上海市單細胞測序高通量測序產(chǎn)品

來源: 發(fā)布時間:2022-10-10

通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質檢能觀察到懸液背景質量和細胞數(shù)目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內而使死細胞染成淡藍色。怎樣通過血球計數(shù)板進行質檢操作呢?將血球計數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數(shù)板上;將細胞懸液混勻(或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液),吸出10μl懸液至計數(shù)板上蓋玻片的一側使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數(shù)區(qū)域進行計數(shù);按細胞計數(shù)公式進行計算,計算公式:細胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù),V1/V2/V3/V4為各個計數(shù)區(qū)的細胞數(shù)目,細胞活率=活細胞數(shù)目/總細胞數(shù)目*100%。KBSeq全質粒測序對于樣本的量,要求的也比較少。上海市單細胞測序高通量測序產(chǎn)品

對于用RNA組織保存液寄送的樣品,請按照RNA組織保存液說明保存和寄送。請注意:1)樣品浸入組織保存液之前,對于動物組織樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊;對于植物樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒有蠟質保護層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存,有蠟質保護層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中,不讓其粘貼在管壁和蓋上。上海生工生物 高通量測序技術請寄送樣本(尤其是細胞樣本)之前鑒定樣本所屬物種。

KBSeq全質粒測序跟一代測序相比有什么優(yōu)點呢?一代測序:1.數(shù)據(jù)質量,套峰,雙峰等情況,需要人工分析校對。2.測序長度,1 kb。3.成本,低。4.樣本用量,100 ng。5.精確度,70-90%。6.測序能力,需要測序引物,只能測測序引物間的片段序列。7.通量低,(與讀長有關)。8.實驗周期,如果片段長度超過5K,測通可能需要15天左右。對于測序長度較長,如果我們用Sanger測序往往需要花費大量的時間,而我們KBSeq全質粒測序則只需要5-7天,就可以測通片段長度小于30kb以下的片段。KBSeq全質粒測序對于樣本的量,要求的也比較少,比如質粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl,如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的,KBSeq就更為適合了。

長鏈非編碼RNA(lncRNA)測序(只限有參考基因組物種),項目介紹:長鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉錄本長度大于200 nt且不編碼蛋白質的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內。哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉錄本是LncRNA(相應的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來研究表明,LncRNA參與了多種重要的調控過程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質修飾等。通過LncRNA測序,可以快速獲得與其生物學過程或者疾病相關的LncRNA的表達變化,從而促進LncRNA的深入研究。單細胞轉錄組測序指在單細胞水平上對 mRNA 進行高通量測序和分析的技術。

small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內調節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉錄后調控,從而調節(jié)細胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學過程。高通量測序技術可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質控后,進行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達 miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預測,靶基因GO、KEGG富集分析。RNA樣品建議用足量干冰運輸。16s高通量測序平臺

對于需要進行RNA抽提的部分特殊樣品,可以將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送。上海市單細胞測序高通量測序產(chǎn)品

土壤樣本請置于2 mL離心管里(多準備幾管備用),為保護樣本管,樣本管置于保護用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子;如常溫采的樣品,可以采用藍冰運輸;如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C,需要用足量干冰運輸; DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內或其他類似容器里,并旋緊蓋子;藍冰運輸;RNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內或其他類似容器里,并旋緊蓋子;用足量干冰運輸。 上海市單細胞測序高通量測序產(chǎn)品

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標簽: 高通量測序