微生物基因組重測序(有參):目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù),對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序,精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測序(無參):對于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說,要確定一個菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進行基因組測序。利用高通量測序技術(shù),對這些基因組進行高深度測序,然后進行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進化關(guān)系。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。上海市微生物高通量測序服務(wù)
對于細胞樣品,送樣量需達到 5 × 106(5乘10的6次方)數(shù)量級。富集后置于 2 ml Ep管中,用 1 ml TRIzol 重懸,注意取樣后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰中用保溫箱寄送。強烈建議細胞樣品先做細胞鑒定及支原體/衣原體污染之后,再送出來。對于血液樣本,只接收未凍存過的抗凝血新鮮樣本??鼓齽┎豢墒褂酶嗡剽c,可用EDTA或ACD抗凝劑,取血后以冰袋保存,切記不能使血液凍結(jié),從取血之時開始計算,須在48小時之內(nèi)送達生工上??偛扛咄繙y序部。如果不能提供新鮮樣本,則請?zhí)峁难褐刑崛〉目俁NA樣本。備樣要求詳見B、RNA 樣品。上海地區(qū)宏全基因組高通量測序應(yīng)用如果你的樣品是質(zhì)?;蛘呤蔷海菫槭裁床辉囋囄覀兊腒BSeq呢?
生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。
使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應(yīng)注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口gun頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細胞應(yīng)當(dāng)計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。
使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應(yīng)注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口***頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細胞應(yīng)當(dāng)計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。關(guān)鍵是KBSeq還可以省錢。上海地區(qū)生工高通量測序原理
對于需要進行RNA抽提的部分特殊樣品,可以將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送。上海市微生物高通量測序服務(wù)
單細胞懸液質(zhì)檢方法,在進行單細胞懸液質(zhì)檢時,需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助:熒光細胞計數(shù)儀(主要使用臺盼藍和雙熒光AO/PI染色法)進行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細胞質(zhì)檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。熒光細胞計數(shù)儀檢測結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細胞濃度(總細胞,活細胞,死細胞)、細胞存活率(臺盼藍和雙熒光AO/PI染色)、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結(jié)果的展示。上海市微生物高通量測序服務(wù)
生工生物工程(上海)股份有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中,一直處在一個不斷銳意進取,不斷制造創(chuàng)新的市場高度,多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑,成績讓我們喜悅,但不會讓我們止步,殘酷的市場磨煉了我們堅強不屈的意志,和諧溫馨的工作環(huán)境,富有營養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新,勇于進取的無限潛力,生工生物工程供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來,回首過去,我們不會因為取得了一點點成績而沾沾自喜,相反的是面對競爭越來越激烈的市場氛圍,我們更要明確自己的不足,做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備,要不畏困難,激流勇進,以一個更嶄新的精神面貌迎接大家,共同走向輝煌回來!