數(shù)字PCR是一種定量的PCR方法,它將含有目標(biāo)序列的反應(yīng)溶液分配到大量的反應(yīng)室中,每個反應(yīng)室只包含少量模板DNA分子。通過PCR擴(kuò)增后,計算陽性反應(yīng)室的比例,并根據(jù)泊松分布進(jìn)行校正,從而實現(xiàn)目標(biāo)核酸序列的定量。dPCR的優(yōu)點在于無需標(biāo)準(zhǔn)曲線,結(jié)果更為準(zhǔn)確可靠;...
質(zhì)粒的不相容性通俗來說,就是一山不能容二虎。但是作為科學(xué)來說,我們需要一個嚴(yán)謹(jǐn)?shù)亩x。“利用同一復(fù)制系統(tǒng)的兩個質(zhì)粒會在復(fù)制和隨后向自細(xì)胞的分配過程中彼此競爭,這樣的質(zhì)粒在細(xì)菌培養(yǎng)物中不能和平共處,這種現(xiàn)象稱之為不相容性”。那要怎么才能在一個菌里面使用兩個質(zhì)粒呢...
質(zhì)粒的不相容性通俗來說,就是一山不能容二虎。但是作為科學(xué)來說,我們需要一個嚴(yán)謹(jǐn)?shù)亩x?!袄猛粡?fù)制系統(tǒng)的兩個質(zhì)粒會在復(fù)制和隨后向自細(xì)胞的分配過程中彼此競爭,這樣的質(zhì)粒在細(xì)菌培養(yǎng)物中不能和平共處,這種現(xiàn)象稱之為不相容性”。那要怎么才能在一個菌里面使用兩個質(zhì)粒呢...
CAR-T細(xì)胞輸注后患者反應(yīng)及毒性分析:本次收集攻擊113例患者,采用qPCR和dPCR檢測20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數(shù)。在接受tissa-celzhiliao的患者中,9例患者接受了DLBCLzhiliao,1例患...
基因療法作為一種前沿的醫(yī)療技術(shù),為眾多以往難以應(yīng)對的健康挑戰(zhàn)帶來了希望。然而,基因療法的成功與否,很大程度上依賴于基因片段在宿主細(xì)胞基因組中的整合位點。整合位點技術(shù)作為確保基因應(yīng)用安全與效果的關(guān)鍵,近年來取得了進(jìn)展。通過不斷發(fā)展和完善整合位點檢測技術(shù),我們可以...
整合位點分析方法比較不同整合位點檢測方法各有特點。傳統(tǒng)方法如Southern印跡操作復(fù)雜但結(jié)果穩(wěn)定;高通量測序技術(shù)信息量大但成本較高;新興方法在靈敏度和特異性方面有所提升。在選擇檢測方法時,應(yīng)考慮實驗?zāi)康?、樣本?shù)量和預(yù)算等因素。對于初步篩查,可采用反向PCR等...
隨著測序技術(shù)的不斷發(fā)展,科學(xué)家們已經(jīng)能夠更精確地識別和定位整合位點。例如,大規(guī)模錨定平行測序(MAPS)等高通量測序技術(shù)為整合位點的分析提供了強有力的支持。這些技術(shù)不僅提高了整合位點識別的準(zhǔn)確性,還簡化了分析過程。此外,科學(xué)家們還在不斷探索新的整合位點系統(tǒng),以...
盡管整合位點檢測技術(shù)在基因應(yīng)用領(lǐng)域取得了進(jìn)展,但仍面臨一些挑戰(zhàn)。例如,現(xiàn)有的檢測方法可能無法完全識別出所有整合位點,特別是那些位于基因組重復(fù)區(qū)域或復(fù)雜結(jié)構(gòu)中的整合位點。此外,整合位點檢測技術(shù)的成本和時間成本仍然較高,限制了其在臨床應(yīng)用中的普及。為了克服這些挑戰(zhàn)...
不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮1.關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細(xì)胞,長期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao...
例如,對于經(jīng)過基因修飾的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品如CAR-T,采用實時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)和流式細(xì)胞術(shù)(Flowcytometry)進(jìn)行PK分析,分別通過測定外源基因拷貝和CAR+細(xì)胞數(shù)量的變化,有助于互相驗證檢測方法的可靠性,可以更duomi...
在基因工程中,質(zhì)粒的拷貝數(shù)應(yīng)該怎么理解?為什么構(gòu)建載體時要選擇高拷貝數(shù)的質(zhì)粒載體?把細(xì)胞當(dāng)做工廠,質(zhì)粒就是廠房里的流水線,拷貝數(shù)就流水線的數(shù)量在理想狀態(tài)下,選擇盡量多的流水線,這樣能得到的產(chǎn)品多,這是很自然的選擇實際上,高拷貝也有它的問題,當(dāng)流水線多到一定程度...
拷貝數(shù)對于質(zhì)粒載體,拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之一。實際上,每個細(xì)菌中的質(zhì)粒的拷貝數(shù)主要決定于質(zhì)粒本身的復(fù)制特性。按照復(fù)制性質(zhì),可以把質(zhì)粒分為兩類:嚴(yán)緊型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制一次時,質(zhì)粒也復(fù)制一次,每個細(xì)菌內(nèi)只含1~2個質(zhì)粒;松弛型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制停止后仍...
CAR-T細(xì)胞輸注后患者反應(yīng)及毒性分析:本次收集攻擊113例患者,采用qPCR和dPCR檢測20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數(shù)。在接受tissa-celzhiliao的患者中,9例患者接受了DLBCLzhiliao,1例患...
在沒有接受任何橋接zhiliao的3名患者中,1名患者有PR,2名患者有PD之前接受過CAR-T細(xì)胞zhiliao。CAR-T細(xì)胞zhiliao后,16例患者發(fā)生CRS,其中3例為高級別CRS。6例ICANS,2例ICANS等級高。CAR-T細(xì)胞拷貝的峰值水平...
實時檢測熒光量的變化,獲得不同樣品達(dá)到一定的熒光信號(閾值)時所需的循環(huán)次數(shù):CT值(CycleThreshold);通過將已知濃度標(biāo)準(zhǔn)品的CT值與其濃度的對數(shù)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,就可以準(zhǔn)確定量樣品的濃度。熒光定量PCR技術(shù)具有簡便、快捷的優(yōu)點,能夠有效擴(kuò)增低拷貝的...
質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移與穿梭質(zhì)粒質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移:是細(xì)菌遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移的一個重要方式。在質(zhì)粒轉(zhuǎn)移過程中,供體菌和受體菌通過結(jié)合作用緊密接觸,質(zhì)粒從供體細(xì)胞向受體轉(zhuǎn)移,同時進(jìn)行質(zhì)粒復(fù)制。按能否自主轉(zhuǎn)移,可以將天然存在的質(zhì)粒分為轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒和非轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒兩大類。這里要注意的是,...
關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細(xì)胞,長期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險,建議申辦方分析基因...
插入突變風(fēng)險評估:一些整合性載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子)可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中,這可能會導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因,從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點的偏好性;(2)載體的設(shè)...
細(xì)胞分布、遷移和增殖引起的后果。與伴隨zhiliao相關(guān)的風(fēng)險(伴隨使用或處理并發(fā)癥時使用免疫抑制劑等)。與給藥程序和給yaofang式有關(guān)的對患者造成的風(fēng)險與手術(shù)操作或產(chǎn)品注射相關(guān)的風(fēng)險。與注射用醫(yī)療器械有關(guān)的用藥錯誤或不當(dāng)?shù)娘L(fēng)險。與產(chǎn)品劑量錯誤和/或用藥不...
高拷貝質(zhì)粒我們可以多提一點質(zhì)粒,低拷貝數(shù)的質(zhì)粒有什么作用呢?確實,低拷貝數(shù)的質(zhì)粒用途不是十分廣闊,主要用于以下兩點:高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往不穩(wěn)定,進(jìn)行大片段克隆或者帶有毒性DNA克隆時會用低拷貝;質(zhì)粒的擴(kuò)增會占用大量資源,當(dāng)載體用于表達(dá)或者其他用途時,也會使用上低...
嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)-T細(xì)胞(CAR-T)是指通過基因修飾技術(shù),使用病毒等載體將帶有特異性抗原識別結(jié)構(gòu)域、鉸鏈區(qū)、跨膜區(qū)、共刺激信號jihuo區(qū)等遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)入自體或異體T細(xì)胞形成的。CAR-T回輸?shù)交颊唧w內(nèi)后,...
主要有兩方面的原因:一方面,高拷貝數(shù)時外源基因的表達(dá)量不再由質(zhì)粒的拷貝數(shù)決定,可能是由轉(zhuǎn)錄和翻譯水平?jīng)Q定的;另一方面,高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往很不穩(wěn)定。由于質(zhì)粒拷貝數(shù)的變化直接與基因目標(biāo)產(chǎn)物的產(chǎn)率有關(guān),因此對于重組蛋白的生產(chǎn)來說,質(zhì)粒的拷貝數(shù)是一個非常重要的參數(shù)。同...
對特定類型基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品的特殊考慮鑒于基因修飾細(xì)胞的產(chǎn)品種類繁多、各有特點,除上述一般技術(shù)要求外,還應(yīng)基于產(chǎn)品的特性進(jìn)行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。CAR或TCR修飾的免疫細(xì)胞對于嵌合抗原受體(Chimericantigenrec...
中文名拷貝數(shù)外文名copynumber定義某基因在某一生物基因組中的個數(shù)變異表現(xiàn)亞顯微水平的缺失和重復(fù)適用學(xué)科生物學(xué)分類嚴(yán)緊型和松弛型影響因素質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)...調(diào)節(jié)因素阻遏蛋白、反義RNA...(一)在細(xì)菌細(xì)胞中,某種特定質(zhì)粒的數(shù)目。根據(jù)復(fù)制特性,質(zhì)粒分嚴(yán)...
插入突變風(fēng)險評估:一些整合性載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子)可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中,這可能會導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因,從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點的偏好性;(2)載體的設(shè)...
臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險,需要開展長期隨訪觀察時,所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書后均應(yīng)入組長期隨訪臨床研究。在設(shè)計長期隨訪臨床研究的方案時,應(yīng)考慮目標(biāo)受試者人群及特征、整體健康情況以及接受...
R-loop seq雖然不是一種真正意義上的脫靶位點檢測方法,但能為堿基編輯脫氨酶的脫靶提供一種度量方法,以便于之后的脫氨酶點突變優(yōu)化,來降低脫靶的發(fā)生幾率。2) Detect-seqCRISPR衍生技術(shù)由于其復(fù)雜性,檢測其脫靶位點的hexin思路是捕獲實驗過...
如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給xingfang式遞送,長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性?;蚪M整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測方法取得樣本,實施時還需...
CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補定位到靶位點,不論哪種CRISPR系統(tǒng),都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象,CRISPR定位到脫靶位點引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險。CRISPR技術(shù)誕生剛過10年,期間迅速取代TALEN和ZFN,...
gRNA的長度和錯配: 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下,18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細(xì)胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針:1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個錯配;2) 在PAM的1...