蘇州STRSNP分型分析

來源: 發(fā)布時間:2021-12-06

隨著二代測序技術(shù)的普及,相比Sanger測序,以降低測序讀長的前提,極大增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進(jìn)行SNP分型,不僅測序讀長滿足分型需求,可以同時對數(shù)十?dāng)?shù)百個位點(diǎn),上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測序法,除了保留測序法的優(yōu)點(diǎn)外,彌補(bǔ)了其通量不足的限制,二代測序分型法也正在快速在領(lǐng)域內(nèi)推廣。無錫分公司(無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司)地址:無錫市濱湖區(qū)梅梁西路138號七號樓一樓。微信公眾號:上海翼和生物傳統(tǒng)的RFLP只能檢測到SNP的一部分,測序技術(shù)既費(fèi)時費(fèi)力。蘇州STRSNP分型分析

5.IlluminaBeadXpress法采用Illumina公司的BeadXpress系統(tǒng)進(jìn)行批量SNP位點(diǎn)檢測,可以同時檢測1-384個SNP位點(diǎn),往往用于基因組芯片結(jié)果確認(rèn),適合高通量檢測。微珠芯片具有高密度、高重復(fù)性、高靈敏度、低上樣量、定制靈活等特點(diǎn),極高的集成密度,從而獲得極高的檢測篩選速度,在高通量篩選時可比較明顯降低成本。時間飛行質(zhì)譜(MALDI-TOF)完成的SNP檢測準(zhǔn)確率可達(dá)99.9%,除了準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大、檢測周期短等優(yōu)勢外,,有吸引力的應(yīng)該還是它的性價比。飛行時間質(zhì)譜平臺(MALDI-TOF)是國際通用的基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)的研究平臺,該方法憑借其科學(xué)性和準(zhǔn)確性已經(jīng)成為該領(lǐng)域的新標(biāo)準(zhǔn)。河南SNP分型售后服務(wù)周到完成這些化學(xué)反應(yīng)所采用的模式,包括液相反應(yīng)、固相支持物上進(jìn)行的反應(yīng)以及二者皆有的反應(yīng)。

SNP挑選:(1)SNP位于非編碼區(qū);(2)SNP平均分布在29條常染色體上;(3),小等位基因頻度(MAF)需大于30%,保證位點(diǎn)有足夠多態(tài)性;SNP鑒定方法~翼和Hi-SNP:59個SNP采用上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司的Hi-SNP技術(shù),由本公司實(shí)施多重PCR建庫與illuminaX-10測序。上海翼和應(yīng)用生物**團(tuán)隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。

查詢進(jìn)入如下界面后,再點(diǎn)擊左側(cè)欄的“Exportdata”。進(jìn)入如下界面后,選擇output格式,這里選擇“BEDFormat”,繼續(xù)點(diǎn)擊“Next”。選擇輸出格式,根據(jù)自己需求選擇。選擇輸出格式,如“HTML”,結(jié)果呈現(xiàn)如下圖所示。通過上面的幾個步驟,就完成了特定區(qū)段內(nèi)所有SNP位點(diǎn)的查詢,是不是也很方便,大家趕快去實(shí)際操作試試吧~上海翼和生物技術(shù)PCR-LDR分型方法,擁有十二年分型經(jīng)驗(yàn),每年協(xié)助客戶發(fā)表研究論文,包括“NatureGenetics”等期刊,在客戶中形成良好口碑。目前在nature genetics和cell這樣的雜志,也不乏SNP的文章。

上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測反應(yīng))想結(jié)合的檢測技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?;旌蠘颖竞?,在illumina等主流測序平臺上,對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)??梢愿鶕?jù)以往文獻(xiàn),在所研究疾病的多個候選基因上面選擇多個SNP,比如選擇DNA修復(fù)通路中幾個基因的重要SNP.基因SNP分型周期

對于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應(yīng)體系來獲得。蘇州STRSNP分型分析

4.MassArray法MassARRAY分子量陣列技術(shù)是Sequenom公司推出的世界上靠前的基因分析工具,通過引物延伸或切割反應(yīng)與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術(shù)相結(jié)合,實(shí)現(xiàn)基因分型檢測?;贛assARRAY平臺的iPLEXGOLD技術(shù)可以設(shè)計,高達(dá)40重的PCR反應(yīng)和基因型檢測,實(shí)驗(yàn)設(shè)計靈活,分型結(jié)果準(zhǔn)確性高。根據(jù)應(yīng)用需要,對數(shù)十到數(shù)百個SNP位點(diǎn)進(jìn)行數(shù)百至數(shù)千份樣本檢測時,MassARRAY具有,佳的性價比,特別適合于對全基因組研究發(fā)現(xiàn)的結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,或者是有限數(shù)量的研究位點(diǎn)已經(jīng)確定的情況。蘇州STRSNP分型分析

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502,是一家第三方檢測服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測;細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司。公司自創(chuàng)立以來,投身于細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù),是醫(yī)藥健康的主力軍。翼和生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗(yàn)。翼和生物創(chuàng)始人陳燁,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。