以上就是小E對幾種SNP分型技術的簡單介紹，大家可以看出分型技術多種多樣，各有各的優(yōu)點和限制。大家需要綜合考慮實驗的各方面情況，如實驗規(guī)模（多少位點，多少樣本），實驗周期，實驗預算等，然后選擇一個適合自己實驗的分型技術。上海翼和**團隊富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術服務和產(chǎn)品。上海翼和**團隊富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術服務和產(chǎn)品。這種選擇具有準確性高的特點，能夠有效避免形態(tài)學和環(huán)境因素的干擾，從而極大的縮短育種進程。山東STR/SSR基因SNP分型機構
理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個或4個等位多態(tài)性，但實際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。因此，通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（CT，在其互補鏈上則為GA），也可能是顛換（CA，GT，CG，AT）。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異，具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3，其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高，可能是因為CpG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中，易發(fā)生突變的位點，其中大多數(shù)是甲基化的，可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中，任何堿基均有可能發(fā)生變異，因此SNP既有可能在基因序列內(nèi)，也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來說，位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP（codingSNP,cSNP）比較少，因為在外顯子內(nèi)，其變異率及周圍序列的1/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義，因此cSNP的研究更受關注。蘇州SSR基因SNP分型機構理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個或4個等位多態(tài)性。
將待檢測片段（包含待測SNP位點）進行PCR擴增并直接進行測序是SNP檢測方法中，準確的一種，堪稱SNP分型的“金標準”。獲得測序峰圖，純和位點為單峰，而雜合位點則為套峰，因此通過查看測序峰圖很容易將基因型區(qū)分開來。直接測序法不僅可用于對已知位點的檢測，還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點。直接測序法的優(yōu)點是結果準確，能發(fā)現(xiàn)未知位點，但是其缺點是通量低，成本高。因此直接測序法適用于少位點，少樣本的分型規(guī)模，當然土豪實驗室除外！所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實驗中得到推廣。
《CandidateGenePolymorphismsandtheirAssociationwithGlycogenContentinthePacificOysterCrassostreagigas》本文作者在野生群體中進行了候選基因關聯(lián)分析，選擇90個候選基因以及295個SNP位點，并且結合目標基因捕獲測序分型732個SNP位點。發(fā)現(xiàn)Cg_GD1基因(glycogendebranchingenzyme)中的兩個SNP位點(Cg_SNP_TY202andCg_SNP_3021)inCg_GD1(glycogendebranchingenzyme)和Cg_GP1基因(glycogenphosphorylase)中的一個SNP位點(Cg_SNP_4)與糖原含量相關，基因表達量分析顯示這兩個基因在高糖原與低糖原中的表達量也有比較明顯差異。DNA芯片技術是近年來新開發(fā)的一種DNA序列變異檢測工具。
RFLP法的優(yōu)點是分型技術簡單，結果判斷容易，不需要昂貴的設備，成本低，并且實驗人員培訓簡單。但是通過SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低，很多SNP位點不能采用這種方法進行檢測，而且有的限制性酶價格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高，容易出現(xiàn)假陽性結果，且工作量大，耗時長，通量低。這是早期的一種SNP分型技術，在通量和效率上難以滿足批量分型需求，因此這種技術目前只在個別實驗室中還在使用中。上海翼和應用生物技術有限公司對于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應體系來獲得。北京STR基因SNP分型售后服務周到
SNP本身是針對“群體”而言的（within a population）。山東STR/SSR基因SNP分型機構
相信大家都聽過或已經(jīng)接觸過一些常用的分型方法，如片段長度多態(tài)性（限制性內(nèi)切酶）法，直接測序法，Taqman熒光探針法，LDR連接酶檢測反應法，競爭性等位基因特異性PCR法（KASP），二代測序法等，小E就針對以上幾種常用分型方法為大家做一個介紹和總結。上海翼和應用生物技術有限上海翼和**團隊富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學技術服務和產(chǎn)品。山東STR/SSR基因SNP分型機構
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