目標(biāo)區(qū)域甲基化重測(cè)序報(bào)告

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-24

DNA甲基化是表觀(guān)遺傳學(xué)的重要內(nèi)容。DNA甲基化是基因組DNA的一種主要表觀(guān)遺傳修飾形式。DNA甲基化修飾對(duì)于維持正常細(xì)胞功能、傳遞基因組遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類(lèi)tumour發(fā)生,起著至關(guān)重要的作用。甲基化研究成為表觀(guān)遺傳學(xué)的熱點(diǎn),相應(yīng)的技術(shù)也是層出不窮,根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡牟煌?,這些技術(shù)大體能夠分成兩類(lèi):全基因組甲基化檢測(cè)技術(shù)以及特異性位點(diǎn)甲基化檢測(cè)技術(shù)。翼和特色內(nèi)容目標(biāo)區(qū)域甲基化測(cè)序自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)超高重PCR為基礎(chǔ),目標(biāo)甲基化區(qū)段特異性捕獲,更具針對(duì)性,經(jīng)濟(jì)型基于二代測(cè)序,可以獲得目標(biāo)區(qū)域內(nèi)所有C的甲基化數(shù)據(jù)~500X的測(cè)序深度,精確計(jì)算每個(gè)位點(diǎn)C的甲基化程度通量高,可同時(shí)對(duì)成百上千個(gè)區(qū)域進(jìn)行甲基化程度分析適用于大樣本多區(qū)域的DNA甲基化水平檢測(cè)Q30>80%檢出率90%以上,90%以上測(cè)序片段測(cè)序深度>10X。DNA甲基化主要發(fā)生在啟動(dòng)子區(qū)CPG島,在調(diào)節(jié)基因表達(dá)和其他功能方面起著關(guān)鍵作用.目標(biāo)區(qū)域甲基化重測(cè)序報(bào)告

Hi-Methylseq結(jié)合了亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換、靶向擴(kuò)增子高通量測(cè)序技術(shù),可實(shí)現(xiàn)多區(qū)段、多位點(diǎn)的甲基化精確定量分析,適用于感興趣的目的片段的甲基化研究和在大樣本中進(jìn)一步確認(rèn)全基因組甲基化研究挑選的陽(yáng)性位點(diǎn)。采用翼和自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù),確保目的片段有效富集,經(jīng)亞硫酸氫鹽處理后,DNA序列復(fù)雜度嚴(yán)重降低,嚴(yán)格控制建庫(kù)PCR的循環(huán)數(shù),降低非特異性擴(kuò)增,通過(guò)將參考序列中的C堿基全部替換為T(mén)堿基,然后將測(cè)序reads比對(duì)到轉(zhuǎn)換后的參考序列上,針對(duì)每一個(gè)CpG位點(diǎn),統(tǒng)計(jì)C和T堿基的讀數(shù)(類(lèi)似于SNP calling),來(lái)判斷該位點(diǎn)的甲基化。北京目標(biāo)區(qū)間甲基化重測(cè)序怎么解決表觀(guān)遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實(shí)了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對(duì)于染色體構(gòu)象、基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制有著重要影響。

物種的DNA甲基化率通常與物種基因組大小成正比。從細(xì)菌的數(shù)千個(gè)基因進(jìn)化到高等動(dòng)物的數(shù)萬(wàn)個(gè)基因,基因數(shù)增長(zhǎng)的一個(gè)數(shù)量級(jí)。要管好這么多的基因,在漫長(zhǎng)的一生中有規(guī)律地關(guān)閉或打開(kāi)基因表達(dá),DNA甲基化這個(gè)開(kāi)關(guān)對(duì)高等動(dòng)植物必不可少。轉(zhuǎn)座子是一類(lèi)在基因組上可以自主復(fù)制(或剪切)和移動(dòng)的**功能元件。如果它們隨意移動(dòng),對(duì)基因組的穩(wěn)定性具有破壞作用。DNA甲基化對(duì)轉(zhuǎn)座子的移動(dòng)具有抑制作用。通常,物種的基因組越大,其基因組中轉(zhuǎn)座子的比例越高,那么限制轉(zhuǎn)座子移動(dòng)的門(mén)神——DNA甲基化的比例就越高。

亞硫酸氫鈉修飾后測(cè)序法是一種對(duì)DNA進(jìn)行亞硫酸氫鈉處理、聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增與DNA測(cè)序相結(jié)合的方法,能夠提供測(cè)定區(qū)域的序列信息,準(zhǔn)確定位甲基化胞嘧啶位點(diǎn);重亞硫酸鹽修飾后,甲基化胞嘧啶保持不變,但非甲基化胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏?,PCR擴(kuò)增后為胸腺嘧啶,其將甲基化狀態(tài)的差異轉(zhuǎn)化成堿基的差異,從而對(duì)胞嘧啶的甲基化狀態(tài)進(jìn)行分析;但在亞硫酸鈉處理的酸性環(huán)境下,單鏈特異性PCR模板穩(wěn)定性下降,容易降解;并且模板鏈CG二核苷酸水平高易形成復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu),常出現(xiàn)非特異性條帶,結(jié)合“巢式PCR法”能明顯提高擴(kuò)增的特異度。上海翼和生物通過(guò)亞硫酸氫鹽處理,用PCR擴(kuò)增目的片段,并結(jié)合二代測(cè)序平臺(tái)并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。

DNA甲基化屬于表觀(guān)遺傳的范疇。表觀(guān)遺傳屬于一種可以對(duì)環(huán)境產(chǎn)生應(yīng)答和改變的遺傳機(jī)制。機(jī)體細(xì)胞在經(jīng)歷脅迫、創(chuàng)傷等環(huán)境變化后,會(huì)產(chǎn)生特定的應(yīng)答,并往往會(huì)用DNA甲基化、組蛋白修飾等形式將應(yīng)激的模式記錄在DNA修飾中。這種脅迫記憶可以幫助細(xì)胞在面臨下一次應(yīng)激的時(shí)候快速適應(yīng)。同時(shí),這種表觀(guān)修飾可以通過(guò)遺傳的方式傳遞給下一代細(xì)胞。對(duì)于高等動(dòng)植物,通常壽命都比較漫長(zhǎng)。在漫長(zhǎng)的一生中,一方面機(jī)體會(huì)經(jīng)歷大量的環(huán)境應(yīng)答,另一方面細(xì)胞將會(huì)分裂多代。那么機(jī)體就更需要將應(yīng)答的信息,存儲(chǔ)在DNA甲基化中傳遞給后代的細(xì)胞,以提高這個(gè)物種的環(huán)境適應(yīng)能力。DNA甲基化幾乎只存在于CpG二核苷酸上,是一個(gè)關(guān)鍵的表觀(guān)遺傳標(biāo)記和基因表達(dá)調(diào)控因子。江蘇目標(biāo)區(qū)段甲基化重測(cè)序公司

DNA甲基化在DNA復(fù)制起始、錯(cuò)配修復(fù)以及轉(zhuǎn)座子的失活等過(guò)程中對(duì)維持遺傳信息的穩(wěn)定性發(fā)揮著重要的作用。目標(biāo)區(qū)域甲基化重測(cè)序報(bào)告

DNA(主要是CpG的)甲基化是其遺傳機(jī)制和表型效應(yīng)**為明確的表觀(guān)遺傳性機(jī)制。DNA甲基化譜式的變化不僅指導(dǎo)在正常發(fā)育過(guò)程中細(xì)胞譜系特化所依據(jù)的基因組轉(zhuǎn)錄譜式的改變,且在疾病發(fā)生和發(fā)展的基因表達(dá)異化中起著決定性的作用。為了高效準(zhǔn)確的分析基因組中所有的甲基化位點(diǎn),可采用全基因組甲基化(Whole Genome Bisulfite Sequence,WGBS)。亞硫酸氫鹽處理是一種分類(lèi)5-甲基胞嘧啶和非甲基化堿基的有效方法之一,包括基于序列、熔化溫度和交互的分析,WGBS是通過(guò)重亞硫酸氫鹽使DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)脫氨基轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ║),而甲基化的胞嘧啶保持不變,再經(jīng)PCR將U轉(zhuǎn)變?yōu)門(mén),結(jié)合NGS便可高效準(zhǔn)確地分析基因組中所有甲基化位點(diǎn)。目標(biāo)區(qū)域甲基化重測(cè)序報(bào)告

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型的公司。公司業(yè)務(wù)分為細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶(hù)提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司秉持誠(chéng)信為本的經(jīng)營(yíng)理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,以技術(shù)為先導(dǎo),以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),發(fā)揮人才優(yōu)勢(shì),打造醫(yī)藥健康良好品牌。翼和生物立足于全國(guó)市場(chǎng),依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力,融合前沿的技術(shù)理念,飛快響應(yīng)客戶(hù)的變化需求。