競爭性等位基因特異性PCR法——KASP（KompetitiveAlleleSpecificPCR），是英國LGC（**化學(xué)家實驗室）公司所開發(fā)的技術(shù)，被比較常見用于少位點，多樣本的SNP分型中，與TaqMan熒光探針法有一定相似性。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來對SNP分型以及檢測InDels(Insertions and Deletions，插入和缺失)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司，微信公眾號：上海翼和生物。 總公司地址位于：上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號502、508 ，此外，無錫設(shè)有分公司SNP對于樣本量，我們是比較有優(yōu)勢的，人口基數(shù)大，有大量的病例資源。山東STR/SSRSNP分型報告
2.SNaPshot法該技術(shù)由美國應(yīng)用生物公司（ABI）開發(fā)，是基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的分型技術(shù)，也稱小測序，主要針對中等通量的SNP分型項目。在一個含有測序酶、四種熒光標(biāo)記ddNTP、緊臨多態(tài)位點5’-端的不同長度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中，引物延伸一個堿基即終止，經(jīng)ABI測序儀檢測后，根據(jù)峰的移動位置確定該延伸產(chǎn)物對應(yīng)的SNP位點，根據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類，從而確定該樣本的基因型。對于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應(yīng)體系來獲得。通常用于10-30個SNP位點分析。安徽微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型分析單核苷酸多態(tài)性（SNP），主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)。
理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個或4個等位多態(tài)性，但實際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。因此，通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（CT，在其互補鏈上則為GA），也可能是顛換（CA，GT，CG，AT）。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異，具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3，其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高，可能是因為CpG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中，易發(fā)生突變的位點，其中大多數(shù)是甲基化的，可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中，任何堿基均有可能發(fā)生變異，因此SNP既有可能在基因序列內(nèi)，也有可能在基因以外的非編碼序列上?？偟膩碚f，位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP（codingSNP,cSNP）比較少，因為在外顯子內(nèi)，其變異率及周圍序列的1/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義，因此cSNP的研究更受關(guān)注。
TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針，熒光基團連接在探針的5’末端，而淬滅劑則在3’末端。在PCR反應(yīng)體系中加入2種不同熒光標(biāo)記的探針，它們可以分別與2個等位基因完全配對。正常情況下，由于探針5’端熒光基團和3’端淬滅基團緊鄰在一起，熒光被淬滅。隨著PCR有效的進行，與模板完全配對的探針逐步被TaqDNA聚合酶5’——3’外切酶活性切割，致使探針5’端熒光基團和3’端淬滅基團分離，淬滅效應(yīng)解除，報告熒光基團被，檢測到熒光信號，相反，如果模板不能完全配對的探針（另一種等位基因）不能被有效切割，因此檢測不到熒光信號，從而實現(xiàn)SNP位點的分型檢測。主要特點是準(zhǔn)確性高、靈活性強、通量大，主要方法是TaqMan探針法。
單核苷酸多態(tài)性（singlenucleotidepolymorphism，SNP），主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中，常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在，平均每500～1000個堿基對中就有1個，估計其總數(shù)可達300萬個甚至更多。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個堿基的變異，這種變異可由單個堿基的轉(zhuǎn)換（transition）或顛換（transversion）所引起，也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。杭州微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型售后服務(wù)周到
但是只要這個突變?nèi)簺]有達到總?cè)后w的1%，它就只是一個突變株/系。達到了1%就是多態(tài)性了。山東STR/SSRSNP分型報告
4.MassArray法MassARRAY分子量陣列技術(shù)是Sequenom公司推出的世界上靠前的基因分析工具，通過引物延伸或切割反應(yīng)與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術(shù)相結(jié)合，實現(xiàn)基因分型檢測?；贛assARRAY平臺的iPLEXGOLD技術(shù)可以設(shè)計，高達40重的PCR反應(yīng)和基因型檢測，實驗設(shè)計靈活，分型結(jié)果準(zhǔn)確性高。根據(jù)應(yīng)用需要，對數(shù)十到數(shù)百個SNP位點進行數(shù)百至數(shù)千份樣本檢測時，MassARRAY具有，佳的性價比，特別適合于對全基因組研究發(fā)現(xiàn)的結(jié)果進行驗證，或者是有限數(shù)量的研究位點已經(jīng)確定的情況。山東STR/SSRSNP分型報告
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