1.TaqMan探針?lè)ㄡ槍?duì)染色體上的不同SNP位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)PCR引物和TaqMan探針,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增。探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。當(dāng)溶液中存在PCR產(chǎn)物時(shí),該探針與模板退火,即產(chǎn)生了適合于核酸外切酶活性的底物,從而將探針5’-端連接的熒光分子從探針上切割下來(lái),破壞兩熒光分子間的PRET,發(fā)出熒光。通常用于少量SNP位點(diǎn)分析。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司按公司利用的就是此方案。公司公眾號(hào):上海翼和生物SNP這個(gè)概念被提出時(shí),是為了描述一個(gè)群體內(nèi)不那么罕見(jiàn)的堿基突變。江蘇STR/SSRSNP分型機(jī)構(gòu)
將待檢測(cè)片段(包含待測(cè)SNP位點(diǎn))進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中,準(zhǔn)確的一種,堪稱(chēng)SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖,純和位點(diǎn)為單峰,而雜合位點(diǎn)則為套峰,因此通過(guò)查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開(kāi)來(lái)。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè),還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點(diǎn)。直接測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)是結(jié)果準(zhǔn)確,能發(fā)現(xiàn)未知位點(diǎn),但是其缺點(diǎn)是通量低,成本高。因此直接測(cè)序法適用于少位點(diǎn),少樣本的分型規(guī)模,當(dāng)然土豪實(shí)驗(yàn)室除外!所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實(shí)驗(yàn)中得到推廣。北京微衛(wèi)星標(biāo)記strSNP分型SNP(單核苷酸多態(tài)性)易于基因分型。
SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,主要特點(diǎn)是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大,主要方法是TaqMan探針?lè)?。首先通過(guò)PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,然后通過(guò)序列特異性引物實(shí)現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時(shí)納秒(10-9s)強(qiáng)激光激發(fā)。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子,由于電場(chǎng)中離子飛行時(shí)間與離子質(zhì)量成反比,通過(guò)檢測(cè)核酸分子在真空管中的飛行時(shí)間而獲得樣品分析物的精確分子量,從而檢測(cè)出SNP位點(diǎn)信息。
3.HRM法高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具,它通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)升溫過(guò)程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的結(jié)合情況,來(lái)判斷是否存在SNP,而且不同SNP位點(diǎn)、是否是雜合子等都會(huì)影響熔解曲線的峰形,因此HRM分析能夠有效區(qū)分不同SNP位點(diǎn)與不同基因型。這種檢測(cè)方法不受突變堿基位點(diǎn)與類(lèi)型的局限,無(wú)需序列特異性探針,在PCR結(jié)束后直接運(yùn)行高分辨率熔解,即可完成對(duì)樣品基因型的分析。該方法無(wú)需設(shè)計(jì)探針,操作簡(jiǎn)便、快速,成本低,結(jié)果準(zhǔn)確,并且實(shí)現(xiàn)了真正的閉管操作。完成這些化學(xué)反應(yīng)所采用的模式,包括液相反應(yīng)、固相支持物上進(jìn)行的反應(yīng)以及二者皆有的反應(yīng)。
通過(guò)風(fēng)險(xiǎn)值估計(jì)、置信區(qū)間和哈溫檢測(cè),作者發(fā)現(xiàn)pre-miR-27a的rs895819位點(diǎn),AG雜合子或者AA純合子相比GG純合子患MI的風(fēng)險(xiǎn)更低。并且將該位點(diǎn)的AG和AA基因型混合后相對(duì)于GG類(lèi)型,混合后的樣本分組仍然患MI的風(fēng)險(xiǎn)更低。然而在其他4個(gè)前體miRNA的SNP在等位基因和建立的遺傳模型中并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)與MI的比較明顯關(guān)聯(lián)。上海翼和專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性?xún)r(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。SNP應(yīng)該在群體中占一定的比例,比如至少是1%。北京SSRSNP分型機(jī)構(gòu)
探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。江蘇STR/SSRSNP分型機(jī)構(gòu)
相比Taqman熒光探針?lè)?,KASP技術(shù)只要合成兩個(gè)通用熒光探針,兩個(gè)通用淬滅探針,通用熒光探針來(lái)代替針對(duì)位點(diǎn)的熒光探針,極大節(jié)約成本。同時(shí)配套SNPline基因分型儀器平臺(tái),可以進(jìn)行高通量的SNP分型規(guī)模。該方法利用多重PCR技術(shù),同時(shí)捕獲數(shù)十上百個(gè)SNP位點(diǎn),Barcode引物區(qū)分不同樣本,實(shí)現(xiàn)一次上機(jī)測(cè)序,完成多位點(diǎn),大樣本的高通量分型實(shí)驗(yàn)?zāi)康?。多重PCR特性,也極大降低了對(duì)樣本量的需求。上海翼和專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性?xún)r(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。江蘇STR/SSRSNP分型機(jī)構(gòu)
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502,是一家專(zhuān)業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù);生物專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù);健康衰老評(píng)估;大健康檢測(cè);遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測(cè);細(xì)胞端粒長(zhǎng)度和端粒酶活性檢測(cè)。公司。Biowing是上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司的主營(yíng)品牌,是專(zhuān)業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù);生物專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù);健康衰老評(píng)估;大健康檢測(cè);遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測(cè);細(xì)胞端粒長(zhǎng)度和端粒酶活性檢測(cè)。公司,擁有自己獨(dú)立的技術(shù)體系。公司堅(jiān)持以客戶為中心、第三方檢測(cè)服務(wù);生物專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù);健康衰老評(píng)估;大健康檢測(cè);遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測(cè);細(xì)胞端粒長(zhǎng)度和端粒酶活性檢測(cè)。市場(chǎng)為導(dǎo)向,重信譽(yù),保質(zhì)量,想客戶之所想,急用戶之所急,全力以赴滿足客戶的一切需要。自公司成立以來(lái),一直秉承“以質(zhì)量求生存,以信譽(yù)求發(fā)展”的經(jīng)營(yíng)理念,始終堅(jiān)持以客戶的需求和滿意為重點(diǎn),為客戶提供良好的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù),從而使公司不斷發(fā)展壯大。