上海CPG島甲基化重測序準確度高

來源: 發(fā)布時間:2021-10-22

真核生物基因表達受多種機制、多層面的綜合調控。基因的DNA序列不發(fā)生改變的情況下,基因的表達水平與功能發(fā)生改變,并可遺傳現(xiàn)象,稱為表觀遺傳(epigenetic)現(xiàn)象。DNA甲基化是指在甲基轉移酶的催化下,DNA的CG二核苷酸中的胞嘧啶被選擇性的添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,常見于基因的5′—CG—3′序列。DNA甲基化的位置主要集中在基因5′端的非編碼區(qū),DNA高度甲基化首先會影響DNA結構,進而阻遏基因轉錄,引起基因沉默。人體內,DNA甲基轉移酶主要有四種:DNMT1、DNMT3A、DNMT3B和DNMT3L。在DNA復制完成后,DNMT1是催化甲基轉移至新合成的DNA鏈上,這一現(xiàn)象稱為維持甲基化;DNMT3A和DNMT3B負責催化核酸鏈上新的甲基化位點發(fā)生反應,成為形成甲基化;DNMT3L不具有甲級轉移酶活性,其主要作用是調節(jié)其他甲基轉移酶的活性。真核細胞內甲基化狀態(tài)有3種:持續(xù)的低甲基化狀態(tài)(如持家基因的甲基化)、誘導的去甲基化狀態(tài)(如一些發(fā)育階段特異性基因的修飾)和高度甲基化狀態(tài)(如人類女性細胞內縊縮-失活的X染色體的甲基化)。上海翼和生物通過亞硫酸氫鹽處理,用PCR擴增目的片段,并結合二代測序平臺并對PCR產物進行測序。上海CPG島甲基化重測序準確度高

DNA甲基化是指在甲基轉移酶的催化下,DNA的CG二核苷酸中的胞嘧啶被選擇性的添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,常見于基因的5′—CG—3′序列。DNA甲基化的位置主要集中在基因5′端的非編碼區(qū),DNA高度甲基化首先會影響DNA結構,進而阻遏基因轉錄,引起基因沉默。DNA甲基化為非編碼區(qū)(如內含子等)的長期沉默提供了一種有效的抑制機制?;騿訁^(qū)域內CpG位點的甲基化通過三種方式影響基因轉錄活性:DNA序列甲基化直接阻礙轉錄因子的結合;甲基CpG結合蛋白結合到甲基化CpG位點與其他轉錄抑制因子相互作用;染色質結構的凝集阻礙了轉錄因子與其調控序列的結合。浙江CPG島甲基化重測序公司亞硫酸氫鹽處理能夠將基因組中未發(fā)生甲基化的C堿基轉換成U,進行PCR擴增后變成T。

DNA甲基化是表觀遺傳修飾的主要方式,能在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn)。為外遺傳編碼(epigenetic code)的一部分,是一種外遺傳機制。DNA甲基化過程會使甲基添加到DNA分子上,例如在胞嘧啶環(huán)的5'碳上:這種5'方向的DNA甲基化方式可見於所有脊椎動物。在人類細胞內,大約有1%的DNA堿基受到了甲基化。在成熟體細胞組織中,DNA甲基化一般發(fā)生於CpG雙核苷酸(CpG dinucleotide)部位;而非CpG甲基化則於胚胎干細胞中較為常見。植物體內胞嘧啶的甲基化則可分為對稱的CpG(或CpNpG),或是不對稱的CpNpNp形式(C與G是堿基;p是磷酸根;N指的是任意的核苷酸)。特定胞嘧碇受甲基化的情形,可利用亞硫酸鹽定序(bisulfite sequencing)方式測定。DNA甲基化可能使基因沉默化,進而使其失去功能。此外,也有一些生物體內不存在DNA甲基化作用。

DNA甲基化一般是指DNA復制后,在DNA甲基轉移酶的作用下,將S-腺甘酰甲硫氨酸分子上的甲基轉移到DNA分子中胞嘧啶殘基的第5位碳原子上,形成5-甲基胞嘧啶的過程,它是真核細胞生物基因組重要的修飾方式之一。DNA甲基化包括從頭甲基化和維持甲基化2種模式。從頭甲基化是指在從未發(fā)生甲基化的位點上發(fā)生甲基化修飾,建立DNA甲基化的過程;而維持甲基化是指維持甲基化的酶可識別新合成的半甲基化雙鏈DNA,并將甲基添加到新鏈的非甲基化胞嘧啶上。表觀遺傳屬于一種可以對環(huán)境產生應答和改變的遺傳機制。

DNA甲基化作為一種重要的表觀修飾,在調控基因的時空特異性表達中扮演著關鍵的角色,參與了X染色體失活、基因組印記和重復序列抑制等諸多生命過程。哺乳動物細胞的DNA甲基化主要發(fā)生在CpG二核苷酸對的C(胞嘧啶)上,并在有絲分裂過程中得以相對穩(wěn)定的維持,這對細胞保持譜系特性有著重要的意義。上海翼和應用生物技術有限公司自主研發(fā)的Hi-MethylSeq技術,可對對大規(guī)模群體的候選基因甲基化水平進行檢測。上海翼和生物是上海市遺傳學會理事單位。DNA甲基化測序可在全基因組水平上比較大限度的、完整的獲取甲基化狀態(tài)信息和與基因表達調控的多重關系.北京甲基化重測序怎么解決

重亞硫酸氫鈉測序法(Bisulfite sequencing,BS-Seq)被認為是5mC鑒定的金標準。上海CPG島甲基化重測序準確度高

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