河北血液科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-12-14

    m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過(guò)m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾細(xì)胞模型或者發(fā)組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過(guò)qPCR、WB、免熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過(guò)去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過(guò)RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。常見的5種實(shí)驗(yàn)動(dòng)物取血方式,你掌握幾種?河北血液科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

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    2)固定的目的①保持其原有狀態(tài):使細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、脂肪、糖、酶等成分轉(zhuǎn)變?yōu)椴蝗苄晕镔|(zhì),迅速防止、細(xì)胞的死后變化,防止自溶與,防止細(xì)胞過(guò)度收縮或膨脹而失去其原有形態(tài)結(jié)構(gòu),使之盡量保持生前的狀態(tài)和結(jié)構(gòu)。②以便染色后易于鑒別和觀察:不同成分對(duì)染料有不同的親和力,以便染色后易于鑒別和觀察。③使塊硬化,便于制作薄片(塊在脫水、包埋、切片、染色等過(guò)程中不易損壞)。(3)固定液固定液種類:一類是單純固定液,即只有一種試劑;另一類是混合固定液,由兩種或兩種以上試劑組成。作為較好的固定液,應(yīng)有下列特性,首先,有強(qiáng)滲透力,能迅速的滲入內(nèi)部;其次,不使過(guò)度收縮或膨脹,并能使內(nèi)欲觀察的成分得以凝固為不溶性物質(zhì);能使達(dá)到一定的硬度并獲得較佳的折光率和對(duì)某些染料具有較強(qiáng)的親和力。固定液通常使用10%的甲醛溶液。特殊要求的,常需要特殊的固定液,取樣之前應(yīng)做好準(zhǔn)備。如眼球樣本應(yīng)使用FAS眼球固定液,脂肪應(yīng)使用脂肪固定液等。此外,在進(jìn)行骨樣本制備的時(shí)候,還應(yīng)注意提前進(jìn)行脫鈣處理,可根據(jù)具體情況選擇慢脫鈣或快脫鈣處理??偟膩?lái)說(shuō),樣品的采集是實(shí)驗(yàn)中至關(guān)重要的一環(huán),如果取樣環(huán)節(jié)出現(xiàn)了偏差,往往會(huì)導(dǎo)致后續(xù)檢測(cè)結(jié)果的偏移。上??蒲屑夹g(shù)服務(wù)培養(yǎng)裸鼠皮下成瘤模型造模意義.

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    m6A研究又有新手段了?趕緊來(lái)了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無(wú)修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無(wú)法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無(wú)修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析(圖3)。

    把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時(shí)。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話,要用TBST泡洗三遍再轉(zhuǎn)移至一抗溶液中,BSA封閉的可以直接轉(zhuǎn)移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個(gè)長(zhǎng)方形,這里的寬與長(zhǎng)相對(duì)應(yīng))不大于8毫米,我習(xí)慣置于15毫升離心管中孵育,兩條膜"背對(duì)背"式放置于一個(gè)管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米,就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過(guò)夜,一般是12-18個(gè)小時(shí),注意放置水平,用搖床。內(nèi)參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現(xiàn)條帶連在一起的情況,這時(shí)可以縮短孵育時(shí)間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個(gè)小時(shí)足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗,這樣背景會(huì)干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液,我們一般一條膜一個(gè)槽地孵。2、顯影這一步有個(gè)細(xì)節(jié)可能有些同學(xué)沒注意到,就是ECL發(fā)光液要與HRP反應(yīng)一分鐘后顯影效果才會(huì)更好,還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋,一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。通過(guò)對(duì)動(dòng)物模型的研究,科研人員可以更清楚地了解疾病的發(fā)展過(guò)程和機(jī)制,為人類疾病的檢查提供理論依據(jù)。

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    外泌體作為物載體由于特殊的結(jié)構(gòu)和循環(huán)方式,外泌體作為物運(yùn)輸?shù)妮d體具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。例如外泌體的尺寸分布能夠增強(qiáng)滲透滯留效應(yīng),從而有選擇性地深入組織;其外層磷脂雙分子層可以保護(hù)內(nèi)容物不受各種生物酶的影響,維持各種生物分子的活性;外泌體普遍存在于各種體液和組織中,其體積小,結(jié)構(gòu)、組成與細(xì)胞膜類似,導(dǎo)致外泌體可以在避開免系統(tǒng)監(jiān)督的同時(shí)深入組織內(nèi)部,有較好的生物相容性;當(dāng)采用內(nèi)源外泌體時(shí),能明顯降低其他物載體可能引起的有害免反應(yīng);除此之外,某些細(xì)胞來(lái)源或經(jīng)特殊修飾過(guò)的外泌體具有良好的特異性,可以與特定的或組織結(jié)合。因此,載成為外泌體研究的一個(gè)重要分支,具有良好的應(yīng)用前景。在外泌體中引入物的方式包括體內(nèi)裝載和體外裝載兩種。體內(nèi)物裝載可以通過(guò)傳統(tǒng)方法(如毒轉(zhuǎn)染、脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染或電穿孔等)轉(zhuǎn)染來(lái)源細(xì)胞,編碼感興趣的RNA或蛋白質(zhì),也可以使物與來(lái)源細(xì)胞共混,使細(xì)胞分泌產(chǎn)生含有目標(biāo)生物分子的外泌體。體外物裝載則首先需要得到純化的外泌體,然后將感興趣的物通過(guò)電穿孔或脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染等方法裝入純化的外泌體。外泌體內(nèi)可裝載的物包括小分子化學(xué)物、蛋白質(zhì)和多肽、核酸物、天然產(chǎn)物等。EdU細(xì)胞增殖檢測(cè)是一種快速、準(zhǔn)確、靈敏的細(xì)胞增殖檢測(cè)方法.海南病理科研技術(shù)服務(wù)分離

這項(xiàng)技術(shù)可用來(lái)將含有上千種不同蛋白質(zhì)的樣品中,分離和濃縮出特定蛋白質(zhì)。河北血液科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

    科手術(shù)設(shè)備|細(xì)胞/組織支持系統(tǒng)|膜片鉗|輔助設(shè)備|其它常用耗材燒杯|漏斗|量筒|廣口罐|研缽和研杵|手套|移液管|移液器(Pipette)單道手動(dòng)移液器|單道電動(dòng)移液器|多道手動(dòng)移液器多道電動(dòng)移液器|正置換移液器|瓶口分液器吸頭(Tips)濾芯吸頭(滅菌)|濾芯吸頭(未滅菌)|普通吸頭(滅菌)普通吸頭(未滅菌)|多道移液器吸頭液體工作站吸頭|其它瓶(Bottle)離心瓶|稱量瓶|存儲(chǔ)瓶|比重瓶|血清瓶|滴瓶吸氣瓶|細(xì)胞培養(yǎng)瓶|培養(yǎng)基瓶|其它瓶(Flask)藍(lán)蓋瓶|燒瓶|平底燒瓶|克氏(長(zhǎng)頸)燒瓶|碘測(cè)定燒瓶|蒸餾燒瓶|容量瓶|過(guò)濾瓶|其它管(Tube&Vial)離心管|微離心管|樣品儲(chǔ)存管|凍存管|反應(yīng)管聚乙烯保存管|細(xì)胞培養(yǎng)管|自動(dòng)上樣管|其它PCR耗材PCR管|PCR條板|PCR板|實(shí)時(shí)定量PCR毛細(xì)管其它微孔板微孔板(96孔)|微孔板(384孔)|微孔板。河北血液科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建