上海地區(qū)ITS高通量測序產(chǎn)品

來源: 發(fā)布時間:2022-09-28

臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。

通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(細胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干凈,無雜質(zhì)碎片,無細胞團塊);臺盼藍場(細胞與臺盼藍染色后):主要可以觀察活性(主要為活細胞,未染色藍色的為活細胞);通過臺盼藍場計算活率:90%>80%;細胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來看,血球計數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標均符合上機標準,屬于高質(zhì)量單細胞懸液。 現(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。上海地區(qū)ITS高通量測序產(chǎn)品

真核/原核有參mRNA-Seq,項目介紹:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather,狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式,通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,是目前運用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后,mapping至參考基因組序列,對mapping到基因上的reads進行計數(shù),計算基因的表達量后,進行基因表達差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外,依據(jù)參考基因組,可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外,還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機理提供方向。全質(zhì)粒測序高通量測序NGS小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。

生工人線粒體基因組測序(多重擴增法),項目介紹:生工生物高通量測序部采用多重擴增技術(shù),對人線粒體基因組進行擴增捕獲,并進一步采用Illumina測序平臺進行高通量測序。該技術(shù)方案可以快速擴增到幾乎線粒體全長,并進行高深度測序,下游提供常規(guī)比對篩查突變等生物信息分析??蛻籼峁悠奉愋停?.人來源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測結(jié)果為準2.運輸條件:冰袋運輸。交付信息:1.測序原始數(shù)據(jù)交付實驗報告2.測序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。

RNA類高通量測序樣品要求:對于需要進行 RNA 抽提的樣品,請使用新鮮取樣的實驗材料,當場分成小塊(動物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時,而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。

生工高通量測序樣品要求,組織/細胞樣品:請使用新鮮取樣的實驗材料,當場分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時)寄送;于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種,對于可能致病的微生物,生工保留拒收的權(quán)利;對于需要進行RNA抽提的樣品,可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送,具體情況請先取得溝通。單細胞測序技術(shù)可以檢測復(fù)雜組織中單個細胞不同的生物學(xué)特性.上海市靶向捕獲高通量測序產(chǎn)品

請?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運輸,不超過3天。上海地區(qū)ITS高通量測序產(chǎn)品

對于用RNA組織保存液寄送的樣品,請按照RNA組織保存液說明保存和寄送。請注意:1)樣品浸入組織保存液之前,對于動物組織樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊;對于植物樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒有蠟質(zhì)保護層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存,有蠟質(zhì)保護層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中,不讓其粘貼在管壁和蓋上。上海地區(qū)ITS高通量測序產(chǎn)品

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標簽: 高通量測序