高同源SNP分型技術(shù)服務(wù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-11

上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測(cè)平臺(tái),分別為:適合中低通量檢測(cè)的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDR SNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(Ligase Detection Reaction,連接酶檢測(cè)反應(yīng))想結(jié)合的檢測(cè)技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別。高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后,在illumina 等主流測(cè)序平臺(tái)上,對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測(cè)序能一次對(duì)幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,相比其他的SNP檢測(cè)技術(shù),基于高通量測(cè)序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。高同源序列帶來的直接挑戰(zhàn):同源序列的干擾,無法利用簡(jiǎn)單PCR技術(shù)或者探針雜交捕獲技術(shù),將目標(biāo)區(qū)段富集。高同源SNP分型技術(shù)服務(wù)

LDR連接酶檢測(cè)法優(yōu)點(diǎn)是適用于任何多態(tài)性位點(diǎn),基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng),分型結(jié)果準(zhǔn)確,可進(jìn)行多重反應(yīng),性價(jià)比較高,且實(shí)驗(yàn)靈活。但是相比TaqMan和直接測(cè)序法的單一位點(diǎn)檢測(cè)而言,LDR法可以實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)的同時(shí)檢測(cè),提高檢測(cè)通量,因此前期需要一定時(shí)間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續(xù)樣本的分型需求,提高實(shí)驗(yàn)通量的同時(shí)降低分型單價(jià)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部在上海,2011年無錫成立分公司無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司SNP分型機(jī)構(gòu)高同源區(qū)段是二倍體和多倍體都存在的,由于多倍體染色體加倍,所以高同源區(qū)段在多倍體中更是普遍現(xiàn)象。

二代測(cè)序法主要通過PCR的方法,對(duì)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行特異性捕獲。為了提**型的通量,目前多采用多重PCR的方法同時(shí)對(duì)多個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行捕獲(可同時(shí)對(duì)1-100位點(diǎn)進(jìn)行分型)。由于二代測(cè)序通量是足夠滿足數(shù)百數(shù)千樣本的同時(shí)測(cè)序,因此需要對(duì)不同的樣本添加***的樣本標(biāo)簽(Barcode),從而在后續(xù)數(shù)據(jù)分析過程中,能夠進(jìn)行樣本拆分。因此在多重PCR完成***輪多SNP位點(diǎn)捕獲后,需要進(jìn)行第二輪PCR,在***輪PCR產(chǎn)物的基礎(chǔ)上,添加樣本樣本標(biāo)簽及測(cè)序接頭等序列。通過PCR條件優(yōu)化,目前亦可實(shí)現(xiàn)一次反應(yīng),兩輪PCR接力完成的效果。

SNP全稱Single Nucleotide Polymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組DNA序列中由于單個(gè)核苷酸(A,T,C和G)的突變引起的多態(tài)性。一個(gè)SNP表示基因組某個(gè)位點(diǎn)有一個(gè)核苷酸的變化,源于單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。目前已有多種方法可用于SNP檢測(cè),如根據(jù)動(dòng)態(tài)等位基因特異的雜交、DNA芯片以及TaqMan系統(tǒng)等。

SNP指的是DNA序列上發(fā)生的單個(gè)核苷酸堿基之間的變異。SNP根據(jù)所處核酸位置不同,其預(yù)測(cè)的生物學(xué)功能不同,可以分為有***生物學(xué)意義和無***生物學(xué)意義的SNP。有生物學(xué)意義的SNP往往影響蛋白結(jié)構(gòu),表達(dá),剪切等。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒?;谧灾髦R(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù),翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測(cè)序和二代高通量測(cè)序平臺(tái)的多種檢測(cè)技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測(cè)和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段。天津SNP基因分型技術(shù)服務(wù)

多重PCR是降低長(zhǎng)片段PCR擴(kuò)增成本的有效方式。高同源SNP分型技術(shù)服務(wù)

多倍體物種SNP分型的常用技術(shù)包括Sanger測(cè)序、SNP芯片、KASP等3種,這3種技術(shù)依賴于特異性的擴(kuò)增或特異性的雜交,而多倍體物種亞基因組間高度同源,使得特異性擴(kuò)增/雜交的難度**增加,這3種常用技術(shù)在無法保證特異性的前提下,得到的是混合結(jié)果,且無法對(duì)混合結(jié)果進(jìn)行有效的拆分。這就導(dǎo)致多倍體物種SNP分型結(jié)果準(zhǔn)確率不高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)(高同源區(qū)段SNP分型)和質(zhì)控試劑盒。高同源SNP分型技術(shù)服務(wù)

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主,是一個(gè)有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊(duì)。誠(chéng)實(shí)、守信是對(duì)企業(yè)的經(jīng)營(yíng)要求,也是我們做人的基本準(zhǔn)則。公司致力于打造***的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務(wù),我們相信誠(chéng)實(shí)正直、開拓進(jìn)取地為公司發(fā)展做正確的事情,將為公司和個(gè)人帶來共同的利益和進(jìn)步。經(jīng)過幾年的發(fā)展,已成為細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)行業(yè)出名企業(yè)。