上海SSRSNP分型外包服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2021-11-08

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為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點,作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個基因,64個個體(32個高糖原個體和32個低糖原個體)進行重測序,,后得到732個高質(zhì)量SNP。其中32個位于Cg_GD2基因,256個位于Cg_GS基因,用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩個SNP與糖原含量有關(guān)。分別是位于Cg_GD1基因第15個內(nèi)含子的SNP(Cg_SNP_3021(R(A/G))),和位于Cg_GD1基因的SNP(Cg_SNP_3021)。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。南京微衛(wèi)星SSRSNP分型外包服務(wù)高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具。

SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴增含有SNP的基因組片段,主要特點是準確性高、靈活性強、通量大,主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴增含有SNP的基因組片段,然后通過序列特異性引物實現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時納秒(10-9s)強激光激發(fā)。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子,由于電場中離子飛行時間與離子質(zhì)量成反比,通過檢測核酸分子在真空管中的飛行時間而獲得樣品分析物的精確分子量,從而檢測出SNP位點信息。

TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團連接在探針的5’末端,而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應(yīng)體系中加入2種不同熒光標記的探針,它們可以分別與2個等位基因完全配對。正常情況下,由于探針5’端熒光基團和3’端淬滅基團緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR有效的進行,與模板完全配對的探針逐步被TaqDNA聚合酶5’——3’外切酶活性切割,致使探針5’端熒光基團和3’端淬滅基團分離,淬滅效應(yīng)解除,報告熒光基團被,檢測到熒光信號,相反,如果模板不能完全配對的探針(另一種等位基因)不能被有效切割,因此檢測不到熒光信號,從而實現(xiàn)SNP位點的分型檢測。傳統(tǒng)的RFLP只能檢測到SNP的一部分,測序技術(shù)既費時費力。

相比Taqman熒光探針法,KASP技術(shù)只要合成兩個通用熒光探針,兩個通用淬滅探針,通用熒光探針來代替針對位點的熒光探針,極大節(jié)約成本。同時配套SNPline基因分型儀器平臺,可以進行高通量的SNP分型規(guī)模。該方法利用多重PCR技術(shù),同時捕獲數(shù)十上百個SNP位點,Barcode引物區(qū)分不同樣本,實現(xiàn)一次上機測序,完成多位點,大樣本的高通量分型實驗?zāi)康摹6嘀豍CR特性,也極大降低了對樣本量的需求。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。單核苷酸多態(tài)性(SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)。微衛(wèi)星SSRSNP分型機構(gòu)

美國學者Eric S. Lander于1996年正式提出單核苷酸多態(tài)性(SNP)為第三代分子標記.上海SSRSNP分型外包服務(wù)

從對生物的遺傳性狀的影響上來看,cSNP又可分為2種:一種是同義cSNP(synonymouscSNP),即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質(zhì)的氨基酸序列,突變堿基與未突變堿基的含義相同;另一種是非同義cSNP(non-synonymouscSNP),指堿基序列的改變可使以其為藍本翻譯的蛋白質(zhì)序列發(fā)生改變,從而影響了蛋白質(zhì)的功能。這種改變常是導(dǎo)致生物性狀改變的直接原因。cSNP中約有一半為非同義cSNP。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。上海SSRSNP分型外包服務(wù)

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