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來源: 發(fā)布時(shí)間:2025-05-29

是整體甲基化進(jìn)程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個(gè)被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力,進(jìn)而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關(guān),揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個(gè)成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達(dá)改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過兩個(gè)途徑:精細(xì)調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu),以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別,誘發(fā)續(xù)反應(yīng)。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實(shí)是m6A的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結(jié)合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。此外,動(dòng)物模型的倫理問題也不容忽視,科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進(jìn)行相關(guān)研究。浙江乳鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

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我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣,一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短,從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì),蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn),一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中,二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(qū)(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會(huì)使蛋白提取不充分,加太多會(huì)讓蛋白濃度太低,一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的,細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液,動(dòng)物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右,注意不要產(chǎn)生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。浙江乳鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)裸鼠皮下成瘤模型造模意義.

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靜置25分鐘后把酒精倒干,用吸水紙吸出多余的酒精,然后配壓縮膠,同樣的操作,關(guān)鍵是梳子要插得快,要小心梳子下產(chǎn)生氣泡,然后靜置30分鐘。如果是當(dāng)天跑膠,我會(huì)等上層膠凝2個(gè)小時(shí)再用,但要注意防干燥縮水,可以在一個(gè)小時(shí)的時(shí)候沿著梳子上緣加點(diǎn)電泳液。所以我一般提前一晚制膠,泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準(zhǔn)備把膠組裝到電泳芯上,注意密閉性(否則漏液),如果內(nèi)槽漏液就不是勻強(qiáng)電場了,條帶可能就不是一條直線。然后內(nèi)槽倒?jié)M電泳液,拔梳子,這一步要小心,梳子要兩邊一起緩緩?fù)习纬?,然后觀察泳道內(nèi)有無脫落的膠粒或者膠絲,有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品,解凍。準(zhǔn)備振蕩器。2、上樣和電泳注意,上樣后蛋白會(huì)開始慢慢在膠中彌散,所以上樣越快越好。我習(xí)慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品,蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩),吸的時(shí)候沒有拉絲即可,建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來,不然樣品中SDS可能會(huì)結(jié)晶析出,從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘,下層膠120V65分鐘。四、轉(zhuǎn)膜1、轉(zhuǎn)膜前準(zhǔn)備我會(huì)在電泳結(jié)束0分鐘準(zhǔn)備,把轉(zhuǎn)膜液配好置于4度冰箱預(yù)冷,然后裁膜,準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜裝置。

代謝組學(xué)的研究對象大都是相對分子量在1000以內(nèi)的小分子物質(zhì),因此常用的血液樣本在取樣后,應(yīng)小心操作,防止溶血,盡快分離出血清,分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實(shí)驗(yàn)的動(dòng)物采集相對其他樣品的采集,操作更繁瑣,在處理過程中許多細(xì)節(jié)容易忽略,造成數(shù)據(jù)不完美(甚至不能用)。因此接下來將重點(diǎn)介紹樣品采集的注意事項(xiàng)及其固定。樣品采集注意事項(xiàng)應(yīng)新鮮,操作時(shí)間盡可能短,否則細(xì)胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動(dòng)物心臟還在跳動(dòng)時(shí)采集,樣本取出后在5分鐘以內(nèi)置于固定液內(nèi),避免長時(shí)間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜,較為理想的厚度為2mm左右,主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內(nèi)部。勿使塊受擠壓。在采集過程中,應(yīng)盡量選擇較為鋒利的手術(shù),如手術(shù)刀片等,避免操作過程中擠壓挫傷標(biāo)本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜,能夠在容器內(nèi)自由移動(dòng)。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經(jīng)固定后,或多或少產(chǎn)生收縮現(xiàn)象(如胃腸),為此可將展平,以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等,可用生理鹽水沖洗,然后再入固定液,但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準(zhǔn)確的按解剖部位采集??蒲屑夹g(shù)服務(wù)的具體服務(wù)內(nèi)容相當(dāng)豐富,涵蓋了多個(gè)方面。

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常見的有理染色、WesternBlot、PCR等),實(shí)驗(yàn)儀器是否需要預(yù)約使用。如果需要外送公司檢測,需要提前聯(lián)系好商家,以及了解清楚樣本如何獲取,如何運(yùn)輸。飼養(yǎng)動(dòng)物及干預(yù)動(dòng)物購買后需要將時(shí)間節(jié)點(diǎn)提前規(guī)劃好,比如,周需要做什么?測量體重?觀察飲食?測量需要的指標(biāo)?中間有無特殊操作?比如灌胃、測量體重、做CT檢測、取血?……第幾周取材?取材需要哪些?預(yù)實(shí)驗(yàn)方案就要提前設(shè)計(jì)清楚以上內(nèi)容。取材及樣品準(zhǔn)備取材需要提前到動(dòng)物房禁食、稱體重、取出動(dòng)物、手術(shù)的、固定所需要的試劑和EP管,WesternBlot和PCR所需要的樣本儲(chǔ)存條件。比如凍存管、EP管,是否需要冰塊?是否需要液氮?取材當(dāng)天需要多少人?是否需要請人幫忙?如果所需要取出的樣本較多,建議大家請人一起幫忙,流水線作業(yè),這樣能節(jié)省時(shí)間,并且能保證樣品的質(zhì)量。如果請人,每個(gè)人需要負(fù)責(zé)哪一板塊的工作,比如誰負(fù)責(zé),誰負(fù)責(zé)取血液,誰負(fù)責(zé)取,誰負(fù)責(zé)拍照、誰負(fù)責(zé)儲(chǔ)存,都需要提前規(guī)劃交代清楚。實(shí)驗(yàn)指標(biāo)檢測如果是需要自己做的檢測,比如常見的WesternBlot、PCR,建議提前可以看看教程(無論是視頻還是貼吧,都要自己多方參考)。有了一定的理論基礎(chǔ)后,再向老師、師兄師姐學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)和技術(shù)。動(dòng)物疾病模型還為科研人員提供了研究人類疾病的跨學(xué)科方法。浙江乳鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

在藥物研發(fā)過程中,科研人員可以通過對動(dòng)物模型進(jìn)行藥物處理,觀察其療效和副作用,為新藥的試驗(yàn)提供依據(jù)。浙江乳鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

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