成都全基因組甲基化重測(cè)序機(jī)構(gòu)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-10

全基因組重亞硫酸鹽測(cè)序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)用于全基因組DNA甲基化檢測(cè):表觀遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實(shí)了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對(duì)于染色體構(gòu)象、基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制有著重要影響,而全基因組DNA甲基化研究是表觀基因組學(xué)關(guān)注的重要內(nèi)容。Bisulfite處理能夠?qū)⒒蚪M中未發(fā)生甲基化的C堿基轉(zhuǎn)換成U,進(jìn)行PCR擴(kuò)增后變成T,與原本具有甲基化修飾的C堿基區(qū)分開(kāi)來(lái),再結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù),可繪制單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。Hi-Methylseq方案一次測(cè)序反應(yīng)每個(gè)位點(diǎn)測(cè)序上百次節(jié)約時(shí)間、成本、定量準(zhǔn)確。成都全基因組甲基化重測(cè)序機(jī)構(gòu)

DNA甲基化可以抑制基因表達(dá)。其機(jī)制是當(dāng)DNA甲基化出現(xiàn)在啟動(dòng)子區(qū),其會(huì)強(qiáng)化啟動(dòng)子序列的異染色質(zhì)化(染色體擰巴在一起),而使轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物無(wú)法接近和結(jié)合,從而強(qiáng)化基因的轉(zhuǎn)錄抑制。只有保持開(kāi)放性常染色質(zhì)狀態(tài)的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),才能保證轉(zhuǎn)錄起始蛋白復(fù)合物可接近并結(jié)合這個(gè)區(qū)域,從而保證基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。當(dāng)DNA甲基化出現(xiàn)在編碼基因不同區(qū)域的時(shí)候(上游,基因區(qū)或下游),其對(duì)基因表達(dá)的影響也是不同的。同時(shí),DNA甲基化不僅只影響基因轉(zhuǎn)錄,實(shí)際上其與組蛋白修飾、DNA突變、小RNA表達(dá)等都有非常復(fù)雜的相互調(diào)控作用。廣州bisulfite甲基化重測(cè)序哪個(gè)公司做DNA甲基化是研究**為普遍的表觀遺傳修飾,它被認(rèn)為在許多生物學(xué)過(guò)程和疾病中有著重要的作用。

表觀遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實(shí)了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對(duì)于染色體構(gòu)象、基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制有著重要影響,而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學(xué)為關(guān)注的內(nèi)容之一。Bisulfite處理能夠?qū)⒒蚪M中未發(fā)生甲基化的C堿基轉(zhuǎn)換成U,進(jìn)行PCR擴(kuò)增后變成T,與原本具有甲基化修飾的C堿基區(qū)分開(kāi)來(lái),再結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù),可繪制單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。特定物種的高精確度甲基化修飾模式的分析,必將在表觀基因組學(xué)研究中具有里程碑式的意義,并且為細(xì)胞分化、組織發(fā)育等基礎(chǔ)機(jī)制研究,以及動(dòng)植物育種、人類(lèi)健康與疾病研究奠定基礎(chǔ)。

真核生物基因表達(dá)受多種機(jī)制、多層面的綜合調(diào)控?;虻腄NA序列不發(fā)生改變的情況下,基因的表達(dá)水平與功能發(fā)生改變,并可遺傳現(xiàn)象,稱(chēng)為表觀遺傳(epigenetic)現(xiàn)象。DNA甲基化是指在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,DNA的CG二核苷酸中的胞嘧啶被選擇性的添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,常見(jiàn)于基因的5′—CG—3′序列。DNA甲基化的位置主要集中在基因5′端的非編碼區(qū),DNA高度甲基化首先會(huì)影響DNA結(jié)構(gòu),進(jìn)而阻遏基因轉(zhuǎn)錄,引起基因沉默。人體內(nèi),DNA甲基轉(zhuǎn)移酶主要有四種:DNMT1、DNMT3A、DNMT3B和DNMT3L。在DNA復(fù)制完成后,DNMT1是催化甲基轉(zhuǎn)移至新合成的DNA鏈上,這一現(xiàn)象稱(chēng)為維持甲基化;DNMT3A和DNMT3B負(fù)責(zé)催化核酸鏈上新的甲基化位點(diǎn)發(fā)生反應(yīng),成為形成甲基化;DNMT3L不具有甲級(jí)轉(zhuǎn)移酶活性,其主要作用是調(diào)節(jié)其他甲基轉(zhuǎn)移酶的活性。真核細(xì)胞內(nèi)甲基化狀態(tài)有3種:持續(xù)的低甲基化狀態(tài)(如持家基因的甲基化)、誘導(dǎo)的去甲基化狀態(tài)(如一些發(fā)育階段特異性基因的修飾)和高度甲基化狀態(tài)(如人類(lèi)女性細(xì)胞內(nèi)縊縮-失活的X染色體的甲基化)。重亞硫酸鹽測(cè)序本質(zhì)上就是重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化與二代測(cè)序(NGS)的結(jié)合。

DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)和少量的N6-甲基嘌呤(N6-mA)及7-甲基鳥(niǎo)嘌呤(7-mG)。結(jié)構(gòu)基因含有很多CPG結(jié)構(gòu), 2CPG 和2GPC 中兩個(gè)胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化, 且兩個(gè)甲基集團(tuán)在DNA 雙鏈大溝中呈特定三維結(jié)構(gòu)?;蚪M中60%~ 90% 的CPG 都被甲基化, 未甲基化的CPG 成簇地組成CPG 島,位于結(jié)構(gòu)基因啟動(dòng)子的core序列和轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)。有實(shí)驗(yàn)證明超甲基化阻遏轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行。DNA 甲基化可引起基因組中相應(yīng)區(qū)域染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變化, 使DNA 失去核酶ö限制性?xún)?nèi)切酶的切割位點(diǎn), 以及DNA 酶的敏感位點(diǎn), 使染色質(zhì)高度螺旋化, 凝縮成團(tuán), 失去轉(zhuǎn)錄活性。5 位C 甲基化的胞嘧啶脫氨基生成胸腺嘧啶, 由此可能導(dǎo)致基因置換突變, 發(fā)生堿基錯(cuò)配: T2G, 如果在細(xì)胞分裂過(guò)程中不被糾正,就會(huì)誘發(fā)遺傳病或cancer, 而且, 生物體甲基化的方式是穩(wěn)定的, 可遺傳的。全基因組DNA甲基化測(cè)序是用 Bisulfite 處理DNA序列。杭州目標(biāo)區(qū)域甲基化重測(cè)序哪個(gè)公司做

上海翼和生物甲基化測(cè)序采用的是重亞硫酸鹽擴(kuò)增子測(cè)序法,重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化是研究DNA甲基化的金標(biāo)方法。成都全基因組甲基化重測(cè)序機(jī)構(gòu)

DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)的重要內(nèi)容。DNA甲基化是基因組DNA的一種主要表觀遺傳修飾形式。DNA甲基化修飾對(duì)于維持正常細(xì)胞功能、傳遞基因組遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類(lèi)tumour發(fā)生,起著至關(guān)重要的作用。甲基化研究成為表觀遺傳學(xué)的熱點(diǎn),相應(yīng)的技術(shù)也是層出不窮,根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡牟煌?,這些技術(shù)大體能夠分成兩類(lèi):全基因組甲基化檢測(cè)技術(shù)以及特異性位點(diǎn)甲基化檢測(cè)技術(shù)。翼和特色內(nèi)容目標(biāo)區(qū)域甲基化測(cè)序自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)超高重PCR為基礎(chǔ),目標(biāo)甲基化區(qū)段特異性捕獲,更具針對(duì)性,經(jīng)濟(jì)型基于二代測(cè)序,可以獲得目標(biāo)區(qū)域內(nèi)所有C的甲基化數(shù)據(jù)~500X的測(cè)序深度,精確計(jì)算每個(gè)位點(diǎn)C的甲基化程度通量高,可同時(shí)對(duì)成百上千個(gè)區(qū)域進(jìn)行甲基化程度分析適用于大樣本多區(qū)域的DNA甲基化水平檢測(cè)Q30>80%檢出率90%以上,90%以上測(cè)序片段測(cè)序深度>10X。成都全基因組甲基化重測(cè)序機(jī)構(gòu)

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型的公司。公司業(yè)務(wù)分為細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶(hù)提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識(shí),遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。在社會(huì)各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造***服務(wù)體驗(yàn),為客戶(hù)成功提供堅(jiān)實(shí)有力的支持。