DNA甲基化是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的作用下，使胞嘧啶的5位碳原子發(fā)生甲基化的生物化學(xué)過程。DNA胞嘧啶甲基化是一種穩(wěn)定的表觀遺傳學(xué)標記，在調(diào)控特定基因表達、轉(zhuǎn)座子沉默、基因印記、X染色體失活以及基因組穩(wěn)定性等多種生物學(xué)過程中發(fā)揮著重要作用。在動物中，DNA甲基化主要發(fā)生在CpG二核苷酸的背景下，約為70-80%的DNA甲基化。然而，剩余未發(fā)生甲基化的CpG位點則主要密集分布于基因的啟動子區(qū)域和the first exon region，被稱為CpG島(CpG island)，在基因表達的調(diào)控和基因突變上都可能發(fā)揮著重要作用。表觀遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對于染色體構(gòu)象、基因表達調(diào)控機制有著重要影響。安徽全基因組甲基化重測序機構(gòu)
DNA甲基化可以抑制基因表達。其機制是當DNA甲基化出現(xiàn)在啟動子區(qū)，其會強化啟動子序列的異染色質(zhì)化（染色體擰巴在一起），而使轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物無法接近和結(jié)合，從而強化基因的轉(zhuǎn)錄抑制。只有保持開放性常染色質(zhì)狀態(tài)的轉(zhuǎn)錄起始位點，才能保證轉(zhuǎn)錄起始蛋白復(fù)合物可接近并結(jié)合這個區(qū)域，從而保證基因的轉(zhuǎn)錄表達。當DNA甲基化出現(xiàn)在編碼基因不同區(qū)域的時候（上游，基因區(qū)或下游），其對基因表達的影響也是不同的。同時，DNA甲基化不僅只影響基因轉(zhuǎn)錄，實際上其與組蛋白修飾、DNA突變、小RNA表達等都有非常復(fù)雜的相互調(diào)控作用。江蘇目標區(qū)間甲基化重測序哪個公司做DNA甲基化是DNA化學(xué)修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現(xiàn)。
DNA甲基化即在DNA上增加甲基基團，是使基因的轉(zhuǎn)錄抑制或沉默的主要方式。該修飾特異性地發(fā)生在CpG位點，胞嘧啶通過磷酸鹽與鳥苷酸連接(圖1)。甲基基團的插入改變了DNA的表觀和結(jié)構(gòu)，可能會直接阻礙DNA的識別及與轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合，或者吸引其他因子優(yōu)先與DNA結(jié)合，干擾轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合。目前已鑒定了三個與甲基化DNA結(jié)合的蛋白家族，包括MBD蛋白、Kaiso和Kaiso樣蛋白、以及SRA蛋白。通過招募這些蛋白，DNA甲基化可促進某些組蛋白狀態(tài)的維持，如去乙酰作用，從而保持轉(zhuǎn)錄后的組蛋白修飾。例如，MBD家族的甲基CpG結(jié)合蛋白2(MeCP2)與甲基CpG結(jié)合，招募HDACs，可促使染色體濃縮和轉(zhuǎn)錄抑制。
DNA甲基化作為重要的表觀遺傳學(xué)調(diào)控機制在許多關(guān)鍵的生物學(xué)過程如發(fā)育及疾病的進展中扮演著重要的作用，相對于基于PCR、芯片等傳統(tǒng)檢測手段，全基因組亞硫酸氫鹽測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) 技術(shù)可通過將高效的亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化與高通量測序文庫構(gòu)建方法相結(jié)合 (Post-BS WGBS)，可在單堿基的分辨率下對來自更多樣本基因組中的甲基化位點進行準確的分析，既可以覆蓋所有甲基化位點，還能夠配合靶向技術(shù)檢測低頻甲基化信號，已成為目前在業(yè)界受到普遍關(guān)注的一種主流方法。DNA甲基化在DNA復(fù)制起始、錯配修復(fù)以及轉(zhuǎn)座子的失活等過程中對維持遺傳信息的穩(wěn)定性發(fā)揮著重要的作用。
亞硫酸氫鈉修飾后測序法是一種對DNA進行亞硫酸氫鈉處理、聚合酶鏈反應(yīng)擴增與DNA測序相結(jié)合的方法，能夠提供測定區(qū)域的序列信息，準確定位甲基化胞嘧啶位點；重亞硫酸鹽修飾后，甲基化胞嘧啶保持不變，但非甲基化胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ琍CR擴增后為胸腺嘧啶，其將甲基化狀態(tài)的差異轉(zhuǎn)化成堿基的差異，從而對胞嘧啶的甲基化狀態(tài)進行分析；但在亞硫酸鈉處理的酸性環(huán)境下，單鏈特異性PCR模板穩(wěn)定性下降，容易降解；并且模板鏈CG二核苷酸水平高易形成復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu)，常出現(xiàn)非特異性條帶，結(jié)合“巢式PCR法”能明顯提高擴增的特異度。亞硫酸氫鹽處理能夠?qū)⒒蚪M中未發(fā)生甲基化的C堿基轉(zhuǎn)換成U，進行PCR擴增后變成T。成都多重PCR技術(shù)甲基化重測序機構(gòu)
WGBS（Whole Genome Bisulfite Sequence）全基因組甲基化測序.安徽全基因組甲基化重測序機構(gòu)
DNA甲基化是在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(Dnmt)的作用下將甲基選擇性地添加到胞嘧啶上形成5-胞嘧啶的過程，剛被發(fā)現(xiàn)時被定義為第五種堿基，實際上它是一種重要的表觀遺傳學(xué)標記，在調(diào)控基因表達、維持染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、基因印記、X染色體失活以及胚胎發(fā)育等生物學(xué)過程中發(fā)揮著重大的作用，獲得全基因組范圍內(nèi)所有C位點的甲基化水平數(shù)據(jù)，對表觀遺傳學(xué)的時空特異性研究具有重要意義，Bisulfite甲基化測序是以新一代高通量測序平臺為基礎(chǔ)，結(jié)合全基因組Bisulfite處理和生物信息數(shù)據(jù)分析技術(shù)，進行低成本、高效率、高準確度的全基因組DNA甲基化水平圖譜繪制。安徽全基因組甲基化重測序機構(gòu)
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