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m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。分享的內(nèi)容能對(duì)大家有所幫助,想要了解更多,歡迎致電咨詢。廣西血液科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
2)固定的目的①保持其原有狀態(tài):使細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、脂肪、糖、酶等成分轉(zhuǎn)變?yōu)椴蝗苄晕镔|(zhì),迅速防止、細(xì)胞的死后變化,防止自溶與,防止細(xì)胞過度收縮或膨脹而失去其原有形態(tài)結(jié)構(gòu),使之盡量保持生前的狀態(tài)和結(jié)構(gòu)。②以便染色后易于鑒別和觀察:不同成分對(duì)染料有不同的親和力,以便染色后易于鑒別和觀察。③使塊硬化,便于制作薄片(塊在脫水、包埋、切片、染色等過程中不易損壞)。(3)固定液固定液種類:一類是單純固定液,即只有一種試劑;另一類是混合固定液,由兩種或兩種以上試劑組成。作為較好的固定液,應(yīng)有下列特性,首先,有強(qiáng)滲透力,能迅速的滲入內(nèi)部;其次,不使過度收縮或膨脹,并能使內(nèi)欲觀察的成分得以凝固為不溶性物質(zhì);能使達(dá)到一定的硬度并獲得較佳的折光率和對(duì)某些染料具有較強(qiáng)的親和力。固定液通常使用10%的甲醛溶液。特殊要求的,常需要特殊的固定液,取樣之前應(yīng)做好準(zhǔn)備。如眼球樣本應(yīng)使用FAS眼球固定液,脂肪應(yīng)使用脂肪固定液等。此外,在進(jìn)行骨樣本制備的時(shí)候,還應(yīng)注意提前進(jìn)行脫鈣處理,可根據(jù)具體情況選擇慢脫鈣或快脫鈣處理??偟膩碚f,樣品的采集是實(shí)驗(yàn)中至關(guān)重要的一環(huán),如果取樣環(huán)節(jié)出現(xiàn)了偏差,往往會(huì)導(dǎo)致后續(xù)檢測(cè)結(jié)果的偏移。寧夏豚鼠科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)裸鼠皮下成瘤模型造模意義.
產(chǎn)品庫科研資訊實(shí)驗(yàn)試用中心技術(shù)專題會(huì)議商城生意通品牌求購發(fā)布產(chǎn)品儀器設(shè)備庫細(xì)胞分析儀器儲(chǔ)存保存設(shè)備實(shí)驗(yàn)室箱體/搖床實(shí)驗(yàn)室安全設(shè)備生物芯片3D打印儀器設(shè)備庫生物芯片影像系統(tǒng)測(cè)讀系統(tǒng)光譜系統(tǒng)分子生物實(shí)驗(yàn)儀器顯微系統(tǒng)色譜系統(tǒng)質(zhì)譜系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化基因組/蛋白組設(shè)備植物生理/動(dòng)物生理毒理/實(shí)驗(yàn)動(dòng)物設(shè)備神經(jīng)生物學(xué)儀器組織學(xué)設(shè)備過濾裝置電化學(xué)儀器細(xì)胞培養(yǎng)儀器耗材庫常用耗材移液器(Pipette)PCR耗材儀器配套耗材細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分子生物學(xué)耗材耗材庫常用耗材移液器(Pipette)吸頭(Tips)瓶(Bottle)瓶(Flask)管(Tube&Vial)PCR耗材微孔板色譜柱色譜介質(zhì)細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分子生物學(xué)耗材過濾耗材儀器配套耗材試劑庫細(xì)胞培養(yǎng)細(xì)胞干細(xì)胞免疫檢測(cè)/ELISA常用生化試劑酶試劑庫生物分子常用生化試劑酶蛋白質(zhì)/抗原/多肽cDNA及合成純化PCR/RT-PCR/qPCR載體及構(gòu)建文庫及構(gòu)建克隆與表達(dá)表達(dá)分析核酸/蛋白合成核酸分析核酸檢測(cè)核酸純化RNAi技術(shù)(siRNA,miRNA。
應(yīng)退回純酒精中重新脫水,然后再透明,否則切片難以鏡檢。(4)二甲苯應(yīng)盡量保持無水,應(yīng)經(jīng)常更換,或用紗布包無水硫酸銅放入染色缸內(nèi)吸收水分。5.透蠟注意事項(xiàng)(1)透蠟的目的是除去組織中的透明劑(如二甲苯等),使石蠟滲透到組織內(nèi)部達(dá)到飽和程度以便包埋。透蠟時(shí)間根據(jù)組織大小而定。(2)盡量保持在較低溫度中進(jìn)行,以石蠟不凝固為度。(3)透蠟溫度要恒定,不可忽高忽低。(4)操作要迅速,力求在短的時(shí)間內(nèi)完成石蠟透入過程,以免引起組織變硬、變脆、收縮等。(5)注意溫度不要過高,以免組織發(fā)脆。6.染色水洗注意事項(xiàng)(1)染色原理:伊紅主要染細(xì)胞質(zhì),著色濃淡應(yīng)與蘇木精染細(xì)胞核的濃淡相配合,如果細(xì)胞核染色較濃,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)濃染,以獲得鮮明的對(duì)比。(2)染色時(shí)間應(yīng)根據(jù)染色劑的成熟程度及室溫高低,適當(dāng)縮短或延長(zhǎng)。室溫高時(shí)促進(jìn)染色,染色時(shí)間可短些,否則可適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間,冬季室溫低時(shí)可放入恒溫箱中染色。(3)注意流水不能過大,以防切片脫落。(4)如果細(xì)胞核染色較淺,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)淡染。可在伊紅乙醇液中滴加數(shù)滴冰醋酸助染,促使細(xì)胞質(zhì)容易著色,并且經(jīng)乙醇脫水時(shí)不易褪色??梢云毡閼?yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究、藥物篩選、腫、瘤診斷等領(lǐng)域。
準(zhǔn)備碎冰和。把膜置于甲醇溶液中活化1分鐘,然后轉(zhuǎn)移至轉(zhuǎn)膜液中平衡3分鐘后備用。2、轉(zhuǎn)膜組裝轉(zhuǎn)膜三明治夾,這一步很關(guān)鍵,重要的是膠和膜之間不能有氣泡且膜與膠要保證貼合緊密(否則會(huì)翻車),可以加多點(diǎn)轉(zhuǎn)膜液泡著。組裝好后加滿轉(zhuǎn)膜液,設(shè)置電源參數(shù),我習(xí)慣恒流轉(zhuǎn)膜,200-280毫安,1-2小時(shí),根據(jù)分子量定,如50KD的分子用60分鐘就夠了。如果一個(gè)電源帶兩個(gè)轉(zhuǎn)膜大槽即四塊膠,我就會(huì)用恒壓70-110V。這個(gè)過程重要的是做好降溫。這里簡(jiǎn)單說一下蛋白分子量與玻璃板厚度,分離膠的濃度,轉(zhuǎn)膜電源參數(shù)的選擇問題。如果是能用1毫米的玻璃板就不用,因?yàn)檗D(zhuǎn)膜是在電場(chǎng)的作用下蛋白分子從膠上遷移到膜上,1毫米膠的蛋白遷移距離要比。選擇更薄的膠蛋白轉(zhuǎn)膜時(shí)間可以減少,從而減少發(fā)熱,以免膠變形,條帶也會(huì)更好看。然后是分離膠的濃度,如果是150—200KD的分子選10%以下的的分離膠,200—300KD的選8%的,300KD以上的選6%的,小于30KD的200mA30分鐘,30-100KD的按分子量的數(shù)值算,如70KD,250mA70分鐘;100-150KD的250mA100分鐘;150—300KD的分子轉(zhuǎn)膜條件用280毫安(以上均是對(duì)于,),120分鐘足矣,前提是膠的濃度相適應(yīng)。五、封閉孵一抗1、封閉轉(zhuǎn)膜結(jié)束后。細(xì)胞是生命的基本單位,所有生物體都是由一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞組成的。下面就跟著上海東寰一起看看吧。湖北實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
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注意事項(xiàng)1.病毒包裝的幾個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)主要包括:細(xì)胞因素、載體系統(tǒng)(盡量使用成熟的商業(yè)化載體系統(tǒng))、構(gòu)建重組的質(zhì)粒正確與否、質(zhì)粒抽提純化情況、包裝轉(zhuǎn)染控制(24、48小時(shí)的細(xì)胞及熒光狀態(tài)判斷)、目的基因?qū)?span style="color:#f5c81c;">病毒包裝影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會(huì)影響到是否能包裝成功)。,需要觀察包裝病毒后的48h培養(yǎng)基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮:病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話,也可以直接將收集的病毒上清作為要的細(xì)胞的培養(yǎng)基,但是可能效果會(huì)不太好。并且一般收病毒時(shí),培養(yǎng)基的營(yíng)養(yǎng)已經(jīng)損耗了很多,那樣直接培養(yǎng)細(xì)胞會(huì)損害細(xì)胞,所以建議還是進(jìn)行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時(shí)293T細(xì)胞狀態(tài)不好,或者鋪得過密,可以選擇放棄該次實(shí)驗(yàn)。2.目的載體過大,不易。3.避免轉(zhuǎn)染過程以及后續(xù)過程出現(xiàn)的污染。廣西血液科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)