CRISPR/Cas9的問題：和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣，CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時(shí)也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標(biāo)位點(diǎn)發(fā)生切割，引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會(huì)直接破壞細(xì)胞的基本功能，帶來不可預(yù)控的嚴(yán)重后果。如何減輕脫靶效應(yīng)？gRNA的GC含量：gRNA 的序列結(jié)構(gòu)對(duì)CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性，因?yàn)檩^高的 GC 含量穩(wěn)定了DNA：RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結(jié)合。gRNA-on-gRNA序列的位置對(duì)編輯有影響，位于四個(gè)核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥嘌呤優(yōu)先選...

基因編輯定量脫靶檢測(cè):基因編輯定量脫靶檢測(cè),使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯，可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯?dòng)物基因組的特定位點(diǎn)。然而，可能會(huì)出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾，這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定，并破壞正常基因的功能，從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。.基于PCR的檢測(cè)唯可生物采用LTA-PCR方法分析基因組編輯引起的靶向和非靶向整合。1.方便地檢測(cè)脫靶目標(biāo)變化和隨機(jī)性2.適用于解決監(jiān)管機(jī)構(gòu)提出的具體問題3.定制化生物信息學(xué)分析基于NGS的檢測(cè)唯可生物使用靶向富集測(cè)序(TES)進(jìn)行全基因組檢測(cè)和定量靶向和非靶向改變。我們可在一次反應(yīng)中經(jīng)濟(jì)高效...

降低CRISPR脫靶效應(yīng)，你可以做什么？CRISPR技術(shù)是一種簡單而強(qiáng)大的編輯基因組的工具。它使研究人員能夠輕松地改變DNA序列并修改基因功能。它的許多潛在應(yīng)用包括糾正遺傳缺陷，zhiliao和預(yù)防疾病的傳播，以及改善農(nóng)作物。在流行的用法中，CRISPR是CRISPR-Cas9的簡寫。CRISPRs是“有規(guī)律地間隔的短回文重復(fù)序列”的縮寫。它是DNA的一個(gè)特殊區(qū)域，有兩個(gè)明顯的特征：存在核苷酸重復(fù)和間隔物。核苷酸的重復(fù)序列分布在整個(gè)CRISPR區(qū)域。間隔物是穿插在這些重復(fù)序列中的DNa pian段。脫靶檢測(cè)服務(wù)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。深圳基因編輯脫靶檢測(cè)...

基因重排或重組。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品所用載體及其攜帶的基因發(fā)生復(fù)制時(shí)，可能出現(xiàn)非zhiliao目的非預(yù)期的基因表達(dá)或改變，或者與相應(yīng)野生型或輔助病毒互補(bǔ)后產(chǎn)生回復(fù)突變或意外復(fù)制或形成6新的病毒。免疫原性。由于基因zhiliao產(chǎn)品在體內(nèi)的持續(xù)暴露或者需要多次給藥等情況，機(jī)體可能產(chǎn)生針對(duì)基因zhiliao載體或編碼的作用因子的免疫應(yīng)答。由于基因zhiliao產(chǎn)品在靶細(xì)胞或組織中的表達(dá)時(shí)間、分布范圍或表達(dá)強(qiáng)度等差異，機(jī)體免疫應(yīng)答的后果可能從不具有臨床意義的一過性的免疫反應(yīng)，到針對(duì)靶細(xì)胞或組織的免疫攻擊，甚至產(chǎn)生嚴(yán)重危及生命的不良事件。脫靶檢測(cè)企業(yè)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高...

BLESS：利用生物素標(biāo)簽對(duì)DSBs進(jìn)行原位標(biāo)記，后經(jīng)PCR擴(kuò)增實(shí)現(xiàn)對(duì)于生物素標(biāo)記片段的富集，并通過二代測(cè)序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點(diǎn)檢測(cè)。直接檢測(cè)細(xì)胞中的切割位點(diǎn)，靈敏度與細(xì)胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS，片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭，然后進(jìn)行全基因組易位測(cè)序。高通量的全基因組范圍檢測(cè)，可準(zhǔn)確檢測(cè)DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq，將dsODN s標(biāo)簽整合到DSBs位點(diǎn)，通過二代測(cè)序檢測(cè)這些標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域，從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細(xì)胞內(nèi)檢測(cè)方法。能檢測(cè)低頻脫靶突變。Digenome-Seq，片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育，進(jìn)行全基因組測(cè)序檢測(cè)脫靶...

自基因zhiliao出現(xiàn)之日起，安全性問題就隨之產(chǎn)生了，并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙，吳寧博士認(rèn)為：“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市，安全性會(huì)將是一個(gè)非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話，在市場(chǎng)化道路上就會(huì)受到很大影響。尤其是基因zhiliao，目前處于起始階段，一旦出現(xiàn)不良事件，很有可能對(duì)整個(gè)行業(yè)都會(huì)產(chǎn)生致命打擊。具體說來，基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等?！泵摪袡z測(cè)報(bào)告，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。上海定量脫靶檢測(cè)guide-sequence如何檢測(cè)脫靶...

不論在科研還是臨床中，CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報(bào)，也同時(shí)伴隨著各種風(fēng)險(xiǎn)，這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險(xiǎn)。本文中我們盤點(diǎn)了多種主流的CRISPR脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法，但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測(cè)，一個(gè)項(xiàng)目中只使用一種脫靶檢測(cè)方法也是不足夠的。如何在實(shí)驗(yàn)中，特別是臨床試驗(yàn)中多方面評(píng)估CRISPR的脫靶風(fēng)險(xiǎn)，需要將多種脫靶檢測(cè)方法有效組合。同時(shí)，每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點(diǎn)，如何評(píng)估這種風(fēng)險(xiǎn)，如何降低這種風(fēng)險(xiǎn)，具體的解決方案我們用臨床實(shí)例來為大家介紹。影響CRISPR靶向性效率和特異性的因素有哪些？北京育種脫靶檢測(cè)企業(yè)不同基因zhiliao...

插入突變風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估一些整合性載體（如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子）可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中，這可能會(huì)導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因，從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險(xiǎn)增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素包括：（1）載體的整合特征，如插入位點(diǎn)的偏好性；（2）載體的設(shè)計(jì)，如增強(qiáng)子、啟動(dòng)子等構(gòu)建元件的活性，影響鄰近基因的潛力；產(chǎn)生剪接突變體的潛在剪接位點(diǎn)或多聚腺苷酸信號(hào)等；（3）細(xì)胞載體拷貝數(shù)；4）轉(zhuǎn)基因表達(dá)產(chǎn)物的功能活性（如與細(xì)胞生長調(diào)控相關(guān)）和表達(dá)水平；5）靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性，這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)。檢測(cè)脫靶效應(yīng)比較好的方法:CIRCLE-seq。上海cr...

CIRCLE-Seq，將gDNA打斷并環(huán)化，環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育，NGS測(cè)序檢測(cè)線性化的DNapian段，確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測(cè)序，成本相對(duì)較低，能檢測(cè)低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估，安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估服務(wù)，幫助您挑選高度特異，脫靶率低的sgRNA進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。同時(shí)，我們也協(xié)助您檢測(cè)分析基因編輯后細(xì)胞樣品的脫靶情況，通過各種高通量測(cè)序檢測(cè)技術(shù)，我們能準(zhǔn)確的分析全基因組范圍內(nèi)的脫靶位點(diǎn)，推動(dòng)CRISPR/Cas9技術(shù)在zhiliao藥物開發(fā)和臨床研究中的應(yīng)用。我們的優(yōu)勢(shì)：靈敏度高：能檢測(cè)低頻脫靶突變★準(zhǔn)確性高：檢測(cè)結(jié)果可通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證★多種檢測(cè)...

誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來源的細(xì)胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞（inducedpluripotentstemcell，iPS）自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn)，在體內(nèi)可形成畸胎瘤，整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此，應(yīng)在shou次臨床試驗(yàn)前完成致瘤性試驗(yàn)。若設(shè)計(jì)科學(xué)合理，能夠滿足評(píng)價(jià)要求，也可在持續(xù)時(shí)間足夠長的毒性研究中評(píng)估致瘤性風(fēng)險(xiǎn)。體內(nèi)致瘤性試驗(yàn)建議采用摻入未分化iPS細(xì)胞的細(xì)胞產(chǎn)品作為陽性對(duì)照，以確認(rèn)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的靈敏度。如果iPS細(xì)胞設(shè)計(jì)了機(jī)制以降低致瘤風(fēng)險(xiǎn)，應(yīng)在體內(nèi)試驗(yàn)中確認(rèn)/驗(yàn)證此類機(jī)制的功能 脫靶切割位點(diǎn)已在基因編輯技術(shù),CRISPR / Cas9,ZFNs和TALE...

長期隨訪的觀察時(shí)間長期隨訪的持續(xù)時(shí)間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況（生物分布和給藥途徑）等導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn)，應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時(shí)間。一般而言，針對(duì)不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下：?具有基因組整合活性的載體（例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒載體）和轉(zhuǎn)座子元件建議觀察不短于15年。?可以產(chǎn)生持續(xù)ganran、或有潛伏再jihuo風(fēng)險(xiǎn)的細(xì)菌或病毒載體（如單純皰疹病毒）建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)（ganran或再jihuo）。基因編輯產(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。預(yù)算允許的情況下，通過全...

由于設(shè)計(jì)的sgRNA會(huì)與非靶點(diǎn)DNA序列錯(cuò)配，引入非預(yù)期的基因突變，即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性，這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此，研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測(cè)脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評(píng)估方法中，有一種方法為GUIDE-seq，其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸（dsODN）標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂，然后對(duì)標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序，通過生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測(cè)CRISPR脫靶效應(yīng)，從而改變了以往先預(yù)測(cè)假定脫靶位點(diǎn)再檢測(cè)的思路；與其他的評(píng)估方法相比，GUIDE-seq更...

持續(xù)ganran，有復(fù)制能力的病毒或細(xì)菌載體基因zhiliao產(chǎn)品，有可能在免疫能力低下的患者中發(fā)展為持續(xù)ganran，進(jìn)一步增加發(fā)生遲發(fā)但嚴(yán)重ganran的風(fēng)險(xiǎn)?；蚓庉嫽钚裕蚓庉嫷刃滦突騴hiliao產(chǎn)品有獨(dú)特的基因組修飾功能，可誘導(dǎo)人類基因組中的位點(diǎn)特異性改變或修飾，同時(shí)也可能在基因組中發(fā)生脫靶效應(yīng)，導(dǎo)致非預(yù)期的基因表達(dá)變化，進(jìn)而增加未知且不可預(yù)測(cè)的遲發(fā)性不良反應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)。非預(yù)期的生物分布，某些基因zhiliao產(chǎn)品需要在特定的細(xì)胞或組織中表達(dá)以實(shí)現(xiàn)zhiliao目的，如果基因zhiliao產(chǎn)品在非預(yù)期的細(xì)胞、組織或qiguan中表達(dá)或修飾，可能引起非靶細(xì)胞功能、生長或/分化改變，甚至...

檢測(cè)方法的敏感度、特異性和可重復(fù)性應(yīng)經(jīng)過驗(yàn)證，并設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)年栃院完幮詫?duì)照；當(dāng)體內(nèi)靶細(xì)胞或替代細(xì)胞中載體序列陽性的比例超出預(yù)期范圍時(shí)，應(yīng)開展克隆性生長的評(píng)估。如果存在優(yōu)勢(shì)克隆或單克隆生長，應(yīng)在不超過3個(gè)月的時(shí)間內(nèi)再次檢測(cè)確認(rèn)，并盡快開展整合位點(diǎn)的分析。當(dāng)載體的整合位點(diǎn)確定后，應(yīng)與人類基因組數(shù)據(jù)庫及基因組的其他數(shù)據(jù)庫等進(jìn)行比較，確定整合位點(diǎn)的基因功能，評(píng)估是否與包括zheng在內(nèi)的任何疾病有關(guān)。如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽性細(xì)胞的克隆性生長，或檢測(cè)發(fā)現(xiàn)基因整合位點(diǎn)在基因或相關(guān)基因附近，應(yīng)縮短檢測(cè)間隔至不超過3個(gè)月并密切監(jiān)測(cè)惡性liu征兆，直至檢測(cè)不到基因zhiliao載體。影響CRISPR靶向性效率和...

但是由于CHIP-seq實(shí)驗(yàn)本身的難度較高，DISCOVER-seq這類方法的接受度并不高。3. 其他特殊方法CRISPR技術(shù)經(jīng)過這么多年的發(fā)展，其應(yīng)用已經(jīng)不局限于造成DNA雙鏈斷裂，一些不要切割DNA雙鏈的CRISPR衍生技術(shù)（如堿基編輯、先導(dǎo)編輯和CRISPRi/a），可以在不引發(fā)隨機(jī)突變的情況下，對(duì)基因組進(jìn)行精細(xì)編輯或者調(diào)控。這些技術(shù)所使用nCas9或dCas9只結(jié)合或者切割雙鏈中的一條鏈，之前的脫靶檢測(cè)方法都不能直接適用。這些CRISPR衍生技術(shù)中，CRISPR產(chǎn)生的脫靶可以被細(xì)分為兩個(gè)部分，其一是Cas9/sgRNA結(jié)合DNA導(dǎo)致的脫靶，這部分信息使用同樣序列的sgRNA進(jìn)行野生型C...

CIRCLE-Seq，將gDNA打斷并環(huán)化，環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育，NGS測(cè)序檢測(cè)線性化的DNapian段，確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測(cè)序，成本相對(duì)較低，能檢測(cè)低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估，安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估服務(wù)，幫助您挑選高度特異，脫靶率低的sgRNA進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。同時(shí)，我們也協(xié)助您檢測(cè)分析基因編輯后細(xì)胞樣品的脫靶情況，通過各種高通量測(cè)序檢測(cè)技術(shù)，我們能準(zhǔn)確的分析全基因組范圍內(nèi)的脫靶位點(diǎn)，推動(dòng)CRISPR/Cas9技術(shù)在zhiliao藥物開發(fā)和臨床研究中的應(yīng)用。我們的優(yōu)勢(shì)：靈敏度高：能檢測(cè)低頻脫靶突變★準(zhǔn)確性高：檢測(cè)結(jié)果可通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證★多種檢測(cè)...

誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來源的細(xì)胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞（inducedpluripotentstemcell，iPS）自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn)，在體內(nèi)可形成畸胎瘤，整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此，應(yīng)在shou次臨床試驗(yàn)前完成致瘤性試驗(yàn)。若設(shè)計(jì)科學(xué)合理，能夠滿足評(píng)價(jià)要求，也可在持續(xù)時(shí)間足夠長的毒性研究中評(píng)估致瘤性風(fēng)險(xiǎn)。體內(nèi)致瘤性試驗(yàn)建議采用摻入未分化iPS細(xì)胞的細(xì)胞產(chǎn)品作為陽性對(duì)照，以確認(rèn)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的靈敏度。如果iPS細(xì)胞設(shè)計(jì)了機(jī)制以降低致瘤風(fēng)險(xiǎn)，應(yīng)在體內(nèi)試驗(yàn)中確認(rèn)/驗(yàn)證此類機(jī)制的功能 高精度脫靶檢測(cè)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高...

Cas9蛋白是一種切割外來DNA的酶，像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個(gè)RNA分子結(jié)合：crRNA和另一個(gè)稱為tracrRNA（或“反式j(luò)ihuocrRNA”）。這兩個(gè)RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進(jìn)行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個(gè)核苷酸互補(bǔ)的。CRISPR技術(shù)是從細(xì)菌和古細(xì)菌的自然防御機(jī)制中改編而來的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白，包括Cas9，來阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過切碎和破壞外來入侵者的DNA來做到這一點(diǎn)。當(dāng)這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復(fù)雜的生物體中時(shí)，它允許對(duì)基因進(jìn)行操縱，或“編輯”。crispr脫靶檢測(cè)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)...

gRNA的長度和錯(cuò)配： 17個(gè)核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下，18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細(xì)胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針：1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個(gè)錯(cuò)配；2) 在PAM的12 bp內(nèi)，應(yīng)避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應(yīng)。gRNA的化學(xué)修飾：在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦?；宜狨?huì)導(dǎo)致位點(diǎn)特異性修飾，使脫靶切割減少40-120倍，同時(shí)保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性，降低脫靶效應(yīng)。影響CRISPR靶向性效率和特異性的因素有哪些？杭州脫靶...

插入突變風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估一些整合性載體（如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子）可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中，這可能會(huì)導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因，從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險(xiǎn)增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素包括：（1）載體的整合特征，如插入位點(diǎn)的偏好性；（2）載體的設(shè)計(jì)，如增強(qiáng)子、啟動(dòng)子等構(gòu)建元件的活性，影響鄰近基因的潛力；產(chǎn)生剪接突變體的潛在剪接位點(diǎn)或多聚腺苷酸信號(hào)等；（3）細(xì)胞載體拷貝數(shù)；4）轉(zhuǎn)基因表達(dá)產(chǎn)物的功能活性（如與細(xì)胞生長調(diào)控相關(guān)）和表達(dá)水平；5）靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性，這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)。脫靶檢測(cè)guide-sequence，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)...

基于已有科學(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果，如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長期存續(xù)，需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素，評(píng)估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究，應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析，分析細(xì)胞的克隆組成以及在關(guān)注基因（如liu相關(guān)調(diào)控基因）附近有無優(yōu)先整合跡象，含有關(guān)注整合位點(diǎn)的細(xì)胞有無優(yōu)先異常增殖。對(duì)于嵌合抗原受體（Chimericantigenreceptor，CAR）或T細(xì)胞受體（Tcellreceptor，TCR）修飾的免疫細(xì)胞，應(yīng)盡可能采用多種方法評(píng)估其靶點(diǎn)相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險(xiǎn)。crispr脫靶檢測(cè)，推薦唯可生物...

CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段，然后首尾相連成環(huán)狀DNA，這種方法很好地避免了DNA隨機(jī)斷裂造成的背景噪聲。實(shí)驗(yàn)的第二步是用Cas9切割環(huán)狀DNA，再連上接頭并進(jìn)行雙端測(cè)序，這樣就可以在一次測(cè)序中同時(shí)獲取切割位點(diǎn)的兩側(cè)序列，彌補(bǔ)了SITE-seq的另一個(gè)缺點(diǎn)。CIRCLE-seq從總體上來說要優(yōu)于SITE-seq，但是將基因組DNA隨機(jī)打斷后成環(huán)的效率并不高，所以同一作者在3年后發(fā)表了CHANGE-seq，用T...

CIRCLE-Seq，將gDNA打斷并環(huán)化，環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育，NGS測(cè)序檢測(cè)線性化的DNapian段，確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測(cè)序，成本相對(duì)較低，能檢測(cè)低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估，安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估服務(wù)，幫助您挑選高度特異，脫靶率低的sgRNA進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。同時(shí)，我們也協(xié)助您檢測(cè)分析基因編輯后細(xì)胞樣品的脫靶情況，通過各種高通量測(cè)序檢測(cè)技術(shù)，我們能準(zhǔn)確的分析全基因組范圍內(nèi)的脫靶位點(diǎn)，推動(dòng)CRISPR/Cas9技術(shù)在zhiliao藥物開發(fā)和臨床研究中的應(yīng)用。我們的優(yōu)勢(shì)：靈敏度高：能檢測(cè)低頻脫靶突變★準(zhǔn)確性高：檢測(cè)結(jié)果可通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證★多種檢測(cè)...

長期表達(dá)。與其他產(chǎn)品相比，部分基因zhiliao產(chǎn)品的明顯特征是可以在患者靶細(xì)胞或基因修飾細(xì)胞中持續(xù)存在并編碼表達(dá)作用因子（功能性蛋白或基因表達(dá)調(diào)節(jié)元件），并通過長久或長期改變靶細(xì)胞或組織的功能來達(dá)到zhiliao效果。同時(shí)，由于基因zhiliao編碼的作用因子在體內(nèi)的長期暴露或表達(dá)異常，可能產(chǎn)生與其功能相關(guān)的長期安全性風(fēng)險(xiǎn)，如細(xì)胞生長失控和惡性liu形成、自身免疫反應(yīng)或其他無法預(yù)測(cè)的遲發(fā)性不良反應(yīng)。潛伏再jihuo。部分病毒類基因zhiliao產(chǎn)品可能存在從潛伏期被再jihuo的可能性或者引起機(jī)體中已有病毒ganran的再jihuo，存在ganran相關(guān)的遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)。脫靶(off-...

GUIDE-Seq脫靶評(píng)估技術(shù)的優(yōu)勢(shì)分析鼓潤致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測(cè)工作，為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標(biāo)準(zhǔn)化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢(shì)：實(shí)用性強(qiáng)：能反映CRISPR在真核細(xì)胞中進(jìn)行基因編輯的在靶與脫靶情況，以進(jìn)行安全性和有效性評(píng)價(jià)；檢測(cè)通量高：一次能檢測(cè)多個(gè)樣本的在靶與脫靶情況，并通過優(yōu)化的標(biāo)簽設(shè)計(jì)，降低實(shí)際的測(cè)序reads數(shù)量；準(zhǔn)確性高：絕大部分檢測(cè)結(jié)果可被驗(yàn)證；靈敏度高：能夠高效檢測(cè)出低頻脫靶位點(diǎn)，檢測(cè)低至0.1%的脫靶突變；實(shí)驗(yàn)難度低：操作過程簡單易行細(xì)胞適應(yīng)性強(qiáng)?；蚓庉嬛委熯^程中安全性評(píng)價(jià)，即脫靶效應(yīng)的檢測(cè)。常州育種脫靶檢測(cè)分析圍繞大家關(guān)心的CRISPR基因...

采用基因編輯技術(shù)制備的細(xì)胞產(chǎn)品。對(duì)于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品，應(yīng)進(jìn)行體外在靶和脫靶活性評(píng)估，以確認(rèn)修飾酶或向?qū)NA對(duì)靶基因序列的特異性。在評(píng)估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn)時(shí)，應(yīng)說明所選擇的評(píng)價(jià)策略的合理性和敏感性。雖然采用計(jì)算機(jī)分析預(yù)測(cè)基因編輯的潛在脫靶位點(diǎn)，并對(duì)潛在脫靶位點(diǎn)進(jìn)行深度測(cè)序分析，可用于評(píng)估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn)；但選擇的評(píng)價(jià)策略仍應(yīng)包含體外全基因組測(cè)序比對(duì)，以證明潛在脫靶位點(diǎn)未出現(xiàn)脫靶。此外，在評(píng)估脫靶活性時(shí)，還應(yīng)評(píng)估種屬特異性的差異、細(xì)胞病理生理狀態(tài)的差異或細(xì)胞類型的差異對(duì)非臨床數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)性的影響。必要時(shí)，還應(yīng)分析基因編輯對(duì)細(xì)胞表型和生理功能的潛在影響。脫靶檢測(cè)方法，推薦唯可生...

長期隨訪的觀察時(shí)間長期隨訪的持續(xù)時(shí)間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況（生物分布和給藥途徑）等導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn)，應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時(shí)間。一般而言，針對(duì)不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下：?具有基因組整合活性的載體（例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒載體）和轉(zhuǎn)座子元件建議觀察不短于15年。?可以產(chǎn)生持續(xù)ganran、或有潛伏再jihuo風(fēng)險(xiǎn)的細(xì)菌或病毒載體（如單純皰疹病毒）建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)（ganran或再jihuo）?；蚓庉嫯a(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。種子脫靶檢測(cè)，推薦唯可生...

CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補(bǔ)定位到靶位點(diǎn)，不論哪種CRISPR系統(tǒng)，都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象，CRISPR定位到脫靶位點(diǎn)引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險(xiǎn)。CRISPR技術(shù)誕生剛過10年，期間迅速取代TALEN和ZFN，成為學(xué)術(shù)界通用的基因編輯技術(shù)，也徹底改變了我們的生物學(xué)研究方法。為提高CRISPR技術(shù)的安全性，特別是往臨床應(yīng)用發(fā)展時(shí)的安全性問題，研究者們一直以提高靶位點(diǎn)的編輯效率和準(zhǔn)確性，同時(shí)降低脫靶位點(diǎn)編輯發(fā)生概率為目標(biāo)，來優(yōu)化CRISPR技術(shù)。另一方面，研究者們也開發(fā)了大量檢測(cè)方法，用于檢測(cè)CRISPR的靶向風(fēng)險(xiǎn)和脫靶風(fēng)險(xiǎn)，用于早期sgRNA序列...

誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來源的細(xì)胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞（inducedpluripotentstemcell，iPS）自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn)，在體內(nèi)可形成畸胎瘤，整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此，應(yīng)在shou次臨床試驗(yàn)前完成致瘤性試驗(yàn)。若設(shè)計(jì)科學(xué)合理，能夠滿足評(píng)價(jià)要求，也可在持續(xù)時(shí)間足夠長的毒性研究中評(píng)估致瘤性風(fēng)險(xiǎn)。體內(nèi)致瘤性試驗(yàn)建議采用摻入未分化iPS細(xì)胞的細(xì)胞產(chǎn)品作為陽性對(duì)照，以確認(rèn)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的靈敏度。如果iPS細(xì)胞設(shè)計(jì)了機(jī)制以降低致瘤風(fēng)險(xiǎn)，應(yīng)在體內(nèi)試驗(yàn)中確認(rèn)/驗(yàn)證此類機(jī)制的功能 如何檢測(cè)是否發(fā)生脫靶？江蘇高精度脫靶檢測(cè)評(píng)估基因編輯定量脫靶檢測(cè):基因編輯定...

不論在科研還是臨床中，CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報(bào)，也同時(shí)伴隨著各種風(fēng)險(xiǎn)，這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險(xiǎn)。本文中我們盤點(diǎn)了多種主流的CRISPR脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法，但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測(cè)，一個(gè)項(xiàng)目中只使用一種脫靶檢測(cè)方法也是不足夠的。如何在實(shí)驗(yàn)中，特別是臨床試驗(yàn)中多方面評(píng)估CRISPR的脫靶風(fēng)險(xiǎn)，需要將多種脫靶檢測(cè)方法有效組合。同時(shí)，每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點(diǎn)，如何評(píng)估這種風(fēng)險(xiǎn)，如何降低這種風(fēng)險(xiǎn)，具體的解決方案我們用臨床實(shí)例來為大家介紹。脫靶檢測(cè)方法，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。嘉興高精度脫靶...