物質(zhì)交換或釋放內(nèi)含物實現(xiàn)物質(zhì)和信號的交流。外泌體與受體細(xì)胞的信息交流可能通過以下4種途徑實現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質(zhì)被目的細(xì)胞表面的受體識別，從而靶細(xì)胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質(zhì)碎片可作為目的細(xì)胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細(xì)胞膜融合，將蛋白質(zhì)和RNA等內(nèi)容物釋放進(jìn)去，此類膜融合可能改變靶細(xì)胞的一些膜特性，例如脂質(zhì)和膜蛋白質(zhì)的密度及種類;目的細(xì)胞通過胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑，外泌體將其攜帶的生物信息運(yùn)輸?shù)街苓叞屑?xì)胞或經(jīng)血液等體...

用伊紅乙醇液對比染色1~3min。（4）將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色，然后放入無水乙醇中3~5min，吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀察在鏡下可見卵巢呈扁橢圓形，表面為單層扁平上皮細(xì)胞或單層立方上皮，卵巢實質(zhì)分為皮質(zhì)和髓質(zhì)?？梢娚掀ぃ悸雅莺蜕L卵泡。卵巢組織中各發(fā)育階段卵泡及卵巢基質(zhì)的形態(tài)結(jié)構(gòu)清晰可見,細(xì)胞核呈藍(lán)紫色,細(xì)胞質(zhì)及間質(zhì)成分呈淺紅色,卵泡中卵母細(xì)胞、卵泡細(xì)胞、透明帶均清晰可見。注意事項1.取材注意事項（1）取材動作要迅速，不宜作太久的拖延以免組織細(xì)胞的成分、結(jié)構(gòu)等發(fā)生變化。（2）切片材料應(yīng)根據(jù)需要觀察的部位進(jìn)行選擇，盡可能不要損傷所需要的部分。（3）切...

轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果及TCGA數(shù)據(jù)庫分析）圖5RNA-Seq和m6A-seq聯(lián)合鑒定SOCS2是介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中，都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化，但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細(xì)胞系中，通過敲除m6A甲基轉(zhuǎn)移酶FTO篩選到表達(dá)差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調(diào)控。進(jìn)一步通過MeRIP-Seq發(fā)現(xiàn)相當(dāng)一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析，他們發(fā)現(xiàn)了區(qū)分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄...

轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進(jìn)靶基因的翻譯效率，并降低其mRNA的豐度，在精子發(fā)生過程中起關(guān)鍵作用。當(dāng)減數(shù)分裂開始時YTHDC2表達(dá)上調(diào)，YTHDC2敲除小鼠的生殖細(xì)胞沒有經(jīng)過偶線期的發(fā)育導(dǎo)致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應(yīng)中，METTL3可促進(jìn)DNA聚合酶κ（Polκ）與核酸剪切修復(fù)途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點，當(dāng)缺失METTL3時，細(xì)胞無法迅速修復(fù)UV照射引起的突變，并且對UV照射更加敏感[25]。在淋巴細(xì)胞性小鼠過繼轉(zhuǎn)移模型中，Mettl3缺陷通過影響mRNAm6A修飾，降低SOCS家族mRNA衰減，增加mRNA...

m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq,miCLIP）構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜，分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布，Peak關(guān)聯(lián)基因的特征，聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制，作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1，通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié)，作者研...

建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。因此，疾病模型研究結(jié)果的可靠程度取決于模型與人類疾病的相似或可比擬的程度。接下來就讓上海研錄帶您了解相關(guān)知識。一個好的疾病模型應(yīng)具有以下特點：①能夠再現(xiàn)所要研究的人類疾病，動物疾病表現(xiàn)應(yīng)該與人類疾病相似；②動物能重復(fù)產(chǎn)生該疾病，盡可能能在兩種動物體內(nèi)復(fù)制該??；③動物背景資料完整，實驗動物合格，生命周期要滿足實驗需要;④動物要價廉、來源充足、便于運(yùn)送；⑤盡可能選用小動物。生物醫(yī)學(xué)科研專業(yè)設(shè)計中常要考慮如何建立動物模型的問題，因為很多闡明疾病及療效機(jī)制的實驗不可能或不應(yīng)該在患者身上進(jìn)行。常要依賴于復(fù)制動物模型，但一定要進(jìn)行周密設(shè)計，設(shè)計時要遵循下列一些原則：(...

二甲苯Ⅰ、Ⅱ各15min至透明。（2）放入二甲苯和石蠟等量混合液處理15min，再放入石蠟Ⅰ、Ⅱ透蠟各50~60min。透蠟在恒溫箱內(nèi)進(jìn)行，箱內(nèi)溫度保持在55~60℃左右。4、包埋（1）用鑷子夾取蠟?zāi)Ｔ诰凭珶羯仙约訜幔⒌谷肷僭S從溫箱中取出的純石蠟。（2）再將鑷子在酒精燈上稍加熱，夾取材料將切面朝下放入蠟?zāi)Ｖ?，排列整齊，再放上包埋盒，輕輕倒入熔蠟。5、切片、展片、貼片（1）將包埋好的石蠟塊固定在切片機(jī)上，調(diào)整厚度調(diào)節(jié)器到所需的切片厚度，一般為4~6μm。（2）切下的組織薄片要放到加熱的水中燙平，再貼到載玻片上，放45℃恒溫箱中烘干。二、HE染色1、脫蠟、復(fù)水（1）保持水浴鍋溫度為60℃，將切片...

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾，在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3（甲基轉(zhuǎn)移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶，在人肝細(xì)胞（HCC）和多種實體中高表達(dá)。在臨床上，METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細(xì)胞增殖，遷移及克隆形成。體內(nèi)實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng)，內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-...

把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話，要用TBST泡洗三遍再轉(zhuǎn)移至一抗溶液中，BSA封閉的可以直接轉(zhuǎn)移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個長方形，這里的寬與長相對應(yīng))不大于8毫米，我習(xí)慣置于15毫升離心管中孵育，兩條膜"背對背"式放置于一個管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米，就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過夜，一般是12-18個小時，注意放置水平，用搖床。內(nèi)參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現(xiàn)條帶連在一起的情況，這時可以縮短孵育時間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個小...

科手術(shù)設(shè)備|細(xì)胞/組織支持系統(tǒng)|膜片鉗|輔助設(shè)備|其它常用耗材燒杯|漏斗|量筒|廣口罐|研缽和研杵|手套|移液管|移液器(Pipette)單道手動移液器|單道電動移液器|多道手動移液器多道電動移液器|正置換移液器|瓶口分液器吸頭(Tips)濾芯吸頭(滅菌)|濾芯吸頭(未滅菌)|普通吸頭(滅菌)普通吸頭(未滅菌)|多道移液器吸頭液體工作站吸頭|其它瓶(Bottle)離心瓶|稱量瓶|存儲瓶|比重瓶|血清瓶|滴瓶吸氣瓶|細(xì)胞培養(yǎng)瓶|培養(yǎng)基瓶|其它瓶(Flask)藍(lán)蓋瓶|燒瓶|平底燒瓶|克氏(長頸)燒瓶|碘測定燒瓶|蒸餾燒瓶|容量瓶|過濾瓶|其它管(Tube&Vial)離心管|微離心管|樣品儲存管|凍...

如胰腺，一般取胰島較多的胰腺尾部；肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進(jìn)行多樣本的采集，采集順序應(yīng)按照：消化，神經(jīng)系統(tǒng)，皮膚，肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排，然后決定其切面的走向；如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等，應(yīng)盡可能掉，否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定（1）固定的方法：①小塊固定法：從動物取下的小塊，立即置入液態(tài)固定劑（這是應(yīng)用經(jīng)常的方法）。②注射/灌注固定法：某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對整個臟器或整個動物進(jìn)行固定，這時宜采用注射固定法，將固定液注入血管，經(jīng)血管分支到達(dá)整個和全身...

外泌體的抑制作用外泌體水平升高通常與不同類型的惡化相關(guān)，一些研究人員希望能通過降低外泌體到正常水平來防止不良預(yù)后。從這個角度出發(fā)，許多正在進(jìn)行的研究旨在通過調(diào)節(jié)外泌體生成分泌的過程或通過特異性靶向其成分抑制其與靶細(xì)胞的相互作用來調(diào)節(jié)外泌體的產(chǎn)生。如今我們對外泌體機(jī)制和不同生理和病理條件下的功能的理解呈指數(shù)級增長，雖然目前其生物學(xué)功能還未完全解析清楚，但研究者們在許多領(lǐng)域均已對其進(jìn)行了深入探索。外泌體不是廢物顆粒，而是細(xì)胞間通訊的關(guān)鍵介質(zhì)，作為宿主細(xì)胞的衛(wèi)星，外泌體包含大量的生物信息，其功能超出了初的預(yù)期，宿主細(xì)胞控制著外泌體的內(nèi)容物，從而改變了自己或其他細(xì)胞的命運(yùn)。其次，外泌體對的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移有...

用一次定量放血法可擺分之?dāng)[造成出血性休克，擺分之?dāng)[死亡，這就符合可重復(fù)性和達(dá)到了標(biāo)準(zhǔn)化要求。(三)可靠性復(fù)制的動物模型應(yīng)該力求可靠地反映人類疾病，即可特異地、可靠地反映某種疾病或某種功能、代謝、結(jié)構(gòu)變化，應(yīng)具備該種疾病的主要癥狀和體征，經(jīng)化驗或X線照片、心電圖、病理切片等證實。若易自發(fā)地出現(xiàn)某些相應(yīng)病變的動物，就不應(yīng)加以選用，易產(chǎn)生與復(fù)制疾病相混淆的疾病者也不宜選用。(四)適用性和可控性供醫(yī)學(xué)實驗研究用的動物模型，在復(fù)制時，應(yīng)盡量考慮到今后臨床應(yīng)用和便于控制其疾病的發(fā)展，以利于研究的開展。(五)易行性和經(jīng)濟(jì)性在復(fù)制動物模型時，所采用的方法應(yīng)盡量做到容易執(zhí)行和合乎經(jīng)濟(jì)條件原則。以上就是上海研錄為...

轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進(jìn)靶基因的翻譯效率，并降低其mRNA的豐度，在精子發(fā)生過程中起關(guān)鍵作用。當(dāng)減數(shù)分裂開始時YTHDC2表達(dá)上調(diào)，YTHDC2敲除小鼠的生殖細(xì)胞沒有經(jīng)過偶線期的發(fā)育導(dǎo)致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應(yīng)中，METTL3可促進(jìn)DNA聚合酶κ（Polκ）與核酸剪切修復(fù)途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點，當(dāng)缺失METTL3時，細(xì)胞無法迅速修復(fù)UV照射引起的突變，并且對UV照射更加敏感[25]。在淋巴細(xì)胞性小鼠過繼轉(zhuǎn)移模型中，Mettl3缺陷通過影響mRNAm6A修飾，降低SOCS家族mRNA衰減，增加mRNA...

如果實驗平臺的儀器需要提前預(yù)約，建議提前規(guī)劃好使用的時間。反復(fù)總結(jié)尋找答案在整個預(yù)實驗的過程中可能會出現(xiàn)很多問題。比如造模效果欠佳、灌胃操作不當(dāng)、腹腔注射操作失誤、使用不當(dāng)?shù)纫饎游锼劳觥Ｃ坑龅絾栴}都需要自己想辦法解決，可以從導(dǎo)師、師兄師姐、文獻(xiàn)、貼吧、視頻教程等找到答案。比如筆者曾遇到同樣的給，發(fā)現(xiàn)有的大鼠得很深，有的大鼠還活蹦亂跳，在反復(fù)嘗試調(diào)整濃度，給劑量，更換方式，后來才發(fā)現(xiàn)是動物體重秤的準(zhǔn)度有問題，導(dǎo)致體重秤得不準(zhǔn)。因此，需要自己反復(fù)琢磨到底是實驗過程中哪一個環(huán)節(jié)出現(xiàn)問題，逐一排除。也要求在每一個實驗步驟需要標(biāo)準(zhǔn)化，統(tǒng)一化，盡可能的排除干擾因素，這樣方便在遇到問題快的找到答案。同時，...

RNA甲基化修飾（m6A）研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上，而N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine,m6A）是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA，circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上，其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]?！熬幋a器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶，目前已知這個復(fù)合物的成分有METTL3，METTL14,WTAP和KIAA1429；而ALKBH5和FTO作為去甲基酶（...

產(chǎn)品庫科研資訊實驗試用中心技術(shù)專題會議商城生意通品牌求購發(fā)布產(chǎn)品儀器設(shè)備庫細(xì)胞分析儀器儲存保存設(shè)備實驗室箱體/搖床實驗室安全設(shè)備生物芯片3D打印儀器設(shè)備庫生物芯片影像系統(tǒng)測讀系統(tǒng)光譜系統(tǒng)分子生物實驗儀器顯微系統(tǒng)色譜系統(tǒng)質(zhì)譜系統(tǒng)實驗室自動化基因組/蛋白組設(shè)備植物生理/動物生理毒理/實驗動物設(shè)備神經(jīng)生物學(xué)儀器組織學(xué)設(shè)備過濾裝置電化學(xué)儀器細(xì)胞培養(yǎng)儀器耗材庫常用耗材移液器(Pipette)PCR耗材儀器配套耗材細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分子生物學(xué)耗材耗材庫常用耗材移液器(Pipette)吸頭(Tips)瓶(Bottle)瓶(Flask)管(Tube&Vial)PCR耗材微孔板色譜柱色譜介質(zhì)細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分...

且研究表明HNRNPC通過m6A與RNA結(jié)合調(diào)控目標(biāo)轉(zhuǎn)錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統(tǒng)[10]m6A生物學(xué)功能越來越多的證據(jù)表明m6A修飾在哺乳動物中發(fā)揮重要的生物功能。例如，在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控RNA的穩(wěn)定性[11]、定位[12]、運(yùn)輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發(fā)現(xiàn)依賴METTL3的pri-miRNA甲基化，會促進(jìn)DGCR8識別和加工，從而促進(jìn)microRNA的成熟[15]。此外，m6A識別蛋白HNRNPA2B1促進(jìn)pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外，環(huán)狀RNA上m6A的修飾能促進(jìn)環(huán)狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達(dá)調(diào)控...

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾，在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3（甲基轉(zhuǎn)移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶，在人肝細(xì)胞（HCC）和多種實體中高表達(dá)。在臨床上，METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細(xì)胞增殖，遷移及克隆形成。體內(nèi)實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng)，內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-...

實驗樣本分類實驗一般采取樣本有：血液樣本、樣本和細(xì)胞樣本。通常，樣本采集后，應(yīng)立即用等滲溶液（PBS或生理鹽水）盡量把血液漂洗干凈（除非血液也是分析對象），用濾紙或紗布吸干，把樣本分切成幾分，每份的體積約2個黃豆大小，每份用一個管子裝。血液樣本的采集應(yīng)根據(jù)不同實驗的要求，將會采取不同策略。血清樣本：全血中不加抗凝劑，血液凝固后取出的不含凝血因子的淡黃色透明液體。（全血標(biāo)本室溫放置2小時3000rpm/min離心15min）血漿樣本：全血中加抗凝劑，血液凝固后取出的含凝血因子的淡黃色透明液體。（可用EDTA或肝素作為抗凝劑，標(biāo)本采集后30分鐘內(nèi)于2-8℃，3000rpm/min離心15min）如...

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾，在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3（甲基轉(zhuǎn)移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶，在人肝細(xì)胞（HCC）和多種實體中高表達(dá)。在臨床上，METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細(xì)胞增殖，遷移及克隆形成。體內(nèi)實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng)，內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-...

首先，預(yù)實驗必須要當(dāng)做正式實驗來對待（態(tài)度要放端正，這是必須的）。預(yù)實驗的每一步都需要詳細(xì)規(guī)劃，多方籌謀。不論是實驗動物的選擇，還是檢測試劑的購買，都盡量和正式實驗統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。建議大家先把所有試劑和購買完畢后，再去購買實驗動物。因為動物會長胖，長胖后給劑量就要增加，不僅多花錢，并且還容易影響實驗效果。筆者曾經(jīng)提前將實驗動物買回，但因為特殊原因沒能購買到造模，終只能忍痛割愛將動物贈送他人，白白虧了一筆血汗錢（那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖，沒辦法用作造模）。動物及試劑購買首先需要考慮：實驗動物品種、體重、性別、周齡（通常根據(jù)既往文獻(xiàn)報道可以獲得答案）、數(shù)量（需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物...

首先，預(yù)實驗必須要當(dāng)做正式實驗來對待（態(tài)度要放端正，這是必須的）。預(yù)實驗的每一步都需要詳細(xì)規(guī)劃，多方籌謀。不論是實驗動物的選擇，還是檢測試劑的購買，都盡量和正式實驗統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。建議大家先把所有試劑和購買完畢后，再去購買實驗動物。因為動物會長胖，長胖后給劑量就要增加，不僅多花錢，并且還容易影響實驗效果。筆者曾經(jīng)提前將實驗動物買回，但因為特殊原因沒能購買到造模，終只能忍痛割愛將動物贈送他人，白白虧了一筆血汗錢（那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖，沒辦法用作造模）。動物及試劑購買首先需要考慮：實驗動物品種、體重、性別、周齡（通常根據(jù)既往文獻(xiàn)報道可以獲得答案）、數(shù)量（需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物...

代謝組學(xué)的研究對象大都是相對分子量在1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)，因此常用的血液樣本在取樣后，應(yīng)小心操作，防止溶血，盡快分離出血清，分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實驗的動物采集相對其他樣品的采集，操作更繁瑣，在處理過程中許多細(xì)節(jié)容易忽略，造成數(shù)據(jù)不完美（甚至不能用）。因此接下來將重點介紹樣品采集的注意事項及其固定。樣品采集注意事項應(yīng)新鮮，操作時間盡可能短，否則細(xì)胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動物心臟還在跳動時采集，樣本取出后在5分鐘以內(nèi)置于固定液內(nèi)，避免長時間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜，較為理想的厚度為2mm左右，主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內(nèi)部。勿使塊受擠...

如胰腺，一般取胰島較多的胰腺尾部；肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進(jìn)行多樣本的采集，采集順序應(yīng)按照：消化，神經(jīng)系統(tǒng)，皮膚，肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排，然后決定其切面的走向；如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等，應(yīng)盡可能掉，否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定（1）固定的方法：①小塊固定法：從動物取下的小塊，立即置入液態(tài)固定劑（這是應(yīng)用經(jīng)常的方法）。②注射/灌注固定法：某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對整個臟器或整個動物進(jìn)行固定，這時宜采用注射固定法，將固定液注入血管，經(jīng)血管分支到達(dá)整個和全身...