上海地區(qū)宏全基因組高通量測(cè)序技術(shù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-10-18

如果你的樣品是質(zhì)粒或者是菌液,那為什么不試試我們的KBSeq呢?準(zhǔn)確、迅速,可以說(shuō)是KBSeq的代名詞了,關(guān)鍵是還可以省錢(qián),估計(jì)這是很多小伙伴們一定會(huì)說(shuō),你這個(gè)服務(wù)單價(jià)可比Sanger貴多了,怎么可能會(huì)省錢(qián)呢?Sanger測(cè)序的價(jià)格:常規(guī)的一代測(cè)序基本上要每800 bp就測(cè)一個(gè)反應(yīng),那我們來(lái)算一下14000/800=17.5,那基本上就要測(cè)18個(gè)反應(yīng)了,按照現(xiàn)在生工官方的價(jià)格區(qū)間,這個(gè)屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個(gè)反應(yīng)之間的,那每個(gè)反應(yīng)的價(jià)格為26元,這樣算下來(lái)18*26=468元,還要加上引物合成的費(fèi)用,實(shí)驗(yàn)周期的話(huà)大概率是要超過(guò)15天的。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序的價(jià)格:序列長(zhǎng)度屬于6-15 kb之間,159元,實(shí)驗(yàn)的周期大概在5-7天左右。如果是水體樣品,建議采用濾膜過(guò)濾后,將濾膜寄送來(lái)生工。上海地區(qū)宏全基因組高通量測(cè)序技術(shù)

AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過(guò)完整的細(xì)胞膜,嵌入所有細(xì)胞(活細(xì)胞和死細(xì)胞)的細(xì)胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過(guò)不完整的細(xì)胞膜,即死細(xì)胞的細(xì)胞膜,嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過(guò)標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞,這種特異性染色的方法也可以排除無(wú)核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細(xì)胞濃度(總細(xì)胞,活細(xì)胞,死細(xì)胞)、細(xì)胞存活率(臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色)、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序原理寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱(chēng)、濃度以及制備時(shí)間,管口使用Parafilm封口。

為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)?細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中,因細(xì)胞類(lèi)型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細(xì)胞分裂和分化過(guò)程中出現(xiàn)的誤差造成來(lái)自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測(cè)序檢測(cè)的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過(guò)去的20多年中,人們對(duì)轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),卻無(wú)法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組,而單細(xì)胞測(cè)序測(cè)量的是細(xì)胞群中單個(gè)細(xì)胞的基因組[7]。現(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱(chēng)為批量測(cè)序。

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:RNA-Seq,是基于新一代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法:首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集,然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測(cè)序,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝,從而獲得一個(gè)個(gè)單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本,進(jìn)而可以對(duì)該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對(duì)不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析,則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化,針對(duì)關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路(Pathway)的構(gòu)建。RNA樣品建議用足量干冰運(yùn)輸。

樣本寄送時(shí),請(qǐng)將填寫(xiě)完整的紙質(zhì)版《高通量測(cè)序送樣表》密封于塑料袋內(nèi),隨樣本一起寄出,紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時(shí)并正確的保存并錄入樣本,如無(wú)紙質(zhì)版的樣本信息單可能會(huì)延誤項(xiàng)目周期;樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱(chēng)需要與《高通量測(cè)序送樣表》里樣本名稱(chēng)一致,這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號(hào)而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實(shí)驗(yàn);如有特殊情況,請(qǐng)?jiān)凇陡咄繙y(cè)序送樣表》中注明;樣品編號(hào)請(qǐng)避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號(hào)標(biāo)示,避免分析的時(shí)候系統(tǒng)無(wú)法識(shí)別,導(dǎo)致分析無(wú)法完成;我們分析人員建議編號(hào)可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式,字符比較好不要過(guò)長(zhǎng),避免繪制部分分析圖的時(shí)候難以全部展示。生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn),日均處理樣品200余例。上海市l(wèi)ncRNA高通量測(cè)序NGS

請(qǐng)合理安排樣品寄送時(shí)間,避免樣本在周六、周日或法定節(jié)假日到達(dá)生工生物。上海地區(qū)宏全基因組高通量測(cè)序技術(shù)

生工人線(xiàn)粒體基因組測(cè)序(多重?cái)U(kuò)增法),項(xiàng)目介紹:生工生物高通量測(cè)序部采用多重?cái)U(kuò)增技術(shù),對(duì)人線(xiàn)粒體基因組進(jìn)行擴(kuò)增捕獲,并進(jìn)一步采用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。該技術(shù)方案可以快速擴(kuò)增到幾乎線(xiàn)粒體全長(zhǎng),并進(jìn)行高深度測(cè)序,下游提供常規(guī)比對(duì)篩查突變等生物信息分析??蛻?hù)提供樣品類(lèi)型:1.人來(lái)源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測(cè)結(jié)果為準(zhǔn)2.運(yùn)輸條件:冰袋運(yùn)輸。交付信息:1.測(cè)序原始數(shù)據(jù)交付實(shí)驗(yàn)報(bào)告2.測(cè)序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。上海地區(qū)宏全基因組高通量測(cè)序技術(shù)

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗(yàn),在發(fā)展過(guò)程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時(shí)刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及客戶(hù)資源,在業(yè)界也收獲了很多良好的評(píng)價(jià),這些都源自于自身不努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評(píng)價(jià)對(duì)我們而言是最好的前進(jìn)動(dòng)力,也促使我們?cè)谝院蟮牡缆飞媳3謯^發(fā)圖強(qiáng)、一往無(wú)前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個(gè)新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來(lái),創(chuàng)造更有價(jià)值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿(mǎn)的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長(zhǎng)!

標(biāo)簽: 高通量測(cè)序