隨著二代測序技術(shù)的普及,相比Sanger測序,以降低測序讀長的前提,極大增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進行SNP分型,不僅測序讀長滿足分型需求,可以同時對數(shù)十數(shù)百個位點,上千樣本進行分型。該方法相比直接測序法,除了保留測序法的優(yōu)點外,彌補了其通量不足的限制,二代測序分型法也正在快速在領(lǐng)域內(nèi)推廣。無錫分公司(無錫翼和應用生物技術(shù)有限公司)地址:無錫市濱湖區(qū)梅梁西路138號七號樓一樓。微信公眾號:上海翼和生物傳統(tǒng)的RFLP只能檢測到SNP的一部分,測序技術(shù)既費時費力。微衛(wèi)星STRSNP分型周期
Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點設計特異性引物,在單管內(nèi)進行多重PCR擴增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后,在IonProton/IonTorrent平臺上,對擴增子進行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準確、更靈敏的特點。上海翼和生物提供snp分型服務。上海STRSNP分型SNP(單核苷酸多態(tài)性)易于基因分型。
2.SNaPshot法該技術(shù)由美國應用生物公司(ABI)開發(fā),是基于熒光標記單堿基延伸原理的分型技術(shù),也稱小測序,主要針對中等通量的SNP分型項目。在一個含有測序酶、四種熒光標記ddNTP、緊臨多態(tài)位點5’-端的不同長度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應體系中,引物延伸一個堿基即終止,經(jīng)ABI測序儀檢測后,根據(jù)峰的移動位置確定該延伸產(chǎn)物對應的SNP位點,根據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型。對于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應體系來獲得。通常用于10-30個SNP位點分析。
從對生物的遺傳性狀的影響上來看,cSNP又可分為2種:一種是同義cSNP(synonymouscSNP),即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質(zhì)的氨基酸序列,突變堿基與未突變堿基的含義相同;另一種是非同義cSNP(non-synonymouscSNP),指堿基序列的改變可使以其為藍本翻譯的蛋白質(zhì)序列發(fā)生改變,從而影響了蛋白質(zhì)的功能。這種改變常是導致生物性狀改變的直接原因。cSNP中約有一半為非同義cSNP。上海翼和專家團隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術(shù)服務和產(chǎn)品。目前已有多種方法可用于SNP檢測,如根據(jù)DNA列陣的微測序法、DNA芯片以及TaqMan系統(tǒng)等。
上海翼和應用生物技術(shù)有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗的專業(yè)遺傳學服務供應商。公司的首席科學家為肖君華教授(東華大學生物科學與技術(shù)研究所教授;中國遺傳學會理事;上海市遺傳學會常務理事)。公司擁有兩大專業(yè)平臺:基于一代測序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺;基于多重PCR捕獲建庫技術(shù)的二代測序平臺。為順應市場需求,公司在2019年開拓了個人基因檢測業(yè)務。目前已開展心血管個體化用藥相關(guān)基因的檢測,孕婦葉酸及鈣代謝兩項基因檢測業(yè)務。兩項基因檢測均基于翼和一代測序平臺的PCR-LDRSNP基因分型方法。多態(tài)性是一個群體概念,多態(tài)性指這個差異占群體的1%以上。否則就叫突變(小于1%)。江蘇SSRSNP分型機構(gòu)
突變一般不是一個個體全部細胞的變化。微衛(wèi)星STRSNP分型周期
4.MassArray法MassARRAY分子量陣列技術(shù)是Sequenom公司推出的世界上靠前的基因分析工具,通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術(shù)相結(jié)合,實現(xiàn)基因分型檢測?;贛assARRAY平臺的iPLEXGOLD技術(shù)可以設計,高達40重的PCR反應和基因型檢測,實驗設計靈活,分型結(jié)果準確性高。根據(jù)應用需要,對數(shù)十到數(shù)百個SNP位點進行數(shù)百至數(shù)千份樣本檢測時,MassARRAY具有,佳的性價比,特別適合于對全基因組研究發(fā)現(xiàn)的結(jié)果進行驗證,或者是有限數(shù)量的研究位點已經(jīng)確定的情況。微衛(wèi)星STRSNP分型周期
上海翼和應用生物技術(shù)有限公司位于龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務型企業(yè)。是一家私營有限責任公司企業(yè),隨著市場的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,與多家企業(yè)合作研究,在原有產(chǎn)品的基礎上經(jīng)過不斷改進,追求新型,在強化內(nèi)部管理,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時,良好的質(zhì)量、合理的價格、完善的服務,在業(yè)界受到寬泛好評。公司業(yè)務涵蓋細胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務,價格合理,品質(zhì)有保證,深受廣大客戶的歡迎。翼和生物將以真誠的服務、創(chuàng)新的理念、高品質(zhì)的產(chǎn)品,為彼此贏得全新的未來!