上海市16s高通量測(cè)序應(yīng)用

使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意：1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí)，可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層，則需要多次清洗，直至計(jì)數(shù)室潔凈無瑕；2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口***頭吹打混勻；3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù)，一般建議不要超過10分鐘；4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過多，難以數(shù)清，應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù)；5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù)，一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線，數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理，另兩邊不計(jì)數(shù)。10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。上海市16s高通量測(cè)序應(yīng)用

small RNA測(cè)序，項(xiàng)目簡(jiǎn)介：Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子，長度在18-30 nt之間，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默，參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化，以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過程。高通量測(cè)序技術(shù)可以對(duì)樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測(cè)序和表達(dá)定量，從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái)，測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后，進(jìn)行Clean reads 長度分布統(tǒng)計(jì)，small RNA注釋，已知 miRNA 注釋，已知piRNA注釋，ncRNA分析，新 miRNA 預(yù)測(cè)（有參考基因組），差異基因可視化分析，miRNA 家族分析，差異表達(dá) miRNA 聚類分析，miRNA靶基因預(yù)測(cè)，靶基因GO、KEGG富集分析。上海市微生物高通量測(cè)序應(yīng)用生工生物已開展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（scRNA-seq）服務(wù)，如果正好您有需要，那就快快來call我們吧！

AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過完整的細(xì)胞膜，嵌入所有細(xì)胞（活細(xì)胞和死細(xì)胞）的細(xì)胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過不完整的細(xì)胞膜，即死細(xì)胞的細(xì)胞膜，嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞，這種特異性染色的方法也可以排除無核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到：細(xì)胞濃度（總細(xì)胞，活細(xì)胞，死細(xì)胞）、細(xì)胞存活率（臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色）、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：RNA-Seq，是基于新一代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集，然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測(cè)序，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝，從而獲得一個(gè)個(gè)單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)而可以對(duì)該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對(duì)不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析，則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化，針對(duì)關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路（Pathway）的構(gòu)建。如果是水體樣品，建議采用濾膜過濾后，將濾膜寄送來生工。

微生物基因組重測(cè)序（有參）：目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序，精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測(cè)序（無參）：對(duì)于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說，要確定一個(gè)菌株是否是新菌株或者新菌種，較快捷的辦法就是，直接進(jìn)行基因組測(cè)序。利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)這些基因組進(jìn)行高深度測(cè)序，然后進(jìn)行基因組組裝，獲得基因組的框架圖或者精細(xì)圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進(jìn)化關(guān)系。組織材料樣品（提取RNA用）建議將標(biāo)簽用膠帶貼到管壁，干冰運(yùn)輸。上海市生工高通量測(cè)序

使用足量的干冰運(yùn)輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。上海市16s高通量測(cè)序應(yīng)用

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性，這可以極大的幫助我們進(jìn)一步了解細(xì)胞與細(xì)胞之間的差異。"這幾乎就像通過幾顆星星看到了整個(gè)宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細(xì)胞基因測(cè)序文章中的一幅結(jié)果圖，Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測(cè)技術(shù)組合，其中包括對(duì)數(shù)千個(gè)發(fā)育中的斑馬魚和青蛙胚胎單細(xì)胞測(cè)序，在胚胎發(fā)育建議初的24小時(shí)內(nèi)追蹤單個(gè)細(xì)胞的發(fā)育情況，可以揭示出胚胎細(xì)胞何時(shí)何地轉(zhuǎn)變?yōu)樾碌募?xì)胞狀態(tài)和類型并向我們展示了組織和整個(gè)機(jī)體從單細(xì)胞發(fā)育的完整歷程。上海市16s高通量測(cè)序應(yīng)用

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來、有夢(mèng)想有目標(biāo)，有組織有體系的公司，堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來的道路上大放光明，攜手共畫藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠的客戶粉絲源，也收獲了良好的用戶口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ)，也希望未來公司能成為行業(yè)的翹楚，努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息，斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將引領(lǐng)生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績(jī)，一直以來，公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠實(shí)守信的方針，員工精誠努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務(wù)來贏得市場(chǎng)，我們一直在路上！