SNP(單核苷酸多態(tài)性)是，新發(fā)展起來的第三代分子標記技術,具有分布廣,多態(tài)信息量大,易于檢測和統(tǒng)計分析等特點.目前,SNP技術在水稻,玉米,大豆等作物研究中應用較多.本文綜述該技術在這些作物的遺傳標記,分子標記輔助選擇,構建高密度遺傳連鎖圖譜,繪制EST圖譜等方面的研究進展.上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術服務和產品。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成。安徽STR/SSRSNP分型周期
二代測序法主要通過PCR的方法，對目標SNP位點進行特異性捕獲。為了提型的通量，目前多采用多重PCR的方法同時對多個位點進行捕獲（可同時對1-100位點進行分型）。由于二代測序通量是足夠滿足數(shù)百數(shù)千樣本的同時測序，因此需要對不同的樣本添加的樣本標簽（Barcode），從而在后續(xù)數(shù)據(jù)分析過程中，能夠進行樣本拆分。因此在多重PCR完成輪多SNP位點捕獲后，需要進行第二輪PCR，在輪PCR產物的基礎上，添加樣本樣本標簽及測序接頭等序列。通過PCR條件優(yōu)化，目前亦可實現(xiàn)一次反應，兩輪PCR接力完成的效果。山東SSR基因SNP分型技術服務SNP是多態(tài)性中的一種，只是進一步限定了差異只是單堿基。
相信大家都聽過或已經接觸過一些常用的分型方法，如片段長度多態(tài)性（限制性內切酶）法，直接測序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測反應法，競爭性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測序法等，小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個介紹和總結。上海翼和應用生物技術有限上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價比高、高質量可靠的遺傳學技術服務和產品。
目前市場上有多個廠家提供HRM分析的儀器，包括IdahoTechnology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是HRM的儀器，有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發(fā)明者—美國猶他大學醫(yī)學院的Wittwer實驗室曾評估了市場上多臺儀器在基因分型和突變掃描上的性能1。他們發(fā)現(xiàn)，對于大部分儀器的準確基因分型來說，主要限制在于平板上的空間溫度差異（Tm的標準偏差為0.020-0.264°C）。其它差異如數(shù)據(jù)密度、信噪比和熔解速率，也會影響雜合體的掃描。經過比較發(fā)現(xiàn)，空氣加熱型儀器以及樣品溫度單獨控制的儀器有著更低的Tm標準偏差（0.018-0.065），而加熱塊型儀器則在0.092-0.274。理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個或4個等位多態(tài)性。
1、SNP數(shù)量多，分布比較常見。據(jù)估計，人類基因組中每1000個核苷酸就有一個SNP，人類30億堿基。。有300萬以上的SNPs.SNP遍布于整個人類基因組中，根據(jù)SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區(qū)SNPs（Coding-regionSNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（PerigenicSNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（IntergenicSNPs，iSNPs）等三類。2、SNP適于快速、規(guī)?；Y查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態(tài)的標記，即二等位基因（biallelic）。由于SNP的二態(tài)性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長度，這就利于發(fā)展自動化技術篩選或檢測SNPs.高分辨率熔解曲線分析（HRM）是近幾年興起的SNP研究工具。浙江微衛(wèi)星STRSNP分型技術服務
SNP在人類基因組中普遍存在，平均每500～1000個堿基對中就有1個，估計其總數(shù)可達300萬個甚至更多。安徽STR/SSRSNP分型周期
單核苷酸多態(tài)性（singlenucleotidepolymorphism，SNP），主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中，常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在，平均每500～1000個堿基對中就有1個，估計其總數(shù)可達300萬個甚至更多。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個堿基的變異，這種變異可由單個堿基的轉換（transition）或顛換（transversion）所引起，也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。安徽STR/SSRSNP分型周期
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