高通量二代測(cè)序法SNP基因分型——你有我有,你沒有我也有:上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司通過自主研發(fā)的高重PCR技術(shù),擴(kuò)增引物經(jīng)修飾及優(yōu)化,克服了傳統(tǒng)多重PCR擴(kuò)增效率不均一問題,95%以上擴(kuò)增子的測(cè)序深度在平均測(cè)序深度的0.2X范圍,保證測(cè)序通量的有效利用?;诔咧豍CR技術(shù)平臺(tái)的高通量二代SNP分型服務(wù),適用于多種遺傳學(xué)研究領(lǐng)域,如疾病與基因的關(guān)聯(lián)分析,臨床分子診斷研究,QTL定位及分子育種等大規(guī)模多位點(diǎn)大樣本的SNP分析。SNP對(duì)于樣本量,我們是比較有優(yōu)勢(shì)的,人口基數(shù)大,有大量的病例資源。廣州微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型準(zhǔn)確度高
單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism,SNP),主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在,平均每500~1000個(gè)堿基對(duì)中就有1個(gè),估計(jì)其總數(shù)可達(dá)300萬個(gè)甚至更多。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個(gè)堿基的變異,這種變異可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起,也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。上海STR/SSRSNP分型送樣要求SNP在人類基因組中普遍存在,平均每500~1000個(gè)堿基對(duì)中就有1個(gè),估計(jì)其總數(shù)可達(dá)300萬個(gè)甚至更多。
將待檢測(cè)片段(包含待測(cè)SNP位點(diǎn))進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中,準(zhǔn)確的一種,堪稱SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖,純和位點(diǎn)為單峰,而雜合位點(diǎn)則為套峰,因此通過查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開來。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè),還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點(diǎn)。直接測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)是結(jié)果準(zhǔn)確,能發(fā)現(xiàn)未知位點(diǎn),但是其缺點(diǎn)是通量低,成本高。因此直接測(cè)序法適用于少位點(diǎn),少樣本的分型規(guī)模,當(dāng)然土豪實(shí)驗(yàn)室除外!所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實(shí)驗(yàn)中得到推廣。
相比Taqman熒光探針法,KASP技術(shù)只要合成兩個(gè)通用熒光探針,兩個(gè)通用淬滅探針,通用熒光探針來代替針對(duì)位點(diǎn)的熒光探針,極大節(jié)約成本。同時(shí)配套SNPline基因分型儀器平臺(tái),可以進(jìn)行高通量的SNP分型規(guī)模。該方法利用多重PCR技術(shù),同時(shí)捕獲數(shù)十上百個(gè)SNP位點(diǎn),Barcode引物區(qū)分不同樣本,實(shí)現(xiàn)一次上機(jī)測(cè)序,完成多位點(diǎn),大樣本的高通量分型實(shí)驗(yàn)?zāi)康?。多重PCR特性,也極大降低了對(duì)樣本量的需求。上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。SNP是人類可遺傳的變異中比較常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗(yàn)的專業(yè)遺傳學(xué)服務(wù)供應(yīng)商。公司的首席科學(xué)家為肖君華教授(東華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)研究所教授;中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)理事;上海市遺傳學(xué)會(huì)常務(wù)理事)。公司擁有兩大專業(yè)平臺(tái):基于一代測(cè)序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺(tái);基于多重PCR捕獲建庫(kù)技術(shù)的二代測(cè)序平臺(tái)。為順應(yīng)市場(chǎng)需求,公司在2019年開拓了個(gè)人基因檢測(cè)業(yè)務(wù)。目前已開展心血管個(gè)體化用藥相關(guān)基因的檢測(cè),孕婦葉酸及鈣代謝兩項(xiàng)基因檢測(cè)業(yè)務(wù)。兩項(xiàng)基因檢測(cè)均基于翼和一代測(cè)序平臺(tái)的PCR-LDRSNP基因分型方法。目前在nature genetics和cell這樣的雜志,也不乏SNP的文章。浙江SSRSNP分型售后服務(wù)周到
SNP本身是針對(duì)“群體”而言的(within a population)。廣州微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型準(zhǔn)確度高
通過對(duì)病例組和對(duì)照組的基因分型,并且對(duì)病例組的各種因素如年齡、性別、是否吸煙、喝酒等進(jìn)行了調(diào)查,使得分析的結(jié)果多樣化,更加有意思。根據(jù)初步定位得到的風(fēng)險(xiǎn)值估計(jì)和關(guān)聯(lián)分析結(jié)果,進(jìn)一步進(jìn)行多元分析,并與血脂譜各項(xiàng)指標(biāo)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,從而對(duì)其功能模式進(jìn)行推測(cè)。這樣就使得全文的邏輯層次分明,更加完整,是比較經(jīng)典的SNP研究模式。上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。廣州微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型準(zhǔn)確度高
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型公司。翼和生物致力于為客戶提供良好的細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù),一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì)、強(qiáng)大的技術(shù),還有一批獨(dú)立的專業(yè)化的隊(duì)伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。翼和生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。