翼和為您普及小知識點：作者分別從國內(nèi)28個研究機構(gòu)搜集了278株常見人源腫liu細(xì)胞系，其中國內(nèi)建立的細(xì)胞系71株，國外建立的細(xì)胞系207株。經(jīng)STR鑒定后發(fā)現(xiàn)，來自于22個研究機構(gòu)的128株細(xì)胞存在交叉污染／錯誤鑒定的情況，錯誤率高達46%。其中國內(nèi)建立的細(xì)胞系占52株，這表明了什么，國內(nèi)建立的細(xì)胞系交叉污染／錯誤鑒定率竟然高達73.2%，并且67.3%（35/52）國內(nèi)交叉污染／錯誤鑒定的細(xì)胞系結(jié)果被證實是Hela細(xì)胞或被Hela細(xì)胞部分污染的！本文所使用的Hela細(xì)胞，由上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司鑒定。上海細(xì)胞鑒定位點
在一切由細(xì)胞身份開始說起一文中，小E已經(jīng)為大家羅列出目前已經(jīng)確定被Hela細(xì)胞污染的細(xì)胞系名稱。做細(xì)胞實驗的伙伴們可以翻閱一下，以防自己的細(xì)胞也在其中！還不僅只如此，這些常見的細(xì)胞系除了發(fā)現(xiàn)種屬內(nèi)的交叉污染／錯誤鑒定，還有部分細(xì)胞系被發(fā)現(xiàn)連種屬都被錯誤鑒定了！被鑒定的278株細(xì)胞系中，有20株（20/278=7.2%）細(xì)胞系PCR擴增失敗，證明其并非人源細(xì)胞。作者繼續(xù)追蹤實驗，通過種屬鑒定來確認(rèn)其真實來源，結(jié)果其中2株細(xì)胞系被證實分別來源于大鼠。上海STR鑒定送樣要求公司深知Hela細(xì)胞極易污染別的細(xì)胞，這些經(jīng)驗被應(yīng)用于身份驗證中。
如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系的身份？收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及STR信息，可以與參考數(shù)據(jù)庫進行比對。如果細(xì)胞樣本的每個STR位點和參考細(xì)胞STR位點都能重合匹配，即說明該細(xì)胞系正確，反之則說明你的細(xì)胞系可能被錯誤標(biāo)記，交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來，匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確，匹配度＜80%則說明該細(xì)胞系的來源需要被懷疑。如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯誤標(biāo)記，則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進行鑒定，從而找到問題的起源或者直接從可靠的機構(gòu)購買一株新的細(xì)胞系。
細(xì)胞STR鑒定的特點如下：STR 圖譜鑒別通過標(biāo)準(zhǔn)化的操作，采用自動化的DNA分析儀對PCR產(chǎn)物進行精確的分析，并以簡單的數(shù)字描述STR序列重復(fù)次數(shù)，不僅增加了結(jié)果的客觀性，而且所需細(xì)胞數(shù)量少(只需1×10^3個細(xì)胞)，而細(xì)胞鑒定中常規(guī)采用的同工酶法通常需要5×10^6個細(xì)胞，結(jié)果還沒那么穩(wěn)定，特異性也不強?？偟膩碚f，STR法分型快速、經(jīng)濟、易于自動化，可重復(fù)性好，且數(shù)據(jù)格式適合建立一個標(biāo)準(zhǔn)參考數(shù)據(jù)庫的特點，所以應(yīng)用價值極大。細(xì)胞系鑒定目前主要基于國際身份認(rèn)證委員會的標(biāo)準(zhǔn)。
短串聯(lián)重復(fù)(Short tandem repeats, STR)，又稱微衛(wèi)星DNA(Microsatellite DNA)或簡單重復(fù)序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR)，是普遍存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列。有絲分裂過程中DNA鏈之間的錯配引起的復(fù)制滑動被認(rèn)為是導(dǎo)致STR產(chǎn)生的較為常見原因，并且依據(jù)不同復(fù)制單元大小的不同以及不同物種之間，復(fù)制滑動發(fā)生的概率也不相同。STR已被廣泛應(yīng)用于親子鑒定、個體識別、司法鑒定、交通事故鑒定、（造血干細(xì)胞）移植醫(yī)治后嵌合情況監(jiān)測等領(lǐng)域。細(xì)胞系交叉污染或錯誤鑒定對研究是否有影響?江蘇STR鑒定
如何根據(jù)細(xì)胞STR鑒定結(jié)果判斷細(xì)胞系是否發(fā)生了交叉污染？上海細(xì)胞鑒定位點
上海翼和公司為客戶提供基于qPCR技術(shù)的種系鑒定方案，選擇人、小鼠、大鼠和倉鼠基因組中特異基因片段，設(shè)計引物和熒光探針，快速鑒定種系來源。該方案靈敏度和特異性高，可以檢測樣本中不同種系來源的細(xì)胞污染，當(dāng)污染細(xì)胞占比> 5% 時，可被穩(wěn)定檢出。在PCR反應(yīng)中，除了正向引物和反向引物外，還引入了第三個寡核苷酸序列，這是一個重大的進展。這個額外的序列，就是探針（Probe），它彌補了DNA結(jié)合染料的缺點。探針上有熒光修飾基團，可產(chǎn)生熒光信號。上海細(xì)胞鑒定位點
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā)，發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主，是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團隊。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括：細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨，深受客戶好評。公司深耕細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)，正積蓄著更大的能量，向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。